| 中文摘要 | 第11-13页 |
| ABSTRACT | 第13-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第16-22页 |
| 1.1 果树单倍体产生的途径 | 第16-17页 |
| 1.1.1 自然发生 | 第16页 |
| 1.1.2 人工诱导 | 第16-17页 |
| 1.2 影响果树花药培养诱导胚状体形成的因素 | 第17-19页 |
| 1.2.1 基因型 | 第17页 |
| 1.2.2 取样时间 | 第17-18页 |
| 1.2.3 预处理 | 第18页 |
| 1.2.4 培养基 | 第18页 |
| 1.2.5 培养条件 | 第18-19页 |
| 1.3 胚状体形成的分子生化机制 | 第19页 |
| 1.4 果树育种中单倍体技术的应用 | 第19页 |
| 1.5 苹果单倍体育种研究进展 | 第19-20页 |
| 1.6 转录组测序技术概述 | 第20-21页 |
| 1.7 本实验的研究目的和意义 | 第21页 |
| 1.8 本研究技术路线 | 第21-22页 |
| 第二章 转录组测序与质量评估 | 第22-33页 |
| 2.1 材料与试剂 | 第22页 |
| 2.1.1 供试材料 | 第22页 |
| 2.1.2 实验试剂和实验仪器 | 第22页 |
| 2.2 实验方法 | 第22-25页 |
| 2.2.1 测序样品的选择 | 第22-23页 |
| 2.2.2 愈伤组织来源鉴定 | 第23页 |
| 2.2.3 RNA提取和质量检测 | 第23页 |
| 2.2.4 cDNA文库构建与转录组测序 | 第23-24页 |
| 2.2.5 测序质量控制 | 第24页 |
| 2.2.6 测序数据的产出分析 | 第24页 |
| 2.2.7 转录组测序数据与参考基因组的比对 | 第24页 |
| 2.2.8 转录组文库质量评估 | 第24-25页 |
| 2.3 结果与分析 | 第25-32页 |
| 2.3.1 愈伤组织的来源鉴定 | 第25页 |
| 2.3.2 测序质量值分布检查 | 第25-26页 |
| 2.3.3 碱基分布检查 | 第26-27页 |
| 2.3.4 测序数据的产出分析 | 第27页 |
| 2.3.5 转录组与参考基因组比对结果 | 第27-28页 |
| 2.3.6 转录组与参考基因组比对结果图 | 第28-29页 |
| 2.3.7 mRNA片段化随机性检验 | 第29-30页 |
| 2.3.8 插入片段长度检验 | 第30-31页 |
| 2.3.9 转录组测序数据饱和度检验 | 第31-32页 |
| 2.4 讨论 | 第32-33页 |
| 2.4.1 材料准备与方案设计 | 第32页 |
| 2.4.2 转录组测序优势 | 第32-33页 |
| 第三章 差异表达基因分析 | 第33-49页 |
| 3.1 实验方法 | 第33-34页 |
| 3.1.1 基因表达量计算 | 第33页 |
| 3.1.2 差异表达基因比较组的确定 | 第33页 |
| 3.1.3 基因差异表达分析 | 第33页 |
| 3.1.4 基因功能注释 | 第33-34页 |
| 3.1.5 关键差异表达基因的分析 | 第34页 |
| 3.2 结果与分析 | 第34-46页 |
| 3.2.1 样品基因表达量的总体分布 | 第34-35页 |
| 3.2.2 差异基因表达筛选 | 第35-38页 |
| 3.2.3 差异表达基因数目统计 | 第38-39页 |
| 3.2.4 差异表达基因功能注释 | 第39-45页 |
| 3.2.5 关键差异表达基因的筛选 | 第45-46页 |
| 3.3 讨论 | 第46-49页 |
| 3.3.1 糖类含量在对花药低温处理前期的变化 | 第46-47页 |
| 3.3.2 植物激素含量在花药低温处理前期的变化 | 第47-48页 |
| 3.3.3 糖类含量在胚状体和愈伤组织中的变化 | 第48页 |
| 3.3.4 植物激素含量在胚状体和愈伤组织中的变化 | 第48-49页 |
| 第四章 关键差异表达基因表达量的验证 | 第49-54页 |
| 4.1 试剂与仪器 | 第49页 |
| 4.1.1 试剂 | 第49页 |
| 4.1.2 仪器 | 第49页 |
| 4.2 实验方法 | 第49-50页 |
| 4.2.1 RNA的提取 | 第49页 |
| 4.2.2 引物设计 | 第49-50页 |
| 4.2.3 表达量的验证 | 第50页 |
| 4.3 实验结果 | 第50-53页 |
| 4.3.1 T01 vs T02、T01 vs T03、T01 vs T04组中差异表达基因的验证 | 第50-52页 |
| 4.3.2 T01 vs T04、T06 vs T05组中差异表达基因的验证 | 第52-53页 |
| 4.4 讨论 | 第53-54页 |
| 4.4.1 荧光定量PCR的优势 | 第53页 |
| 4.4.2 关键差异表达基因的验证 | 第53-54页 |
| 第五章 全文结论 | 第54-56页 |
| 参考文献 | 第56-63页 |
| 攻读学位期间取得的研究成果 | 第63-64页 |
| 致谢 | 第64-66页 |
| 个人简况及联系方式 | 第66-68页 |
