红树林土壤放线菌新种的发现及活性代谢产物研究
| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 本文所用到的缩略词 | 第8-15页 |
| 第一章 前言 | 第15-37页 |
| 1 放线菌和放线菌资源 | 第15-16页 |
| ·放线菌概述 | 第15页 |
| ·放线菌物种多样性 | 第15页 |
| ·放线菌代谢产物多样性 | 第15-16页 |
| ·放线菌资源的研究现状 | 第16页 |
| 2 极端环境中的放线菌研究进展 | 第16-34页 |
| ·极端环境放线菌新种的分离鉴定 | 第16-23页 |
| ·嗜酸放线菌 | 第16-17页 |
| ·嗜碱放线菌 | 第17-18页 |
| ·嗜盐放线菌 | 第18-19页 |
| ·嗜热放线菌 | 第19-20页 |
| ·嗜冷放线菌 | 第20-21页 |
| ·沙漠放线菌 | 第21-22页 |
| ·内生放线菌 | 第22-23页 |
| ·极端环境放线菌次级代谢产物多样性 | 第23-26页 |
| ·特殊环境（红树林）放线菌 | 第26-34页 |
| 3 活性菌株筛选 | 第34页 |
| 4 天然产物产量的提高 | 第34-35页 |
| 5 本研究的目的与意义 | 第35页 |
| 6 研究技术路线 | 第35-37页 |
| 第二章 红树林土壤放线菌的分离与新种鉴定 | 第37-84页 |
| 1 材料与方法 | 第37-60页 |
| ·实验材料 | 第37-43页 |
| ·红树林土壤样品 | 第37-38页 |
| ·培养基 | 第38-40页 |
| ·实验试剂 | 第40-41页 |
| ·实验仪器设备 | 第41-42页 |
| ·PCR引物 | 第42-43页 |
| ·分析软件 | 第43页 |
| ·实验方法 | 第43-47页 |
| ·样品预处理 | 第43-44页 |
| ·放线菌的分离 | 第44页 |
| ·菌株去重、初步鉴定与保藏 | 第44页 |
| ·菌株的 16S rRNA基因序列分析 | 第44-47页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第44页 |
| ·16S rRNA基因序列的扩增 | 第44页 |
| ·PCR产物的检测与及回收纯化 | 第44-45页 |
| ·连接反应 | 第45-46页 |
| ·连接产物的转化 | 第46-47页 |
| ·16S rRNA基因序列分析 | 第47页 |
| ·新种鉴定（多相分类） | 第47-60页 |
| ·形态特征和培养特征 | 第47-48页 |
| ·形态特征 | 第47页 |
| ·培养特征 | 第47-48页 |
| ·生理生化实验 | 第48-50页 |
| ·碳源利用实验 | 第48页 |
| ·氮源利用实验 | 第48页 |
| ·硝酸盐还原实验 | 第48-49页 |
| ·淀粉水解实验 | 第49页 |
| ·明胶液化实验 | 第49页 |
| ·七叶苷水解实验 | 第49页 |
| ·CMC（羧甲基纤维素）降解实验 | 第49页 |
| ·温度耐受实验 | 第49-50页 |
| ·pH耐受实验 | 第50页 |
| ·耐盐度测定 | 第50页 |
| ·触酶（H2O2酶）实验 | 第50页 |
| ·黑色素产生实验 | 第50页 |
| ·硫化氢产生实验 | 第50页 |
| ·牛奶凝固与胨化实验 | 第50页 |
| ·化学实验 | 第50-56页 |
| ·醌组份分析 | 第50-51页 |
| ·磷酸类脂分析 | 第51-53页 |
| ·全细胞糖分析 | 第53-54页 |
| ·细胞壁氨基酸分析 | 第54-55页 |
| ·全细胞脂肪酸组分检测 | 第55-56页 |
| ·分子实验 | 第56-60页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第56-57页 |
| ·（G+C）mol%的测定 | 第57页 |
| ·基因组DNA-DNA杂交 | 第57-60页 |
| 2 结果与分析 | 第60-83页 |
| ·菌株分离结果 | 第60-62页 |
| ·第一批次土壤样品分离结果 | 第60-61页 |
| ·第二批次土壤样品分离结果 | 第61-62页 |
| ·链霉菌HV38的多相分类鉴定 | 第62-83页 |
| ·模式菌株的选择 | 第62-63页 |
| ·形态和培养特征 | 第63-65页 |
| ·生理生化实验 | 第65-73页 |
| ·氮源利用实验 | 第65-66页 |
| ·碳源利用实验 | 第66-67页 |
| ·硝酸盐还原实验 | 第67页 |
| ·淀粉水解实验 | 第67-68页 |
| ·明胶液化实验 | 第68-69页 |
| ·七叶苷水解实验 | 第69页 |
| ·CMC（羧甲基纤维素）降解实验 | 第69-70页 |
| ·温度、pH和盐度耐受实验 | 第70-71页 |
| ·黑色素产生实验 | 第71页 |
| ·硫化氢产生实验 | 第71-72页 |
| ·牛奶凝固与胨化实验 | 第72-73页 |
| ·触酶（H2O2酶）实验 | 第73页 |
| ·化学实验 | 第73-77页 |
| ·醌组分分析 | 第73-74页 |
| ·磷酸类脂分析 | 第74-75页 |
| ·全细胞糖和氨基酸分析 | 第75-76页 |
| ·全细胞脂肪酸组份检测 | 第76-77页 |
| ·分子实验 | 第77-79页 |
| ·（G+C）mol%的测定 | 第77页 |
| ·DNA-DNA杂交实验 | 第77-79页 |
| ·菌株HV38的多相分类鉴定结果 | 第79-80页 |
| ·链霉菌HV38的描述 | 第80-83页 |
| 3 结论 | 第83-84页 |
| 第三章 放线菌的抗菌活性研究与候选菌株的筛选 | 第84-103页 |
| 1 材料 | 第84-85页 |
| ·放线菌样品 | 第84页 |
| ·培养基 | 第84-85页 |
| ·靶标菌株 | 第85页 |
| 2 方法 | 第85-86页 |
| ·菌株发酵液抑菌活性检测 | 第85-86页 |
| ·发酵培养 | 第85页 |
| ·靶标菌的培养 | 第85页 |
| ·抗菌活性检测 | 第85-86页 |
| ·抗菌活性结果评价 | 第86页 |
| ·活性菌株代谢产物检测 | 第86页 |
| ·发酵液的预处理 | 第86页 |
| ·HPLC检测（初筛） | 第86页 |
| ·发酵培养基优化 | 第86页 |
| 3 结果与分析 | 第86-101页 |
| ·菌株发酵液抑菌活性筛选结果 | 第86-87页 |
| ·活性菌株代谢产物检测 | 第87-101页 |
| ·初筛结果 | 第87-91页 |
| ·复筛结果 | 第91-92页 |
| ·优化实验结果 | 第92-101页 |
| ·培养基优化实验 | 第92-100页 |
| ·盐度优化实验 | 第100-101页 |
| ·pH优化实验 | 第101页 |
| 4 结论 | 第101-103页 |
| 第四章 菌株RCY534代谢产物的分离与鉴定 | 第103-122页 |
| 1 材料、仪器与试剂 | 第103-104页 |
| ·材料 | 第103页 |
| ·仪器 | 第103页 |
| ·试剂 | 第103-104页 |
| 2 方法 | 第104-107页 |
| ·大量发酵 | 第104页 |
| ·发酵条件 | 第104页 |
| ·发酵液的处理 | 第104页 |
| ·液相条件 | 第104页 |
| ·主体化合物的分离 | 第104-106页 |
| ·发酵液处理 | 第104-105页 |
| ·主体化合物的制备 | 第105-106页 |
| ·MS检测分析 | 第106页 |
| ·数据库检索 | 第106页 |
| ·其它化合物的分离（非主体） | 第106-107页 |
| ·TLC检测 | 第106页 |
| ·硅胶柱粗分 | 第106页 |
| ·化合物的制备 | 第106-107页 |
| 3 结果与分析 | 第107-121页 |
| ·主体化合物的分离 | 第108-116页 |
| ·HPLC检测 | 第108-109页 |
| ·MS分析 | 第109-110页 |
| ·数据库检索 | 第110页 |
| ·主体化合物结构解析 | 第110-116页 |
| ·化合物RCY-1 的结构鉴定 | 第111-113页 |
| ·化合物RCY-2 的结构鉴定 | 第113-115页 |
| ·化合物RCY-3 的结构鉴定 | 第115-116页 |
| ·其它化合物的分离（非主体） | 第116-121页 |
| ·TLC检测 | 第116-117页 |
| ·硅胶粗分 | 第117页 |
| ·化合物的制备 | 第117-120页 |
| ·Fra.2 的制备 | 第117-118页 |
| ·Fra.3 的制备 | 第118页 |
| ·Fra.4 的制备 | 第118-119页 |
| ·Fra.5-6 的制备 | 第119页 |
| ·Fra.7-8 的制备 | 第119-120页 |
| ·剩余组份的制备 | 第120页 |
| ·结构解析 | 第120-121页 |
| 4 结论 | 第121-122页 |
| 第五章 讨论 | 第122-125页 |
| 1 分离样品的选择 | 第122页 |
| 2 红树林土壤放线菌的分离 | 第122-123页 |
| 3 新种鉴定 | 第123页 |
| 4 活性菌株筛选 | 第123-124页 |
| 5 化合物分离 | 第124-125页 |
| 参考文献 | 第125-134页 |
| 附录 | 第134-152页 |
| 攻读硕士学位期间取得的科研成果 | 第152-153页 |
| 致谢 | 第153页 |
