我国华南地区大熊猫系统演化与遗传多样性的古DNA研究
| 作者简介 | 第1-8页 |
| 摘要 | 第8-12页 |
| ABSTRACT | 第12-20页 |
| 第一章 绪论 | 第20-31页 |
| §1.1 论文的选题的意义及目的 | 第20-21页 |
| §1.2 古DNA的研究进展与应用 | 第21-26页 |
| ·古DNA的研究进展 | 第21-22页 |
| ·古DNA的应用 | 第22-26页 |
| §1.3 古DNA研究中存在的问题 | 第26-31页 |
| ·古DNA的保存与降解 | 第26-27页 |
| ·污染的控制 | 第27-29页 |
| ·古DNA实验结果的可靠性 | 第29页 |
| ·核基因的拷贝与插入 | 第29-31页 |
| 第二章 大熊猫的分类与演化 | 第31-38页 |
| §2.1 大熊猫形态特征与生活环境概况 | 第31页 |
| §2.2 大熊猫种和亚种的划分 | 第31-34页 |
| ·大熊猫种与亚种的简介 | 第31-33页 |
| ·大熊猫种、亚种的主要鉴别特征 | 第33-34页 |
| §2.3 大熊猫地史分布及演化 | 第34-35页 |
| ·大熊猫的地史分布 | 第34页 |
| ·大熊猫的演化 | 第34-35页 |
| §2.4 大熊猫的系统分类 | 第35-36页 |
| §2.5 大熊猫研究中存在的问题 | 第36-38页 |
| 第三章 古DNA研究原理与方法 | 第38-43页 |
| §3.1 线粒体基因组结构与特点 | 第38-39页 |
| §3.2 古DNA实验原理与方法 | 第39-43页 |
| ·古DNA的提取 | 第39-40页 |
| ·PCR 扩增 | 第40-41页 |
| ·分子克隆 | 第41-42页 |
| ·序列测定 | 第42页 |
| ·系统发育分析 | 第42-43页 |
| 第四章 大熊猫古DNA实验 | 第43-65页 |
| §4.1 实验仪器及试剂 | 第43页 |
| ·主要仪器 | 第43页 |
| ·常用试剂 | 第43页 |
| §4.2 实验样品 | 第43-45页 |
| §4.3 实验步骤 | 第45-55页 |
| ·古DNA提取 | 第45页 |
| ·PCR扩增 | 第45-51页 |
| ·PCR产物的电泳检测 | 第51页 |
| ·PCR产物纯化 | 第51-52页 |
| ·分子克隆 | 第52-53页 |
| ·序列测定 | 第53页 |
| ·重复性实验 | 第53-55页 |
| §4.4 实验结果 | 第55-65页 |
| ·国内PCR实验电泳检测结果 | 第55-56页 |
| ·克隆实验电泳检测结果 | 第56-57页 |
| ·重复性实验电泳检测结果 | 第57-58页 |
| ·重复性实验获得序列的比对结果 | 第58-64页 |
| ·获得序列长度统计结果 | 第64-65页 |
| 第五章 序列分析 | 第65-86页 |
| §5.1 序列相似性查询 | 第65-66页 |
| §5.2 序列比对分析 | 第66-68页 |
| §5.3 12s rRNA基因全序列比对分析 | 第68-71页 |
| §5.4 Cytb基因全序列比对分析 | 第71-75页 |
| ·序列核苷酸组成 | 第71页 |
| ·核苷酸序列比对 | 第71-73页 |
| ·遗传距离 | 第73-74页 |
| ·饱和度分析 | 第74-75页 |
| §5.5 ND1基因部分序列比对分析 | 第75-78页 |
| ·序列核苷酸组成 | 第75页 |
| ·核苷酸序列比对 | 第75-77页 |
| ·遗传距离 | 第77-78页 |
| ·饱和度分析 | 第78页 |
| §5.6 D-loop部分序列比对分析 | 第78-81页 |
| ·序列核苷酸组成 | 第78-79页 |
| ·核苷酸序列比对 | 第79页 |
| ·核苷酸遗传距离 | 第79-81页 |
| ·饱和度分析 | 第81页 |
| §5.7 16s rRNA部分序列比对分析 | 第81-86页 |
| ·序列核苷酸组成 | 第81-82页 |
| ·核苷酸序列比对 | 第82-83页 |
| ·核苷酸遗传距离 | 第83页 |
| ·饱和度分析 | 第83-86页 |
| 第六章 系统发育分析 | 第86-111页 |
| §6.1 构建系统发育树 | 第86-105页 |
| ·物种单个体数据构建系统发育树 | 第86-92页 |
| ·物种双个体数据构建系统进化树 | 第92-97页 |
| ·系统发育分析 | 第97-99页 |
| ·分歧时间 | 第99-100页 |
| ·大熊猫分类地位 | 第100-101页 |
| ·遗传多样性分析 | 第101-105页 |
| §6.2 讨论 | 第105-111页 |
| ·样品的保存情况 | 第105-106页 |
| ·序列的可靠性分析 | 第106页 |
| ·构树结果的差异 | 第106-107页 |
| ·基因序列的变异 | 第107-108页 |
| ·大熊猫系统演化 | 第108-109页 |
| ·大熊猫的遗传多样性 | 第109-111页 |
| 第七章 结论与展望 | 第111-114页 |
| §7.1 结论 | 第111-113页 |
| §7.2 展望 | 第113-114页 |
| 致谢 | 第114-115页 |
| 参考文献 | 第115-127页 |
