GPCRs配体小分子的计算机模拟与药物设计
| 中文摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 引言 | 第10-12页 |
| 第一章 研究背景 | 第12-24页 |
| ·蛋白质的基本单元 | 第13-14页 |
| ·蛋白质的结构 | 第14-15页 |
| ·蛋白质的功能及其结构基础 | 第15-16页 |
| ·研究课题 | 第16-22页 |
| ·G 蛋白偶联受体及其信号转导 | 第16-20页 |
| ·鞘氨醇 1-磷酸-1 受体及其信号转导 | 第20-22页 |
| ·结语和展望 | 第22-24页 |
| 第二章 研究方法 | 第24-32页 |
| ·定量构效关系 | 第24-26页 |
| ·构建模型的描述符 | 第24-25页 |
| ·CoMFA 和 CoMSIA 原理 | 第25页 |
| ·构建模型的基本步骤 | 第25-26页 |
| ·分子对接 | 第26-27页 |
| ·Glide | 第26-27页 |
| ·分子对接步骤 | 第27页 |
| ·分子动力学模拟 | 第27-31页 |
| ·分子力场 | 第28-29页 |
| ·分子动力学模拟系综 | 第29页 |
| ·周期边界条件 | 第29-30页 |
| ·模拟的一般步骤 | 第30-31页 |
| ·本章小结 | 第31-32页 |
| 第三章 定量构效关系 | 第32-50页 |
| ·数据准备 | 第32-37页 |
| ·标准 CoMFA 模型及其等势图分析 | 第37-42页 |
| ·区域集中优化 CoMFA 模型及其等势图分析 | 第42-45页 |
| ·CoMSIA 模型及其等势图分析 | 第45-47页 |
| ·结论 | 第47-50页 |
| 第四章 分子对接 | 第50-58页 |
| ·数据准备 | 第50-52页 |
| ·分子对接分析 | 第52-57页 |
| ·结论 | 第57-58页 |
| 第五章 分子动力学 | 第58-66页 |
| ·数据准备 | 第58-59页 |
| ·分子动力学模拟结果分析 | 第59-65页 |
| ·结论 | 第65-66页 |
| 结束语 | 第66-67页 |
| 参考文献 | 第67-77页 |
| 攻读学位期间本人出版或公开发表的论著、论文 | 第77-78页 |
| 致谢 | 第78-79页 |
