| 中文摘要 | 第1-13页 |
| Abstract | 第13-20页 |
| 缩略词 | 第20-22页 |
| 第一章 文献综述 | 第22-56页 |
| ·植物细胞的全能性 | 第22-23页 |
| ·植物细胞全能性的提出及发展 | 第22-23页 |
| ·植物干细胞 | 第23-30页 |
| ·植物茎顶端分生组织(SAM)的组织学特征 | 第24页 |
| ·植物茎顶端分生组织(SAM)干细胞维持和分化的分子机制 | 第24-28页 |
| ·植物生根尖分生组织(RAM)的组织学特征 | 第28页 |
| ·植物根尖分生组织(RAM)的分子调控网络 | 第28-29页 |
| ·生长素和细胞分裂素对SAM和RAM中干细胞维持调控网络 | 第29-30页 |
| ·植物体外离体苗再生及途径 | 第30-37页 |
| ·拟南芥体外离体苗再生模型的建立 | 第31-33页 |
| ·拟南芥根外植体诱导的离体苗再生体系 | 第31-32页 |
| ·拟南芥液体诱导的离体苗再生体系 | 第32-33页 |
| ·生长素和细胞分裂素在拟南芥体外离体苗再生过程中的作用 | 第33-36页 |
| ·生长素对拟南芥离体苗再生的影响 | 第34页 |
| ·细胞分裂素对拟南芥离体苗再生的影响 | 第34-36页 |
| ·离体苗再生相关基因的鉴定 | 第36-37页 |
| ·表观遗传调控 | 第37-54页 |
| ·表观遗传学的提出及研究内容 | 第38页 |
| ·DNA甲基化 | 第38-42页 |
| ·DNA甲基化与DNA甲基转移酶 | 第39-40页 |
| ·植物DNA甲基化的特征 | 第40-41页 |
| ·DNA甲基化调节基因表达的可能机制 | 第41-42页 |
| ·组蛋白修饰 | 第42-45页 |
| ·组蛋白甲基化与去甲基化 | 第42-44页 |
| ·组蛋白的乙酰化及去乙酰化 | 第44-45页 |
| ·DNA甲基化与组蛋白修饰之间在调控基因表达过程中的相互作用关系 | 第45-47页 |
| ·表观遗传修饰对植物的发育调控 | 第47-52页 |
| ·表观遗传修饰对植物SAM干细胞维持及分化的调控 | 第47-49页 |
| ·表观遗传修饰对植物RAM十细胞维持及分化的调控 | 第49-50页 |
| ·表观遗传修饰对植物胁迫响应的调控 | 第50-52页 |
| ·表观遗传学主要研究方法 | 第52-54页 |
| ·研究目的和立题意义 | 第54-56页 |
| 第二章 启动子DNA甲基化在调控拟南芥离体苗再生中的作用研究 | 第56-125页 |
| 前言 | 第56页 |
| ·实验材料 | 第56-61页 |
| ·实验方法 | 第61-84页 |
| ·结果与分析 | 第84-121页 |
| ·受DNA甲基化调控且参与离体苗再生的候选基因发掘 | 第84-90页 |
| ·拟南芥胚性与非胚性愈伤组织的获得 | 第84-85页 |
| ·植株再生相关基因在RC和NRC中的表达差异分析 | 第85页 |
| ·RC和NRC的基因表达谱建立及基因表达差异比较分析 | 第85-86页 |
| ·RC及NRC中差异表达基因的筛选 | 第86-87页 |
| ·芯片结果验证 | 第87-88页 |
| ·RC及NRC中差异表达基因生物功能注释(GO)分析及离体苗再生候选基因筛选 | 第88-90页 |
| ·DNA甲基化候选基因的筛选 | 第90-96页 |
| ·候选基因在DNA甲基转移酶突变体中表达分析 | 第90-92页 |
| ·候选基因在RC及NRC中的DNA甲基化位点分析 | 第92-94页 |
| ·候选基因在RC及NRC中的甲基化水平分析 | 第94-95页 |
| ·候选基因在RC及NRC中的甲基化模式分析 | 第95-96页 |
| ·候选基因在RC和NRC中的DNA甲基化与表达的关系分析 | 第96-97页 |
| ·候选基因的DNA受不同甲基转移酶调控 | 第97-100页 |
| ·候选基因在DNA甲基转移酶突变体中甲基化水平分析 | 第98-100页 |
| ·候选基因在DNA甲基转移酶敲除系培养物中的表达与甲基化关系 | 第100页 |
| ·候选基因的组蛋白修饰及其与甲基化关系分析 | 第100-101页 |
| ·候选基因突变体离体苗再生能力鉴定 | 第101-106页 |
| ·ACC1、MAX3、TFL1、At2g055520的功能缺失不影响离体苗再生能力 #952.3.6.2 SRF去甲基化上调表达抑制拟南芥离体苗再生 | 第102-103页 |
| ·去甲基化上调表达抑制拟南芥离体苗再生 | 第103-106页 |
| ·SRF调控离体苗再生能力的可能机制 | 第106-115页 |
| ·离体苗再生相关基因在Col-0、srf-1和srf-2中的表达模式 | 第106-107页 |
| ·与SRF直接结合的下游候选基因的发掘 | 第107-110页 |
| ·SRF与下游靶基因结合位点的定位分析 | 第110-112页 |
| ·ChIP-Sequencing分析 | 第112-115页 |
| ·SRF可能通过降低WOX9和间接WUS表达而抑制离体苗再生 | 第115-118页 |
| ·非胚性愈伤组织(NRC)再生能力的部分恢复 | 第118-121页 |
| ·SRF及其下游靶基因在RC和NRC中的表达分析 | 第118页 |
| ·非胚性愈伤组织(NRC)再生能力的部分恢复 | 第118-121页 |
| ·讨论 | 第121-125页 |
| 第三章 动态表观遗传修饰对大豆盐胁迫响应转录因子表达的影响 | 第125-157页 |
| ·实验材料 | 第125-126页 |
| ·实验方法 | 第126-127页 |
| ·结果与分析 | 第127-153页 |
| ·大豆盐诱导转录因子基因的筛选 | 第127-131页 |
| ·候选基因在大豆盐及非盐处理过程中的表达分析 | 第131-133页 |
| ·受DNA甲基化调控的候选转录因子基因的筛选 | 第133-134页 |
| ·候选基因在盐及5-ADC处理不同时间的大豆中表达差异qRT-PCR分析 | 第134-136页 |
| ·候选基因在盐胁迫处理过程中的甲基化状态分析 | 第136-144页 |
| ·DNA经亚硫酸氢钠处理后的未甲基化的C转变成T的效率检测 | 第136-137页 |
| ·候选基因在NaCl处理过程中的甲基化位点分析 | 第137-138页 |
| ·候选基因在NaCl处理过程中的甲基化水平分析 | 第138-140页 |
| ·DNA甲基化基因在对照及NaCl处理过程中的甲基化模式分析 | 第140-141页 |
| ·候选基因在NaCl处理下DNA甲基化状态Southern blot验证 | 第141-144页 |
| ·候选基因在5-ADC处理过程中的甲基化状态分析 | 第144-147页 |
| ·候选基因在5-ADC处理过程中的甲基化位点测序分析 | 第144-146页 |
| ·候选基因在5-ADC处理过程中的DNA甲基化状态的Southern blot验证 | 第146-147页 |
| ·候选基因在对照及NaCl处理过程中组蛋白修饰状态分析 | 第147-153页 |
| ·候选基因检测区的确定及ChIP-PCR引物设计 | 第147-148页 |
| ·组蛋白修饰状态分析 | 第148-153页 |
| ·讨论 | 第153-157页 |
| 论文创新点 | 第157-158页 |
| 参考文献 | 第158-178页 |
| 附图1-6 | 第178-199页 |
| 附表1 | 第199-209页 |
| 研究生期间发表的论文情况 | 第209-210页 |
| 致谢 | 第210-211页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第211页 |
