| 中文摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 1 前言 | 第11-22页 |
| ·QTL 的概念 | 第11-12页 |
| ·QTL 定位的概念和意义 | 第12页 |
| ·QTL 定位的方法 | 第12-13页 |
| ·候选基因法（candidate gene approach） | 第13页 |
| ·标记-QTL 连锁分析（marker-QTL linkage analysis） | 第13页 |
| ·QTL 定位的群体 | 第13-15页 |
| ·近交群体 | 第14页 |
| ·远交群体 | 第14页 |
| ·选择性基因型测定 | 第14-15页 |
| ·QTL 定位统计分析方法 | 第15-16页 |
| ·QTL 精细定位 | 第16-18页 |
| ·连锁分析精细定位 QTL 的策略 | 第16-17页 |
| ·利用连锁不平衡精细定位 QTL 的方法 | 第17-18页 |
| ·全基因组 SNP 标记的应用 | 第18-21页 |
| ·利用全基因 SNP 标记进行 QTL 定位 | 第19页 |
| ·基因组关联研究 | 第19-21页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第21-22页 |
| 2 材料和方法 | 第22-32页 |
| ·群体模拟 | 第22-25页 |
| ·群体系谱 | 第22页 |
| ·基因组 | 第22-23页 |
| ·表型模拟 | 第23页 |
| ·模拟的主要结果 | 第23-25页 |
| ·影响 QTL 定位结果因素的研究 | 第25-26页 |
| ·群体规模 | 第25页 |
| ·遗传力 | 第25-26页 |
| ·模型和分析方法 | 第26-28页 |
| ·简单回归（加性效应）模型 | 第26页 |
| ·分析方法 | 第26-28页 |
| ·判断标准 | 第28-29页 |
| ·判断 SNP 与性状关联显著性的标准 | 第28页 |
| ·定位 QTL 的标准 | 第28-29页 |
| ·QTL 判定区间的 LD 分析 | 第29-32页 |
| ·LD 水平的衡量 | 第29-30页 |
| ·LD 区间判定法 | 第30-32页 |
| 3 结果与分析 | 第32-48页 |
| ·基因组关联分析的结果 | 第32页 |
| ·ECM 算法估计的结果 | 第32-37页 |
| ·组合方法的 QTL 定位结果 | 第37-40页 |
| ·Combined I 定位 QTL 的结果 | 第37-39页 |
| ·Combined II 定位 QTL 的结果 | 第39-40页 |
| ·影响 QTL 定位的因素的研究 | 第40-44页 |
| ·不同群体大小下的 QTL 定位结果 | 第40-42页 |
| ·不同遗传力下 QTL 定位的效果 | 第42-44页 |
| ·LD 区间判断法定位 QTL 效果 | 第44-48页 |
| 4 讨论 | 第48-52页 |
| ·分析模型对关联分析结果的影响 | 第48页 |
| ·两过程分析的试验设计 | 第48-49页 |
| ·群体规模对 QTL 定位分析结果的影响 | 第49-50页 |
| ·遗传力对 QTL 定位分析结果的影响 | 第50页 |
| ·QTL 定位分析方法的比较 | 第50-52页 |
| 5 结论 | 第52-53页 |
| 6 参考文献 | 第53-60页 |
| 7 致谢 | 第60-61页 |
| 8 攻读学位期间获得的成果 | 第61页 |