| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-13页 |
| 第一章 绪论 | 第13-21页 |
| ·引言 | 第13页 |
| ·研究背景 | 第13-16页 |
| ·进化理论主要流派 | 第14-15页 |
| ·自然选择作用 | 第15页 |
| ·分子水平检测选择作用 | 第15-16页 |
| ·研究现状 | 第16-18页 |
| ·本文的研究内容和安排 | 第18-21页 |
| ·主要研究内容 | 第18-19页 |
| ·主要创新工作 | 第19页 |
| ·论文主要结构 | 第19-21页 |
| 第二章 轮状病毒概述 | 第21-30页 |
| ·轮状病毒流行概况 | 第21-22页 |
| ·轮状病毒对人类的危害 | 第21页 |
| ·轮状病毒对畜牧业的危害 | 第21-22页 |
| ·病原简介 | 第22-26页 |
| ·轮状病毒结构特征 | 第22-23页 |
| ·病毒蛋白分类 | 第23页 |
| ·病毒核蛋白功能 | 第23-24页 |
| ·病毒结构蛋白功能 | 第24-25页 |
| ·轮状病毒非结构蛋白功能 | 第25页 |
| ·病毒理化性质 | 第25-26页 |
| ·流行病学 | 第26-27页 |
| ·一般流行病学 | 第26页 |
| ·血清流行病学 | 第26-27页 |
| ·腹泻机制研究 | 第27-28页 |
| ·肠道内腹泻机制 | 第27页 |
| ·肠道外腹泻机制 | 第27-28页 |
| ·治疗与预防 | 第28页 |
| ·治疗现状 | 第28页 |
| ·预防 | 第28页 |
| ·疫苗研制 | 第28-29页 |
| ·疫苗研制的必要性 | 第28-29页 |
| ·疫苗研制现状 | 第29页 |
| ·本章小结 | 第29-30页 |
| 第三章 基于密码子的适应性进化 | 第30-40页 |
| ·基因重复和适应性进化 | 第30页 |
| ·最大似然法 | 第30-33页 |
| ·最大似然法和似然比检验 | 第30-31页 |
| ·密码子替代模型 | 第31-32页 |
| ·分支间可变选择压力模型的似然比检验 | 第32页 |
| ·位点间可变选择压力模型的似然比检验 | 第32-33页 |
| ·分支——位点间可变选择压力模型的似然比检验 | 第33页 |
| ·贝叶斯推论 | 第33-35页 |
| ·贝叶斯定理 | 第33-34页 |
| ·Markov 链概念介绍 | 第34-35页 |
| ·PAML 软件 | 第35-37页 |
| ·软件基本介绍 | 第35-36页 |
| ·分支间可变选择压力模型的参数设置 | 第36页 |
| ·位点间可变选择压力模型的参数设置 | 第36-37页 |
| ·分支——位点间可变选择压力模型的参数设置 | 第37页 |
| ·Suzuki-Gojobori 方法检测正选择 | 第37-39页 |
| ·Suzuki-Gojobori 方法原理 | 第37-38页 |
| ·Suzuki-Gojobori 方法软件 | 第38-39页 |
| ·本章小结 | 第39-40页 |
| 第四章 中国区人轮状病毒VP7、NSP4 适应性进化研究 | 第40-55页 |
| ·材料与方法 | 第40-44页 |
| ·序列数据 | 第40-42页 |
| ·数据处理及系统进化树构建 | 第42-43页 |
| ·进化分析、正选择位点确定 | 第43-44页 |
| ·实验结果 | 第44-45页 |
| ·VP7 编码序列位点上的选择压力检测 | 第44页 |
| ·NSP4 编码序列位点上的选择压力检测 | 第44-45页 |
| ·讨论 | 第45-47页 |
| ·结论 | 第47页 |
| ·应用Suzuki-Gojobori 法检测适应性进化 | 第47-54页 |
| ·数据 | 第47页 |
| ·方法 | 第47-48页 |
| ·结果 | 第48-53页 |
| ·讨论 | 第53-54页 |
| ·本章小结 | 第54-55页 |
| 第五章 不同物种轮状病毒适应性进化分析 | 第55-65页 |
| ·材料与方法 | 第55-58页 |
| ·序列数据 | 第55-56页 |
| ·系统进化树构建 | 第56-57页 |
| ·不同种系间可变选择压力 | 第57页 |
| ·不同氨基酸位点间可变选择压力 | 第57-58页 |
| ·结果 | 第58-60页 |
| ·不同种系中可变选择压力 | 第58-59页 |
| ·位点间可变ω比率及正选择位点的识别 | 第59-60页 |
| ·讨论 | 第60-64页 |
| ·本章小结 | 第64-65页 |
| 第六章总结与展望 | 第65-68页 |
| ·本文工作总结 | 第65-66页 |
| ·对今后工作的展望 | 第66-68页 |
| 参考文献 | 第68-75页 |
| 致谢 | 第75-76页 |
| 在学期间的研究成果及发表的学术论文 | 第76页 |