| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-10页 |
| 第一章 计算机辅助药物设计概论 | 第10-18页 |
| ·引言 | 第10-11页 |
| ·药物作用的基本理论 | 第11-14页 |
| ·受体学说及药物受体相互作用的方式和本质 | 第12-14页 |
| ·占领学说 | 第13页 |
| ·亲和力和内在活性学说 | 第13页 |
| ·诱导契合学说(INDUCED-FIT THEORY) | 第13-14页 |
| ·二态模型的占领-活化学说 | 第14页 |
| ·其他学说 | 第14页 |
| ·药物先导化合物的发现 | 第14-17页 |
| 参考文献 | 第17-18页 |
| 第二章 理论计算方法,相应软件以及数据库简介 | 第18-39页 |
| ·蛋白质结构预测 | 第18-24页 |
| ·蛋白质结构预测方法 | 第18-19页 |
| ·同源模建法 | 第19-20页 |
| ·蛋白质序列的相似性 | 第20-21页 |
| ·构建模型 | 第21-24页 |
| ·结构建模工具MODELLER软件包 | 第21-23页 |
| ·MODELLER软件包的概述 | 第21-22页 |
| ·MODELLER的输入文件格式 | 第22页 |
| ·MODELLER的运行与输出 | 第22-23页 |
| ·结构合理性评估 | 第23页 |
| ·SWISS-PROT蛋白序列数据库 | 第23页 |
| ·蛋白质数据库 | 第23-24页 |
| ·分子对接 | 第24-29页 |
| ·分子对接的原理 | 第24-25页 |
| ·分子对接方法 | 第25页 |
| ·分子接中常用的模拟方法 | 第25-27页 |
| ·分子动力学模拟方法 | 第25-26页 |
| ·蒙特卡洛方法 | 第26页 |
| ·模拟退火技术 | 第26-27页 |
| ·遗传算法 | 第27页 |
| ·分子对接的步骤 | 第27-29页 |
| ·量子化学 | 第29页 |
| ·分子力学 | 第29-32页 |
| ·分子动力学 | 第32-37页 |
| ·分子动力学软件GROMACS的介绍 | 第33-37页 |
| ·初始化 | 第35-37页 |
| 参考文献 | 第37-39页 |
| 第三章 神经介素B受体与激动剂和拮抗剂的分子模拟研究 | 第39-54页 |
| ·引言 | 第39-40页 |
| ·材料与计算方法 | 第40-41页 |
| ·同源模型的建立以及评估 | 第40页 |
| ·分子动力学模拟 | 第40-41页 |
| ·分子对接 | 第41页 |
| ·结果与讨论 | 第41-51页 |
| ·序列比对,同源模建 | 第41-43页 |
| ·结合口袋以及分子对接结果分析 | 第43-45页 |
| ·配体受体作用机制的探讨 | 第45-51页 |
| ·配体-受体的相互作用 | 第45-48页 |
| ·螺旋区的变化 | 第48-51页 |
| ·结论 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-54页 |
| 第四章 ARCGIS9.0在苯丙酮尿症空间分析中的应用 | 第54-64页 |
| ·引言 | 第54-57页 |
| ·对象与方法 | 第57-61页 |
| ·对象 | 第57-59页 |
| ·方法 | 第59-61页 |
| ·克里格插值 | 第59-60页 |
| ·空间探索分析 | 第60-61页 |
| ·结果 | 第61-62页 |
| ·半方差图 | 第61-62页 |
| ·趋势面分析 | 第62页 |
| ·等值线图 | 第62页 |
| ·讨论 | 第62-63页 |
| 参考文献 | 第63-64页 |
| 致谢 | 第64页 |
