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人类生精细胞凋亡相关新基因TSARG6与AR关系的初步研究

中文摘要第1-7页
英文摘要第7-9页
目录第9-13页
缩写词中英文对照简表第13-14页
实验技术路线图第14-15页
前言第15-17页
第一章 TSARG6基因突变检测第17-41页
 1.对象、材料与方法第17-23页
   ·对象第17页
   ·材料第17-18页
     ·标本第17页
     ·分子量标准第17页
     ·主要试剂第17-18页
     ·仪器设备第18页
   ·方法第18-23页
     ·外周血、脐血gDNA抽提第18-19页
     ·PCR扩增第19-21页
       ·引物第19-20页
       ·PCR扩增体系及条件第20-21页
     ·PCR产物检测第21页
     ·限制性内切酶酶切结果检测第21-22页
     ·DHPLC检测第22页
     ·DNA测序第22页
     ·限制性内切酶检测第22-23页
 2 结果第23-35页
   ·PCR扩增结果第23页
   ·DHPLC结果第23页
   ·测序结果第23-28页
     ·TSARG6基因第2外显子测序结果第23-27页
     ·TSARG6基因第8外显子测序结果第27-28页
   ·利用DHPLC在正常人和少弱精患者中大量筛查TSARG6第2号外显子第28-29页
   ·测序结果第29-30页
   ·更改实验条件重新进行DHPLC检测第30-32页
     ·重新设计引物TS2a和TS2b第30页
     ·更改DHPLC检测条件第30-32页
       ·更改DHPLC检测温度第30-31页
       ·更改B液梯度第31页
       ·将PCR产物变性第31-32页
     ·重新设计引物TS2c第32页
   ·限制性内切酶酶切第32-33页
     ·分析TSARG6的第2外显子第32-33页
     ·分析TSARG6的第8外显子第33页
   ·限制性内切酶酶切结果第33-34页
     ·限制性内切酶HpyF10VI酶切分析第33-34页
     ·限制性内切酶TseI酶切分析第34页
   ·A患者的TSARG6第2外显子错义突变T38C遗传自其父亲第34-35页
 3 讨论第35-41页
   ·变性高效液相色谱分析第36-38页
   ·限制性内切酶酶切第38-41页
第二章 TSARG6编码蛋白质和突变蛋白质的生物信息学分析第41-91页
 1 方法第41-44页
 2 结果第44-81页
   ·蛋白质的物理化学性质分析第44-53页
     ·酶切位点分析第45页
     ·蛋白质在与特定蛋白酶或化学试剂作用下的内切产物第45-47页
     ·蛋白质序列统计分析第47-53页
   ·蛋白质的一级结构分析第53-58页
     ·卷曲螺旋第53页
     ·蛋白质基序分析第53-58页
       ·蛋白质基序分析第53-55页
       ·真核生物蛋白质功能位点的线形基序第55-58页
   ·蛋白质的二级结构分析第58-64页
     ·RCSB—PDB网站分析第58页
     ·PredictProtein预测二级结构第58-64页
   ·蛋白质的三级结构分析第64-69页
     ·蛋白质的无序区域第64-65页
     ·蛋白质的无序,有序和球形结构域第65页
     ·蛋白质三级结构预测第65-69页
   ·蛋白质拓扑学结构预测第69-73页
     ·跨膜区分析第69-70页
     ·亚细胞定位第70页
     ·蛋白细胞内定位预测第70页
     ·蛋白质的抗原决定簇预测第70-72页
     ·蛋白质的活性位点预测第72-73页
   ·蛋白质翻译后修饰预测第73-75页
     ·豆蔻酰化位点和前导序列第73页
     ·O—β—N一乙酰葡萄糖胺附着位点第73页
     ·糖基磷脂酰肌醇修饰位点第73页
     ·N—末端修饰情况第73页
     ·ProtFun 2.2综合分析第73-75页
   ·蛋白质功能方面分析第75-80页
     ·蛋白质链上残基之间距离接触可能性分析第75-76页
     ·蛋白质相互作用第76-77页
     ·蛋白质功能预测第77-78页
       ·protein function predictin第77-78页
       ·Phyre第78页
     ·组织特异性表达和氨基酸的位点阵表达第78-79页
     ·蛋白质点突变的稳定性预测第79-80页
   ·蛋白质生物磁共振数据分析第80-81页
 3 讨论第81-91页
   ·系统生物学第81页
   ·TSARG6与HSP70第81-83页
   ·TSARG6与雄激素受体第83-86页
   ·生物信息学分析第86-89页
   ·下一步工作第89-91页
5 结论第91-92页
6 参考文献第92-98页
7 综述第98-110页
8 致谢第110-111页
9 个人简历第111页

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