RNA二级结构预测的快速计算
| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 1 绪论 | 第10-13页 |
| 2 RNA二级结构预测的能量模型 | 第13-25页 |
| ·环 | 第13-14页 |
| ·最临近能量模型 | 第14-23页 |
| ·一环 | 第15-17页 |
| ·二环 | 第17-21页 |
| ·多分枝环和外环 | 第21-23页 |
| ·假结简介 | 第23-25页 |
| 3 Mfold算法及其改进 | 第25-33页 |
| ·动态规划 | 第25页 |
| ·Mfold算法 | 第25-29页 |
| ·数据结构 | 第26页 |
| ·算法 | 第26-29页 |
| ·Mfold算法改进 | 第29-31页 |
| ·二级结构计算 | 第31-33页 |
| 4 次优折叠 | 第33-37页 |
| ·原理 | 第33-35页 |
| ·次优二级结构计算 | 第35-37页 |
| 5 简单假结二级结构计算方法 | 第37-39页 |
| ·简单假结算法 | 第37-38页 |
| ·算法改进 | 第38-39页 |
| 6 算法实现与计算结果比较 | 第39-75页 |
| ·软件实现 | 第39-40页 |
| ·平台与开发原则 | 第39-40页 |
| ·文档结构与工具集 | 第40页 |
| ·最优结构计算举例 | 第40-45页 |
| ·次优结构计算举例 | 第45-48页 |
| ·简单假结结构计算举例 | 第48-50页 |
| ·改进前 | 第48-49页 |
| ·改进后 | 第49-50页 |
| ·比较分析 | 第50-75页 |
| 结束语 | 第75-76页 |
| 参考文献 | 第76-79页 |
| 致谢 | 第79-80页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第80-81页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第81页 |
