| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 1 绪论 | 第10-23页 |
| ·生物信息数据分析 | 第11-14页 |
| ·生物医学文献挖掘与知识发现 | 第14-19页 |
| ·生物医学文献挖掘的典型应用 | 第19-21页 |
| ·研究意义与论文结构 | 第21-23页 |
| 2 基于文献挖掘的实体识别 | 第23-45页 |
| ·实体识别方法概述 | 第23-25页 |
| ·基于统计的基因实体识别 | 第25-34页 |
| ·基因/蛋白质到Entrez Gene 数据库的映射 | 第34-39页 |
| ·基于词典的疾病与化合物实体识别 | 第39-44页 |
| ·小结 | 第44-45页 |
| 3 基于文献挖掘的实体关联性分析 | 第45-67页 |
| ·引言 | 第46-47页 |
| ·关联实体的共出现频率分析 | 第47-52页 |
| ·实体关联规则库的制备 | 第52-55页 |
| ·实体关联模式的提取 | 第55-61页 |
| ·实体关联分析 | 第61-65页 |
| ·小结 | 第65-67页 |
| 4 实体关联的网络分析 | 第67-84页 |
| ·图的拓扑性质 | 第67-69页 |
| ·实体关联网络的构建与性质 | 第69-73页 |
| ·基于实体关联网络的知识推理 | 第73-80页 |
| ·有向实体关联网络分析 | 第80-82页 |
| ·小结 | 第82-84页 |
| 5 基于文献挖掘的生物医学知识发现平台的实现 | 第84-97页 |
| ·平台架构与功能 | 第84-87页 |
| ·平台实现 | 第87-92页 |
| ·平台部署与应用 | 第92-96页 |
| ·小结 | 第96-97页 |
| 6 结论与展望 | 第97-100页 |
| ·主要成果与结论 | 第97-98页 |
| ·主要创新 | 第98-99页 |
| ·研究展望 | 第99-100页 |
| 致谢 | 第100-102页 |
| 参考文献 | 第102-111页 |
| 附录1 攻读博士学位期间所发表的学术论文 | 第111页 |