改进免疫算法在生物序列比对中的应用研究
| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 第1章 绪论 | 第10-20页 |
| ·生物信息学 | 第10-12页 |
| ·生物信息学的研究现状 | 第12-17页 |
| ·生物信息学的生物学内涵 | 第12-14页 |
| ·生物信息学的信息学内涵 | 第14-17页 |
| ·本论文的研究目的和研究内容 | 第17-20页 |
| ·本文的研究目的 | 第17-18页 |
| ·本文的研究内容 | 第18-20页 |
| 第2章 生物序列比对基础 | 第20-35页 |
| ·生物学背景知识 | 第20-22页 |
| ·核酸和蛋白质 | 第20-21页 |
| ·分子生物学中心法则 | 第21-22页 |
| ·生物序列比对的基本问题 | 第22-34页 |
| ·序列比对的目的 | 第22-23页 |
| ·序列比对问题的描述 | 第23-25页 |
| ·序列比对的分类 | 第25-27页 |
| ·空位罚分 | 第27-28页 |
| ·替换矩阵 | 第28-33页 |
| ·多序列比对分值的计算方法 | 第33-34页 |
| ·本章小结 | 第34-35页 |
| 第3章 生物序列比对算法 | 第35-56页 |
| ·经典序列比对算法 | 第35-41页 |
| ·研究现状 | 第35-36页 |
| ·动态规划算法 | 第36-40页 |
| ·CLUSTALW 算法 | 第40-41页 |
| ·智能化算法 | 第41-47页 |
| ·智能化算法的数学描述 | 第41-42页 |
| ·程式化算法 | 第42-44页 |
| ·评价智能化算法的数学框架 | 第44-47页 |
| ·智能化算法在序列比对中的应用 | 第47-54页 |
| ·隐马氏模型 | 第47-52页 |
| ·模拟退火算法 | 第52页 |
| ·遗传算法 | 第52-54页 |
| ·本文提出的算法 | 第54页 |
| ·本章小结 | 第54-56页 |
| 第4章 人工免疫算法研究 | 第56-64页 |
| ·生物免疫系统内涵 | 第56-57页 |
| ·人工免疫系统的发展历史与概况 | 第57-58页 |
| ·人工免疫系统的研究内容和范围 | 第58-60页 |
| ·免疫计算智能系统 | 第58-59页 |
| ·免疫工程应用研究 | 第59-60页 |
| ·人工免疫系统理论研究 | 第60页 |
| ·人工免疫系统的优点 | 第60-61页 |
| ·人工免疫算法的基本步骤 | 第61-63页 |
| ·免疫优化算法的研究现状 | 第63页 |
| ·本章小结 | 第63-64页 |
| 第5章 改进免疫算法在DNA 序列比对中的应用 | 第64-71页 |
| ·改进的免疫算法和应用 | 第64-68页 |
| ·多样性和亲和性 | 第64-65页 |
| ·改进算法的流程 | 第65-66页 |
| ·编码问题 | 第66-67页 |
| ·免疫算子的应用 | 第67-68页 |
| ·算法的实现 | 第68-70页 |
| ·实验环境 | 第68-69页 |
| ·实验结果及分析 | 第69-70页 |
| ·本章小结 | 第70-71页 |
| 结论 | 第71-72页 |
| 参考文献 | 第72-77页 |
| 攻读硕士学位期间承担的科研任务与主要成果 | 第77-78页 |
| 致谢 | 第78-79页 |
| 作者简介 | 第79页 |
