| 摘要 | 第1-11页 |
| ABSTRACT | 第11-13页 |
| 第一章 绪论 | 第13-27页 |
| ·引言 | 第13-15页 |
| ·研究背景 | 第15-21页 |
| ·生物信号识别的相关研究 | 第15-17页 |
| ·模体发现的相关研究 | 第17-18页 |
| ·选择性剪接的相关研究 | 第18-21页 |
| ·论文的主要工作与创新 | 第21-24页 |
| ·论文的结构 | 第24-27页 |
| 第二章 基因的剪接和选择性剪接 | 第27-37页 |
| ·引言 | 第27页 |
| ·基因简介 | 第27-28页 |
| ·基因的结构和表达 | 第28-31页 |
| ·基因的结构 | 第28-29页 |
| ·基因的表达 | 第29-31页 |
| ·剪接和选择性剪接 | 第31-36页 |
| ·RNA 剪接 | 第31-34页 |
| ·选择性剪接 | 第34-36页 |
| ·小结 | 第36-37页 |
| 第三章 基因编码区剪接位点识别 | 第37-59页 |
| ·概述 | 第37页 |
| ·隐Markov 模型的基本理论 | 第37-45页 |
| ·隐Markov 模型的定义 | 第37-39页 |
| ·隐Markov 模型的基本算法 | 第39-44页 |
| ·隐Markov 模型算法的标定 | 第44-45页 |
| ·隐Markov 模型在基因编码区剪接位点识别中的应用 | 第45-58页 |
| ·数据准备 | 第45页 |
| ·识别的评价指标 | 第45-46页 |
| ·模型 | 第46-55页 |
| ·测试与讨论 | 第55-58页 |
| ·小结 | 第58-59页 |
| 第四章 基于SVM 的非翻译区剪接位点识别 | 第59-81页 |
| ·概述 | 第59-60页 |
| ·支持向量机理论 | 第60-64页 |
| ·最优分类面 | 第60-62页 |
| ·广义最优分类面 | 第62-63页 |
| ·核函数 | 第63-64页 |
| ·剪接位点识别的核函数 | 第64-72页 |
| ·序列核函数 | 第65-69页 |
| ·位置权重子序列核函数 | 第69-72页 |
| ·实验结果 | 第72-78页 |
| ·数据准备 | 第72-73页 |
| ·参数选择 | 第73-76页 |
| ·实验结果与讨论 | 第76-78页 |
| ·小结 | 第78-81页 |
| 第五章 信号序列中的寡核苷酸模体发现 | 第81-101页 |
| ·概述 | 第81-82页 |
| ·最大熵模体选取方法 | 第82-90页 |
| ·最大熵原理 | 第82-83页 |
| ·最大熵分布的计算 | 第83-86页 |
| ·模体的评价标准 | 第86-88页 |
| ·模体的选取策略 | 第88-90页 |
| ·最大熵模型 | 第90页 |
| ·剪接信号序列中的模体选取 | 第90-99页 |
| ·数据准备 | 第90-92页 |
| ·模体选取 | 第92-99页 |
| ·小结 | 第99-101页 |
| 第六章 外显子跳跃剪接在物种间的保守性分析 | 第101-117页 |
| ·概述 | 第101-102页 |
| ·跳跃外显子的保守性分析 | 第102-115页 |
| ·数据收集 | 第102-103页 |
| ·特征分析 | 第103-115页 |
| ·小结 | 第115-117页 |
| 结束语 | 第117-119页 |
| 致谢 | 第119-121页 |
| 参考文献 | 第121-133页 |
| 作者在攻读博士期间撰写的论文 | 第133页 |