海湾扇贝遗传图谱构建及壳色基因、生长相关QTL的定位研究
中文摘要 | 第1-9页 |
英文摘要 | 第9-11页 |
第一章 综述 | 第11-42页 |
第一节 遗传连锁图谱构建及应用 | 第11-31页 |
·遗传连锁图谱构建的理论基础 | 第11-13页 |
·连锁关系的确立 | 第11-12页 |
·重组值的估计 | 第12页 |
·似然比 | 第12-13页 |
·作图函数 | 第13页 |
·遗传连锁图谱的构建过程 | 第13-28页 |
·选择适合作图的遗传标记 | 第13-24页 |
·形态学标记 | 第14页 |
·生化(同工酶)标记 | 第14-15页 |
·分子标记 | 第15-24页 |
·作图群体的建立 | 第24-26页 |
·亲本的选择 | 第24-25页 |
·作图群体的类型 | 第25-26页 |
·数据统计及图谱构建 | 第26-28页 |
·分离数据的收集与数字化 | 第26-27页 |
·图谱构建软件 | 第27-28页 |
·遗传图谱的应用 | 第28-29页 |
·QTL 定位 | 第28页 |
·比较基因组研究 | 第28页 |
·基于遗传图谱的基因克隆 | 第28-29页 |
·标记辅助选择 | 第29页 |
·目前遗传图谱研究存在的问题 | 第29-31页 |
第二节 QTL 定位 | 第31-34页 |
·QTL 定位的原理和方法 | 第31-33页 |
·单标记分析法 | 第32页 |
·区间作图法 | 第32页 |
·复合区间作图法 | 第32-33页 |
·多重区间作图法 | 第33页 |
·QTL 定位研究存在的问题 | 第33-34页 |
第三节 水产动物遗传图谱及QTL 定位研究进展 | 第34-37页 |
·鱼类遗传连锁图谱及QTL 定位进展 | 第34-35页 |
·对虾类遗传连锁图谱及QTL 定位进展 | 第35-36页 |
·海洋贝类遗传连锁图谱及QTL 定位进展 | 第36-37页 |
第四节 海洋贝类壳色研究进展 | 第37-42页 |
第二章 家系建立及形态学指标分析 | 第42-49页 |
第一节 家系建立 | 第42-44页 |
·亲本来源 | 第42页 |
·作图群体建立 | 第42-44页 |
第二节 形态学指标分析 | 第44-49页 |
·壳色分析 | 第44页 |
·生长指标比较分析 | 第44-46页 |
·生长指标分布分析 | 第46页 |
·各生长指标之间的相关分析 | 第46-49页 |
第三章 相关分子标记的筛选与分析 | 第49-71页 |
第一节 DNA 模板制备 | 第49-51页 |
·DNA 提取 | 第49页 |
·DNA 质量检测与浓度测定 | 第49-51页 |
第二节 AFLP 标记分析 | 第51-62页 |
·材料与方法 | 第51-56页 |
·实验材料 | 第51页 |
·接头、引物合成、试剂及设备 | 第51-52页 |
·AFLP 反应程序 | 第52-55页 |
·变性聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第55-56页 |
·实验结果 | 第56-62页 |
·预扩增结果 | 第56-57页 |
·选择性扩增结果与分析 | 第57-62页 |
第三节 微卫星标记分析 | 第62-69页 |
·材料与方法 | 第62-63页 |
·实验材料 | 第62页 |
·实验方法 | 第62-63页 |
·微卫星引物的获得 | 第62页 |
·微卫星反应程序 | 第62-63页 |
·电泳检测 | 第63页 |
·微卫星引物的筛选 | 第63页 |
·实验结果 | 第63-69页 |
·微卫星扩增结果 | 第63-65页 |
·微卫星扩增的基因型统计分析 | 第65-67页 |
·微卫星扩增的标记分析 | 第67-69页 |
第四节 标记小结 | 第69-71页 |
·各标记扩增情况比较分析 | 第69页 |
·形态学标记 | 第69-70页 |
·用于连锁图谱构建的标记总结 | 第70-71页 |
第四章 海湾扇贝遗传连锁图谱的构建 | 第71-91页 |
前言 | 第71-72页 |
·材料与方法 | 第72-75页 |
·作图群体的建立 | 第72页 |
·标记分析 | 第72页 |
·分子标记的分类 | 第72页 |
·标记的命名 | 第72-73页 |
·数据统计 | 第73-74页 |
·图谱构建 | 第74页 |
·遗传图谱相关参数的计算 | 第74-75页 |
·实验结果 | 第75-82页 |
·连锁框架图中标记定位情况 | 第75页 |
·连锁图谱概况 | 第75-81页 |
·雌性连锁图谱 | 第75-78页 |
·雄性连锁图谱 | 第78-81页 |
·图谱长度及覆盖率 | 第81页 |
·雌雄连锁图谱比较 | 第81-82页 |
·讨论 | 第82-91页 |
·标记特点 | 第82-83页 |
·关于偏分离现象 | 第83-85页 |
·标记的分布 | 第85页 |
·遗传图谱 | 第85-86页 |
·实验过程中的异源污染 | 第86-87页 |
·海湾扇贝的壳色基因定位与壳色遗传 | 第87-91页 |
第五章 海湾扇贝生长相关 QTL 的定位分析 | 第91-112页 |
前言 | 第91-93页 |
·材料与方法 | 第93-94页 |
·作图群体的建立 | 第93页 |
·目标性状的测量 | 第93页 |
·遗传连锁图谱的构建 | 第93页 |
·QTL 定位分析 | 第93-94页 |
·结果与分析 | 第94-108页 |
·目标性状分析 | 第94页 |
·QTL 定位结果 | 第94-96页 |
·雌性连锁图谱QTL 定位结果 | 第94-95页 |
·雄性连锁图谱QTL 定位结果 | 第95页 |
·各性状QTL 定位结果 | 第95-96页 |
·壳长QTL 定位结果 | 第95页 |
·壳高QTL 定位结果 | 第95页 |
·壳宽QTL 定位结果 | 第95-96页 |
·全湿重QTL 定位结果 | 第96页 |
·软体部重QTL 定位结果 | 第96页 |
·壳重QTL 定位结果 | 第96页 |
·QTL 的图谱定位 | 第96-108页 |
·讨论 | 第108-112页 |
·关于 QTL 定位研究的群体类型 | 第108页 |
·海湾扇贝 QTL 定位及遗传关系研究 | 第108-109页 |
·标记辅助选择育种 | 第109-110页 |
·QTL 定位存在问题与发展前景 | 第110-112页 |
第六章 总结 | 第112-114页 |
参考文献 | 第114-130页 |
致谢 | 第130页 |