| 中文摘要 | 第1-11页 |
| 英文摘要 | 第11-14页 |
| 缩略语表 | 第14-15页 |
| 大梅F2测定性状的英文缩写 | 第15-16页 |
| 第一章 前言 | 第16-39页 |
| 1 不同猪种生长、胴体、肉质等性状的差异及研究现状 | 第17-31页 |
| ·不同猪种在生长、胴体、肉质等性状上的差异 | 第17页 |
| ·不同猪种生长、胴体、肉质等性状差异原因的研究进展 | 第17-31页 |
| ·影响不同猪种生长、胴体、肉质等性状差异的非遗传因素 | 第18-19页 |
| ·影响不同猪种生长、胴体、肉质等性状差异的遗传因素 | 第19-31页 |
| ·影响不同猪种生长性状的主基因和候选基因 | 第19-21页 |
| ·影响不同猪种胴体性状的主基因和候选基因 | 第21-23页 |
| ·影响不同猪种肉质性状的主基因和候选基因 | 第23-26页 |
| ·影响不同猪种繁殖性状的主基因和候选基因 | 第26-28页 |
| ·影响不同猪种抗病性状的主基因和候选基因 | 第28-31页 |
| 2 猪基因差异表达的研究进展 | 第31-38页 |
| ·基因差异表达研究方法 | 第31-36页 |
| ·消减杂交法(Subtractive Hybridization) | 第31页 |
| ·mRNA差异显示技术(mRNA Differential Display) | 第31-32页 |
| ·代表性序列差别分析(Representational Difference Analysis) | 第32页 |
| ·抑制消减杂交法(Suppression Subtractive Hybridization) | 第32-34页 |
| ·基因表达系列分析(Serial Analysis of Gene Expression) | 第34-35页 |
| ·基因鉴定集成法(Integrated Procedure for Gene Identification) | 第35-36页 |
| ·cDNA微阵列(cDNA microarray) | 第36页 |
| ·猪基因差异表达的研究现状 | 第36-38页 |
| 3 研究目的和意义 | 第38-39页 |
| 第二章 材料与方法 | 第39-54页 |
| 1 主要仪器设备 | 第39页 |
| 2 试剂盒、试剂和酶、载体及菌株 | 第39-40页 |
| ·试剂盒 | 第39页 |
| ·试剂和酶 | 第39-40页 |
| ·载体和菌株 | 第40页 |
| 3 实验样品 | 第40-41页 |
| ·组织样 | 第40-41页 |
| ·猪群和DNA样 | 第41页 |
| 4 实验方法 | 第41-54页 |
| ·背最长肌总RNA的制备 | 第41-42页 |
| ·背最长肌mRNA的分离 | 第42页 |
| ·SMART cDNA的合成 | 第42-44页 |
| ·抑制消减杂交 | 第44-48页 |
| ·Driver和Tester cDNA的制备 | 第45-46页 |
| ·Tester cDNA的接头连接效率检测 | 第46页 |
| ·消减杂交 | 第46-47页 |
| ·PCR扩增 | 第47页 |
| ·消减效率检测 | 第47-48页 |
| ·消减cDNA文库的构建 | 第48页 |
| ·连接 | 第48页 |
| ·细菌转化 | 第48页 |
| ·消减cDNA文库的筛选 | 第48-50页 |
| ·PCR筛选 | 第48-49页 |
| ·斑点杂交筛选 | 第49-50页 |
| ·探针制备 | 第49页 |
| ·斑点杂交 | 第49-50页 |
| ·阳性克隆cDNA片段测序及序列分析 | 第50页 |
| ·RT-PCR检验基因差异表达 | 第50-51页 |
| ·背最长肌总RNA的制备 | 第50页 |
| ·RT-PCR反应 | 第50-51页 |
| ·差异基因全长克隆及序列分析 | 第51-52页 |
| ·电子延伸 | 第51页 |
| ·RACE-PCR | 第51页 |
| ·RACE-PCR产物的回收与纯化 | 第51-52页 |
| ·克隆与测序 | 第52页 |
| ·计算机分析 | 第52页 |
| ·差异基因表达分析 | 第52-53页 |
| ·总RNA的制备 | 第52-53页 |
| ·RT-PCR反应 | 第53页 |
| ·差异基因的基因组结构分析、序列克隆 | 第53页 |
| ·多态性分析和SNP研究 | 第53-54页 |
| 第三章 结果与分析 | 第54-119页 |
| 1 背最长肌总RNA的提取 | 第54页 |
| 2 背最长肌mRNA的分离纯化 | 第54-55页 |
| 3 SMART cDNA的合成 | 第55页 |
| 4 抑制消减杂交 | 第55-58页 |
| ·Driver和Tester cDNA的制备 | 第55-57页 |
| ·消减杂交、抑制性PCR和消减效率检测 | 第57-58页 |
| 5 消减cDNA文库的构建和筛选 | 第58-60页 |
| ·消减cDNA文库的构建和PCR筛选 | 第58-59页 |
| ·斑点杂交筛选 | 第59-60页 |
| 6 阳性克隆测序及序列分析 | 第60-61页 |
| 7 基因差异表达的RT-PCR验证 | 第61-62页 |
| 8 差异基因全长克隆及序列分析 | 第62-95页 |
| ·MS60(CCNG1:cyclin G1) | 第62-67页 |
| ·MS46(EEF1A:eukaryotic translation elongation factor 1 alpha) | 第67-74页 |
| ·MS81(ETFB-like:Electron transfer flavoprotein,beta polypeptide-like) | 第74-76页 |
| ·DB245(HUMMLC2B:skeletal muscle myosin regulatory light chain 2B) | 第76-81页 |
| ·DB47(PGK1:phosphoglycerate kinase 1) | 第81-86页 |
| ·DB189(TXNIP:thioredoxin interacting protein) | 第86-90页 |
| ·DB226(CKM:muscle creatine kinase) | 第90-95页 |
| 9 差异基因表达分析 | 第95-99页 |
| ·差异基因的不同品种间表达分析 | 第95-98页 |
| ·差异基因的不同发育阶段表达分析 | 第98-99页 |
| ·差异基因的不同组织表达分析 | 第99页 |
| 10 差异基因的基因组结构分析、序列克隆和多态性分析 | 第99-107页 |
| ·MS60(CCNG1:cyclin G1) | 第99-102页 |
| ·DB245(HUMMLC2B:skeletal muscle myosin regulatory light chain 2B) | 第102-103页 |
| ·DB189(TXNIP:thioredoxin interacting protein) | 第103-105页 |
| ·DB47(PGK1:phosphoglycerate kinase 1) | 第105-106页 |
| ·DB37 (KIAA1717:H3-K4-specific methyltransferase) | 第106-107页 |
| 11 SNPs研究 | 第107-119页 |
| ·MS60-2-Nco Ⅰ-RFLP | 第107-109页 |
| ·MS60-345-1-TspE Ⅰ-RFLP | 第109-112页 |
| ·DB245-2-Msp Ⅰ-RFLP | 第112-115页 |
| ·DB37-Msp Ⅰ-RFLP | 第115-119页 |
| 第四章 讨论 | 第119-138页 |
| 1 关于抑制消减杂交技术 | 第119-120页 |
| 2 关于高通量筛选 | 第120-121页 |
| 3 关于含内标化的半定量RT-PCR | 第121-122页 |
| 4 关于EST的电脑克隆和RACE | 第122-123页 |
| 5 关于PCR引物设计及优化 | 第123-124页 |
| 6 关于猪与人、鼠间基因结构和编码区序列的保守性 | 第124-125页 |
| 7 关于差异表达基因 | 第125-132页 |
| ·基因Cyclin G1(MS60) | 第125-127页 |
| ·基因EEF1A(MS46) | 第127-128页 |
| ·基因ETFB-like(MS81) | 第128页 |
| ·基因HUMMLC2B(DB245) | 第128-129页 |
| ·基因PGK1(DB47) | 第129-130页 |
| ·基因TXNIP(DB189) | 第130-132页 |
| ·基因CKM(DB226) | 第132页 |
| 8 关于差异表达基因的SNPs | 第132-133页 |
| 9 关于SNPs的遗传效应 | 第133-135页 |
| ·MS60-2-NcoⅠ-RFLP和MS60-345-1-rspEⅠ-RFLP | 第133-134页 |
| ·DB245-2-MspⅠ-RFLP | 第134页 |
| ·DB37-MspⅠ-RFLP | 第134-135页 |
| 10 关于下一步工作 | 第135-138页 |
| 小结 | 第138-139页 |
| 参考文献 | 第139-153页 |
| 附录一 | 第153-155页 |
| 用于表达分析的引物 | 第153-154页 |
| 用于基因克隆的引物 | 第154-155页 |
| 附录二 | 第155-156页 |
| 攻读博士学位期间发表和已投稿的论文 | 第155-156页 |
| 致谢 | 第156-157页 |
