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褐藻胶生物转化的分子生物学基础研究--Ⅰ:褐藻胶裂解酶新基因的克隆、重组表达与重组酶的初步分析 Ⅱ:假单胞菌褐藻胶生物合成操纵元全基因的克隆与序列分析

第一章 引言第1-30页
 1 褐藻胶多糖和低聚糖的生物学活性的研究第14-17页
   ·褐藻胶多糖及生物活性物质的研究第14-16页
     ·褐藻的基本结构第14页
     ·褐藻胶的生物来源与结构特点第14-15页
     ·褐藻胶多糖生物活性物质的开发第15-16页
   ·褐藻胶低聚糖及其生物学活性的研究第16-17页
     ·褐藻胶低聚糖第16-17页
     ·褐藻胶低聚糖的生物学活性第17页
 2 褐藻胶裂解酶及其分子生物学研究第17-21页
   ·褐藻胶裂解酶第17-19页
     ·褐藻胶裂解酶的来源第17-18页
     ·褐藻胶裂解酶的作用机制第18页
     ·褐藻胶裂解酶的底物特异性与分类第18-19页
     ·褐藻胶裂解酶的酶活测定方法第19页
   ·褐藻胶裂解酶基因的克隆与功能鉴定研究第19-21页
   ·褐藻胶裂解酶的构-效关系研究第21页
 3 褐藻胶的微生物合成及其分子生物学研究第21-27页
   ·细菌合成褐藻胶的遗传学基础第21-24页
   ·细菌中褐藻胶的生物合成途径第24-27页
     ·细菌中褐藻胶生物合成的调控机制第24-25页
     ·褐藻胶的别构修饰第25-27页
 4 褐藻胶的生物转化第27-30页
   ·酶法制备褐藻胶低聚糖的研究第27-28页
   ·微生物生物合成与修饰的研究第28-30页
第二章 褐藻胶裂解酶新基因克隆、序列分析和重组酶的表达、纯化与性质的初步研究第30-61页
 1 实验材料第30-31页
 2 实验方法第31-41页
   ·海水环境基因组DNA质粒文库的构建第31-34页
     ·SDS-CTAB法制备海水总基因组DNA第31-32页
     ·总基因组DNA的条件酶切第32页
     ·质粒pBluescript Ⅱ KS(+)的去磷酸化处理第32-33页
     ·质粒文库的构建和保存第33-34页
   ·褐藻胶裂解酶新基因的筛选第34-35页
     ·褐藻胶裂解酶的生物信息学分析与和简并PCR引物的设计第34页
     ·algL基因的96孔板法PCR筛选第34-35页
   ·阳性克隆D45中外源基因片段的序列分析第35-36页
     ·阳性克隆D45的培养第35页
     ·pD45质粒的酶切鉴定与序列测定第35页
     ·外源基因的序列分析第35-36页
   ·algL基因的重组、表达和纯化第36-38页
     ·表达型重组质粒pLyaseA的构建第36-37页
     ·重组褐藻胶裂解酶AlgL的表达条件优化第37页
     ·重组褐藻胶裂解酶的大量表达与纯化第37-38页
   ·重组褐藻胶裂解酶的初步鉴定第38-41页
     ·蛋白质浓度的Lowry法法测定第38-39页
     ·糖醛酸浓度的Carbazole法测定第39页
     ·酶活的紫外吸收法测定第39-40页
     ·酶底物专一性的PAGE分析第40-41页
 3 实验结果第41-55页
   ·褐藻胶裂解酶基因的生物信息学分析与简并PCR引物第41-43页
   ·海水环境基因组DNA基因文库的构建和96孔板法筛选第43-44页
   ·重组质粒pD45的酶切鉴定与序列分析第44-45页
   ·algL基因和AlgL蛋白的序列分析第45-48页
   ·pLyase-A重组菌诱导表达条件的优化第48-50页
   ·含His-标签AlgL的大量表达和纯化第50-51页
   ·蛋白质浓度的测定第51-52页
   ·已糖醛酸浓度的测定第52-53页
   ·AlgL活性的紫外吸收法测定第53页
   ·AlgL底物特性的PAGE电泳分析第53-55页
 4 讨论第55-61页
   ·实验的技术路线第55-56页
   ·海水环境基因组DNA文库的构建第56-57页
   ·algL基因的筛选第57-58页
   ·阳性克隆D45外源基因的分析第58-59页
   ·重组AlgL的表达与纯化第59页
   ·重组AlgL的性质分析第59-61页
第三章 海洋假单胞细菌的筛选、16S rRNA鉴定和褐藻胶操纵元全基因序列的克隆以及生物信息学分析第61-74页
 1 实验材料第61-62页
 2 实验方法第62-66页
   ·algL基因来源菌株的筛选和鉴定第62-63页
     ·海洋微生物的分离第62页
     ·目的菌株的菌落PCR筛选第62-63页
     ·菌种的基本特征第63页
     ·16S rDNA基因的克隆第63页
     ·系统发育树的构建第63页
   ·褐藻胶生物合成操纵元基因全序列的克隆与分析第63-66页
     ·褐藻胶生物合成操纵元基因的生物信息学分析第64页
     ·Pseudomonas sp. QDA菌株高分子量基因组DNA的制备第64-65页
     ·操纵元基因序列的简并PCR步移法克隆第65页
     ·操纵元全基因序列的分析第65-66页
 3 实验结果第66-71页
   ·海洋微生物的筛选第66页
   ·菌株的基本特征第66页
   ·16S rDNA序列与系统发育树第66-67页
   ·操纵元全基因序列的克隆第67-68页
   ·全操纵元基因序列的分析第68-69页
   ·操纵元5′-调控区DNA序列的分析第69-71页
 4 讨论第71-74页
   ·微生物的筛选策略第71页
   ·菌种的16S rDNA鉴定第71-72页
   ·操纵元序列特征的分析第72页
   ·操纵元的转录机制分析第72-74页
总结与展望第74-75页
参考文献第75-82页
致谢第82-83页
文章发表情况第83页

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