| 内容提要 | 第1-8页 |
| 第1章 前言 | 第8-20页 |
| ·禽流行性感冒疫苗研究现状 | 第8-11页 |
| ·禽流行性感冒的危害性 | 第8页 |
| ·禽流感病毒的分子生物学特征 | 第8-9页 |
| ·禽流感病毒疫苗的研究进展 | 第9-10页 |
| ·抗原表位预测的优势 | 第10-11页 |
| ·HA 蛋白及其抗原表位的研究进展 | 第11-19页 |
| ·HA 蛋白的分子生物学特征及HA 抗原表位的相关文献 | 第11-14页 |
| ·抗原表位的预测算法与软件 | 第14-16页 |
| ·多序列比对 | 第16-17页 |
| ·进化分析 | 第17-19页 |
| ·本论文研究意义 | 第19页 |
| ·本论文研究目标 | 第19-20页 |
| 第2章 材料和方法 | 第20-34页 |
| ·H5N1 亚型禽流感病毒株数据的获得 | 第20-22页 |
| ·分析流程 | 第22-23页 |
| ·H5N1 亚型禽流感病毒株的多序列比对与进化分析 | 第23-25页 |
| ·多序列比对 | 第23页 |
| ·进化分析 | 第23-25页 |
| ·HA 蛋白的表位预测 | 第25-30页 |
| ·基于HA 蛋白序列的线性表位预测 | 第25-28页 |
| ·基于HA 蛋白3D 结构的非线性表位预测 | 第28-30页 |
| ·HA 蛋白多表位基因的构建 | 第30-34页 |
| ·实验材料 | 第30-31页 |
| ·主要实验设备 | 第31页 |
| ·主要实验方法 | 第31-34页 |
| 第3章 结果 | 第34-51页 |
| ·HA 蛋白的多序列比对 | 第34-36页 |
| ·系统发生树的构建 | 第36-37页 |
| ·HA 蛋白表位预测 | 第37-43页 |
| ·基于序列的HA 蛋白线性表位的预测 | 第37页 |
| ·HA 蛋白线性抗原性较高区域预测 | 第37-38页 |
| ·HA 蛋白线性抗原表位筛选参数的计算 | 第38-43页 |
| ·基于HA 蛋白3D 结构的非线性表位预测 | 第43-46页 |
| ·CN3D 寻找环结构 | 第43-45页 |
| ·DiscoTope 预测非线性B 表位 | 第45页 |
| ·HA 蛋白非线性抗原表位预测的整合结果 | 第45-46页 |
| ·利用HA 蛋白非线性表位预测的结果构建多表位基因 | 第46-50页 |
| ·多表位基因的设计 | 第46-47页 |
| ·采用 PCR 法合成B2 基因片段 | 第47页 |
| ·B2 基因片段的T-A 克隆及鉴定 | 第47-48页 |
| ·基因片段B2 与B1C1 的亚克隆 | 第48-49页 |
| ·多拷贝基因片段及表达载体的构建 | 第49-50页 |
| ·尝试蛋白表达及攻毒实验 | 第50-51页 |
| 第4章 讨论 | 第51-56页 |
| ·HA 蛋白的抗原表位 | 第51页 |
| ·HA 蛋白的多序列比对和进化分析 | 第51-52页 |
| ·用于进化分析的软件 | 第51-52页 |
| ·HA 蛋白的易突变性 | 第52页 |
| ·HA 抗原表位预测流程的建立 | 第52-53页 |
| ·HA 线性抗原表位的预测流程 | 第52页 |
| ·HA 非线性抗原表位的预测流程 | 第52-53页 |
| ·所建立的线性抗原表位预测流程的优点 | 第53页 |
| ·线性抗原表位预测流程的展望 | 第53页 |
| ·HA 蛋白线性表位预测中的单参数 | 第53-56页 |
| ·线性表位预测的参数 | 第53-54页 |
| ·线性表位预测参数的联合应用 | 第54-56页 |
| 第5章 结论 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-60页 |
| 致谢 | 第60-61页 |
| 中文摘要 | 第61-63页 |
| ABSTRACT | 第63-65页 |
