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甘蓝型油菜产量性状及其杂种优势遗传基础的全基因组解析

中文摘要第1-12页
ABSTRACT第12-18页
缩略词表第18-19页
1 前言第19-32页
   ·农作物产量的重要性和复杂性第19-20页
   ·植物数量性状的遗传研究第20-25页
     ·数量性状与数量性状位点第20页
     ·QTL定位的原理与方法第20-23页
     ·QTL的区分与整合第23页
     ·QTL的克隆第23-24页
     ·上位性分析第24-25页
   ·农作物产量基因的鉴定第25-27页
   ·农作物产量相关基因的遗传模式与杂种优势第27-28页
   ·甘蓝型油菜与拟南芥的比较作图第28页
   ·农作物产量性状及其杂种优势的遗传研究第28-31页
   ·研究目的与意义第31-32页
2 材料与方法第32-41页
   ·作图群体的构建第32页
   ·田间实验和性状考察第32-34页
   ·群体基因型分析第34-35页
   ·一般杂合度和特殊杂合度的计算第35页
   ·分子标记遗传连锁图谱的构建第35-36页
   ·TNDH遗传连锁图与拟南芥基因组的比较作图第36页
   ·产量及其关联性状候选基因的收集和电子定位第36-37页
   ·数据统计分析第37页
   ·QTL的检测第37页
   ·QTL遗传模式的确定第37-38页
   ·QTL区分与整合第38-39页
   ·指示QTL的估计和种子产量候选基因的鉴定第39-40页
   ·互作对的检测第40-41页
3 结果与分析第41-71页
   ·TNDH遗传连锁图及其和拟南芥基因组的比较作图第41-42页
   ·10个环境油菜生长周期内的主要气象因子分析第42-43页
   ·多环境两群体9性状的表型和杂种优势分析第43-49页
     ·亲本和群体9性状在不同环境中的表型变异分析第43-44页
     ·F_1和RC-F_2群体9个性状的杂种优势分析第44-46页
     ·9性状表型和杂种优势的方差和遗传力分析第46-47页
     ·9性状表型的遗传相关分析第47-48页
     ·9性状杂种优势的遗传相关分析第48-49页
   ·一般杂合度/特殊杂合度和杂种表型/杂种优势的相关分析第49-50页
   ·多环境两群体9性状QTL的检测和分析第50-62页
     ·9性状10环境两群体的QTL检测和确认第50-53页
     ·RC-F_2群体9个性状identified-QTL的遗传模式分析第53-54页
     ·9个性状identified-QTL的全基因组分布和整合第54-56页
     ·9性状consensus-QTL对自然环境的响应规律第56-58页
     ·9性状consensus-QTL的分布和整合第58-59页
     ·产量QTL簇的解析和指示QTL的确定第59-62页
   ·多环境两群体9性状上位性的检测和分析第62-69页
     ·上位性互作的检测第62-64页
     ·互作位点的分布第64-66页
     ·RC-F_2群体互作对的类型和贡献率第66-67页
     ·RC-F_2群体互作对的表型效应第67-69页
   ·产量性状及其杂种优势的遗传结构图第69-71页
4 讨论第71-80页
   ·本研究QTL高分辨率的原因第71页
   ·元分析在多环境、多群体和多性状QTL分析中的应用第71-72页
   ·QTL的环境特异性与品种的适应性第72-73页
   ·本研究对对油菜遗传育种的意义第73-74页
   ·产量遗传决定和指示QTL概念的提出第74-76页
   ·指示QTL对产量QTL克隆的意义第76-77页
   ·产量及其杂种优势的遗传结构图第77-80页
5 研究结论与展望第80-81页
6 参考文献第81-99页
致谢第99-100页
附录第100-130页
 附录1 实验数据第100-116页
  附图1 所有环境油菜生长周期内的主要气象因子第100-103页
  附图2 Consensus-QTL和unique-QTL在全基因组19个连锁群上的分布第103-106页
  附表1A TNDH遗传连锁图第106页
  附表1B TNDH遗传连锁图和拟南芥基因组的比较作图第106页
  附表1C 与本研究考察性状有关的拟南芥基因第106页
  附表1D 拟南芥基因在TNDH遗传连锁图上的电子定位第106-107页
  附表2 两个亲本和群体在10个小环境中的表型变异第107-108页
  附表3A DH群体9个性状表型方差分析第108-109页
  附表3B RC-F2群体9性状表型方差分析第109-110页
  附表3C 9性状中亲优势的方差分析第110-111页
  附表4A N3环境性状间表型遗传相关第111页
  附表4B N4环境性状间表型遗传相关第111页
  附表4C N6环境性状间表型遗传相关第111-112页
  附表4D N7环境性状间表型遗传相关第112页
  附表4E S3环境性状间表型遗传相关第112页
  附表4F S4环境性状间表型遗传相关第112-113页
  附表4G S5环境性状间表型遗传相关第113页
  附表4H S6环境性状间表型遗传相关第113页
  附表4I S7环境性状间表型遗传相关第113-114页
  附表4J E7环境性状表型间遗传相关第114页
  附表5A N6环境性状杂种优势间的遗传相关第114页
  附表5B S5环境性状杂种优势间的遗传相关第114-115页
  附表5C S6环境性状杂种优势间的遗传相关第115页
  附表6A QTL的检测和identified-QTL的确定第115页
  附表6B Identified-QTL分性状整合成consensus-QTL第115页
  附表6C Consensus-QTL整合成unique-QTL第115页
  附表7 两群体10环境9性状检测到的538个互作对第115-116页
 附录2 部分实验的详细操作程序第116-124页
  Protoco 1:DNA Extraction Using CTAB第116-117页
  Protocol 2:Southern Blotting onto Hybond-N~+ Membrane第117-118页
  Protocol 3:Radioactively Labeling Probe第118-119页
  Protocol 4:Hybridization with Radioactively Labeled Probe第119-120页
  Protocol 5:PAGE gel Making and Silver Staining第120-124页
 附录3 QTL和互作对展示的EXCEL宏程序第124-130页
 附录4 作者简历和在读期间发表论文第130页

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