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非负矩阵因子分解算法处理癌症基因表达数据的研究

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-9页
第一章 绪论第9-16页
   ·微阵列技术与基因表达数据第9-10页
   ·本课题研究的目的和意义第10-11页
   ·国内外研究现状第11-13页
     ·癌症基因表达数据分类方法第11-12页
     ·肿瘤相关差异表达基因的提取方法第12-13页
   ·主要内容与创新点第13-14页
   ·论文结构与安排第14-15页
   ·本章小结第15-16页
第二章 相关算法的理论基础第16-28页
   ·聚类算法综述第16-20页
     ·聚类算法的基本概念第16页
     ·聚类算法的种类第16-19页
       ·划分方法第17页
       ·层次方法第17-18页
       ·基于密度的方法第18页
       ·基于网格的方法第18页
       ·基于模型的方法第18-19页
     ·微阵列数据中的聚类算法第19-20页
   ·非负矩阵因子分解算法第20-26页
     ·非负矩阵因子分解算法的引出第20-21页
     ·问题描述第21-22页
     ·目标函数第22-23页
     ·迭代规则第23-24页
     ·收敛性证明第24-26页
   ·EASE 基因表达分析软件系统第26-27页
     ·软件的原理第26-27页
     ·软件的用处第27页
   ·本章小结第27-28页
第三章 基于非负矩阵因子分解算法分类癌症基因表达数据的研究第28-41页
   ·改进的非负矩阵因子分解算法第28-31页
     ·稀疏非负矩阵分解(SNMF)算法第28-29页
     ·局部非负矩阵分解(LNMF)算法第29-30页
     ·NMF 算法的生物学意义解释第30-31页
   ·分类胃癌基因表达数据的研究第31-37页
     ·方法第31-33页
     ·实验结果与分析第33-37页
       ·实验数据与来源第33页
       ·实验参数与步骤第33页
       ·实验结果第33-35页
       ·分类比较第35页
       ·讨论第35-37页
   ·分类结肠癌基因表达数据的研究第37-40页
     ·方法第37-38页
     ·实验结果与分析第38-40页
       ·实验数据与来源第38页
       ·实验结果第38-40页
   ·本章小结第40-41页
第四章 与胃癌相关的差异表达基因提取方法及功能分类第41-48页
   ·引言第41页
   ·方法第41-42页
     ·提取算法描述第41-42页
     ·提取方法设计第42页
   ·实验数据与步骤第42-43页
     ·数据集第42-43页
     ·步骤第43页
   ·实验结果与基因的功能分析第43-47页
     ·差异表达基因的提取第43-45页
     ·差异表达基因的功能分类第45-46页
     ·差异表达基因的生物意义解释第46-47页
   ·本章小结第47-48页
第五章 结论和展望第48-50页
致谢第50-51页
参考文献第51-55页
攻硕期间取得的研究成果第55-56页

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