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体外重建HLAⅠ类分子鉴定SARS-COV T细胞表位的初步研究

致谢第1-11页
摘要第11-12页
文献综述第12-29页
 1 T 细胞概述第12-15页
   ·T 细胞表面分子第12-13页
   ·T 细胞的成熟第13-14页
   ·T 细胞的亚群及其功能第14-15页
   ·T 细胞亚群变化与疾病的关系第15页
 2 主要组织相容性复合体概述第15-26页
   ·主要组织相容性复合体的命名第15-16页
   ·HLA 分子的结构第16-18页
   ·MHC 的功能第18-20页
   ·MHC 的应用第20-22页
     ·MHC 测序分型方法及其在造血干细胞移植中的应用第20页
     ·HLA 抗体筛选技术的最新进展及其在器官移植中的应用第20页
     ·MHCⅠ类分子-肽多聚体的制备及其应用第20-22页
       ·抗原特异性CTL 的定量检测第21页
       ·临床诊断、治疗方面的应用第21-22页
       ·在肿瘤研究和疫苗疗效监测方面的应用第22页
   ·T 细胞抗原表位的预测与鉴定第22-26页
     ·基序法(simple motify)第23-24页
     ·矩阵法第24-25页
     ·人工智能技术第25-26页
       ·人工神经网络(ANNs)第25页
       ·隐马可夫模型(HMMs)第25页
       ·支持矢量机器(SVMs)第25-26页
 3 SARS-COV S1 蛋白概述第26-29页
引言第29-30页
试验一 HLA-Aα 链,β2m 基因克隆与遗传进化分析第30-44页
 1 材料和方法第30-35页
   ·供试材料第30-31页
     ·菌种和质粒第30页
     ·基因克隆相关试剂第30页
     ·试剂盒第30页
     ·主要仪器第30页
     ·试剂的配制第30-31页
       ·琼脂糖电泳试剂的配制第30页
       ·大肠杆菌转化用溶液第30-31页
   ·试验方法第31-35页
     ·引物的设计与合成第31页
     ·人血液总RNA 的提取第31-32页
     ·目的基因的RT-PCR 扩增第32-33页
       ·反转录(RT)第32页
       ·PCR 扩增第32-33页
     ·PCR 产物的回收纯化第33页
     ·PCR 产物的连接第33页
     ·连接产物的转化第33-34页
     ·挑斑第34页
     ·质粒提取第34页
     ·目的基因的克隆鉴定第34-35页
     ·HLA-A α链和β2m 的基因序列分析第35页
 2 结果第35-42页
   ·HLA-A α 链和 β2m 成熟肽胞外区的 RT-PCR 扩增第35-36页
   ·重组质粒的构建第36页
   ·重组质粒的鉴定第36-38页
     ·pGEM-T/HLA-Aα重组质粒的鉴定第36-37页
     ·pGEM-T/HLA-β2m 重组质粒的鉴定第37-38页
   ·HLA-A α 链和 β2m 基因序列测定及分析第38-39页
   ·HLA-A α 链基因与其他 HLA-A 单倍型及其他不同物种之间的序列同源性比较及系统进化分析第39-41页
     ·HLA-A α链基因与其他HLA-A 单倍型之间的序列同源性比较及系统进化分析第39-40页
     ·HLA-A α链基因与其他不同物种之间的序列同源性比较及系统进化分析第40-41页
   ·β2m 基因与其他不同物种之间的序列同源性比较及系统进化分析第41-42页
 3 结论与讨论第42-44页
   ·关于RNA 的提取第42-43页
   ·关于 HLA-Aα 链和 β2m 的 RT-PCR 扩增第43页
   ·关于 HLA-Aα 链和 β2m 基因的序列分析第43-44页
试验二 HLA-A α 链,β2m 基因在大肠杆菌中的表达及纯化第44-62页
 1 材料与方法第44-50页
   ·供试材料第44-47页
     ·菌种和质粒第44页
     ·主要试剂第44页
     ·试剂盒第44页
     ·主要仪器第44页
     ·试剂的配制第44-47页
       ·琼脂糖电泳试剂、大肠杆菌转化用溶液参考试验一第44页
       ·SDS-PAGE 电泳所用试剂的配制第44-46页
       ·包涵体提取相关试剂第46-47页
   ·试验方法第47-50页
     ·引物的设计与合成第47页
     ·HLA-α和HLA-β2m 成熟蛋白基因的PCR 扩增与纯化回收第47页
     ·目的片段的酶切回收第47页
     ·重组表达载体的构建第47-48页
       ·表达载体的纯化与扩增第47-48页
       ·表达载体的质粒提取第48页
       ·表达质粒的酶切回收第48页
       ·目的片段与表达质粒的连接第48页
     ·重组质粒的转化和筛选第48页
     ·重组表达质粒的鉴定第48-49页
       ·重组表达质粒的提取第48页
       ·重组表达质粒的PCR 鉴定第48-49页
       ·重组表达质粒的酶切鉴定第49页
       ·重组表达质粒的序列测定第49页
     ·重组菌的诱导表达第49页
     ·重组表达蛋白的SDS-PAGE 电泳第49页
     ·包涵体的提取与纯化第49-50页
 2 结果第50-59页
   ·HLA-Aα, HLA-β2m 成熟蛋白基因的扩增第50页
   ·重组表达载体的构建第50-51页
   ·重组表达载体的鉴定第51-53页
     ·pET-28/ HLA-Aα重组质粒的鉴定第51-52页
     ·pET-28/HLA-β2m 重组质粒的鉴定第52-53页
   ·表达蛋白的SDS-PAGE 检测第53-57页
     ·pET-28/ HLA-Aα重组菌的表达第53-55页
     ·pET-28/HLA-β2m 重组菌的表达第55-57页
   ·包涵体的制备第57-59页
     ·pET-28/ HLA-Aα包涵体的制备第57-58页
     ·pET-28/HLA-β2m 包涵体的制备第58-59页
 3 结论与讨论第59-62页
   ·关于原核表达载体的构建第59页
   ·表达条件的优化第59-60页
   ·包涵体的制备与纯化第60-62页
试验三 SARS 冠状病毒 S1 蛋白抗原表位的预测及体外结合试验第62-70页
 1 材料与方法第62-64页
   ·供试材料第62页
     ·蛋白第62页
     ·主要试剂第62页
     ·主要仪器第62页
     ·试剂的配置第62页
       ·体外折叠溶液的配制第62页
   ·试验方法第62-64页
     ·抗原表位的设计与合成第62-63页
     ·体外折叠法鉴定多肽结合第63-64页
       ·稀释折叠法复性第63页
       ·折叠蛋白的浓缩第63页
       ·非还原性 SDS-PAGE 鉴定多肽的结合第63-64页
 2 结果第64-68页
   ·抗原表位的预测第64-67页
     ·SYFPEITHI 网站预测的T 细胞表位第64-65页
     ·EPITOPE 网站预测的T 细胞表位第65-66页
     ·DNAStar Protean 亲水性分析第66-67页
   ·非还原性SDS-PAGE 鉴定多肽的结合第67-68页
 3 结论与讨论第68-70页
   ·包涵体的体外折叠复性第68-69页
   ·HLA-A 与抗原表位的结合第69页
   ·非还原性SDS-PAGE第69-70页
全文总结第70-71页
参考文献第71-79页
Abstract第79-81页
硕士期间主要发表论文第81页

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