| 摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-14页 |
| 第1章 绪论 | 第14-46页 |
| ·课题的研究背景及意义 | 第14-15页 |
| ·生物信息学 | 第15-16页 |
| ·生物信息学的起源 | 第15页 |
| ·生物信息学的研究现状 | 第15-16页 |
| ·序列分析的生物学背景简介 | 第16-24页 |
| ·真核生物基因结构 | 第16-21页 |
| ·分子生物的中心法则 | 第21-22页 |
| ·蛋白质的合成过程 | 第22-23页 |
| ·基因序列特征 | 第23-24页 |
| ·基因预测的研究现状 | 第24-43页 |
| ·基因预测 | 第25-26页 |
| ·基因预测方法 | 第26-35页 |
| ·基因预测工具 | 第35-38页 |
| ·数据库 | 第38-41页 |
| ·基因预测的精度 | 第41-43页 |
| ·本领域面临的问题 | 第43页 |
| ·本文工作 | 第43-46页 |
| 第2章 Takagi-Sugeno模糊模型剪接位点识别 | 第46-60页 |
| ·引言 | 第46-47页 |
| ·T-S模糊理论 | 第47-53页 |
| ·T-S模糊模型 | 第48-49页 |
| ·模糊似然函数 | 第49页 |
| ·T-S模糊模型辨识方法 | 第49-51页 |
| ·仿真实例 | 第51-53页 |
| ·T-S模糊模型在剪接位点识别中的应用 | 第53-58页 |
| ·数据集 | 第53页 |
| ·识别的评价指标 | 第53页 |
| ·剪接位点T-S模型 | 第53-54页 |
| ·剪接位点信号特征和序列碱基组成随GC含量变化 | 第54-55页 |
| ·实验与结果 | 第55-58页 |
| ·本章小结 | 第58-60页 |
| 第3章 一种改进的朴素贝叶斯分类器剪接位点辨识方法 | 第60-74页 |
| ·引言 | 第60-61页 |
| ·核函数 | 第61-64页 |
| ·一种改进的贝叶斯分类器 | 第64-67页 |
| ·贝叶斯决策理论 | 第64-65页 |
| ·贝叶斯映射 | 第65-66页 |
| ·基于最小二乘法的改进的贝叶斯分类器 | 第66-67页 |
| ·基于改进的贝叶斯分类器剪接位点预测 | 第67-69页 |
| ·剪接位点附近碱基位置概率分布的计算 | 第67页 |
| ·DNA序列的贝叶斯特征映射 | 第67-69页 |
| ·实验设计 | 第69-70页 |
| ·实验结果及分析 | 第70-72页 |
| ·本章小结 | 第72-74页 |
| 第4章 基因序列编码区辨识 | 第74-98页 |
| ·引言 | 第74-75页 |
| ·蛋白质编码区结构及信号特性 | 第75-77页 |
| ·蛋白质编码区结构和典型信号 | 第75-76页 |
| ·蛋白质编码区信号特性 | 第76-77页 |
| ·支持向量机的基本原理 | 第77-81页 |
| ·短时傅立叶变换 | 第81-83页 |
| ·基于SVM与STFT的DNA序列编码区辨识算法 | 第83-90页 |
| ·SVM分类器设计 | 第83-85页 |
| ·利用STFT定位编码区位置 | 第85-86页 |
| ·实验结果及分析 | 第86-90页 |
| ·基于T-S模型与STFT的蛋白质编码区辨识 | 第90-97页 |
| ·DNA序列T-S模糊模型 | 第91-92页 |
| ·利用短时傅立叶变换定位编码区位置 | 第92页 |
| ·密码子第一位碱基的精确辨识 | 第92页 |
| ·实验结果及分析 | 第92-97页 |
| ·本章小结 | 第97-98页 |
| 第5章 人类基因启动子辨识方法研究 | 第98-118页 |
| ·引言 | 第98-101页 |
| ·真核基因启动子简介及特征分析 | 第101-107页 |
| ·启动子简介 | 第101-103页 |
| ·寡核苷酸 | 第103-104页 |
| ·寡核苷酸位置密度 | 第104-107页 |
| ·基于GMM的启动子模体提取 | 第107-112页 |
| ·高斯混合模型 | 第107-108页 |
| ·GMM参数估计 | 第108-109页 |
| ·启动子模体选取结果 | 第109-112页 |
| ·加权朴素贝叶斯人类基因启动子分类器 | 第112-114页 |
| ·基于最小二乘法的加权贝叶斯分类器 | 第112-113页 |
| ·实验结果及分析 | 第113-114页 |
| ·基于GMM统计特性参数的LS-SVM人类基因启动子分类器 | 第114-116页 |
| ·最小二乘支持向量机 | 第114-115页 |
| ·基于贝叶斯映射的LS-SVM启动子分类器 | 第115-116页 |
| ·实验结果及分析 | 第116页 |
| ·本章小结 | 第116-118页 |
| 第6章 结论与展望 | 第118-120页 |
| ·结论 | 第118-119页 |
| ·展望 | 第119-120页 |
| 参考文献 | 第120-136页 |
| 附录 专有名词中英文对照和名词解释 | 第136-144页 |
| 攻读学位期间公开发表论文 | 第144-146页 |
| 致谢 | 第146页 |
