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基于生物信息技术筛选与结直肠癌发病和预后相关的潜在生物标记物

摘要第3-5页
ABSTRACT第5-6页
缩略词表第7-10页
前言第10-14页
第1章 基因芯片数据来源和差异表达基因的分析第14-20页
    1.1 材料和方法第14-16页
        1.1.1 基因芯片表达谱的数据来源第14-15页
        1.1.2 芯片数据的预处理第15-16页
        1.1.3 基因芯片数据差异表达基因的筛选第16页
        1.1.4 差异表达基因的功能富集分析第16页
    1.2 分析结果第16-19页
        1.2.1 原始数据的获取和标准化处理第16-17页
        1.2.2 差异表达基因的筛选第17-18页
        1.2.3 差异表达基因的GO富集分析和KEGG信号通路分析第18-19页
    1.3 小结第19-20页
第2章 结直肠癌差异表达基因的加权基因共表达网络分析第20-34页
    2.1 材料和方法第20-23页
        2.1.1 基因芯片的数据来源与差异表达基因的分析第20页
        2.1.2 加权基因共表达网络分析第20-22页
        2.1.3 加权基因共表达网络分析模块保守性验证第22页
        2.1.4 模块基因的GO富集分析和KEGG信号通路分析第22页
        2.1.5 模块基因的生存分析第22-23页
    2.2 分析结果第23-32页
        2.2.1 差异表达基因的筛选第23页
        2.2.2 加权基因共表达网络分析第23-25页
        2.2.3 模块保守性分析第25-26页
        2.2.4 模块中基因的GO富集分析和KEGG信号通路分析第26-28页
        2.2.5 模块基因的生存分析第28-32页
    2.3 小结第32-34页
第3章 CACNA1D、RUBCNL和NEDD9蛋白质表达的免疫组织化学法验证第34-46页
    3.1 实验仪器和材料第34-36页
        3.1.1 实验所用主要仪器第34-35页
        3.1.2 实验所用试剂第35-36页
        3.1.3 实验所需试剂的配制第36页
        3.1.4 实验材料第36页
    3.2 实验方法第36-38页
        3.2.1 免疫组织化学法实验步骤第36-37页
        3.2.2 多重免疫组织化学法实验步骤第37-38页
    3.3 结果与分析第38-45页
        3.3.1 CACNA1D蛋白质在结直肠癌组织芯片上的IHC染色结果分析第38-41页
        3.3.2 RUBCNL蛋白质在结直肠癌组织芯片上的IHC染色结果分析第41-42页
        3.3.3 NEDD9蛋白质在结直肠癌组织芯片上的IHC染色结果分析第42-45页
    3.4 小结第45-46页
第4章 讨论第46-50页
第5章 结论第50-52页
参考文献第52-58页
附录第58-67页
    附录一、基因芯片信息第58-65页
    附录二、组织芯片信息第65-67页
致谢第67-68页
攻读硕士学位期间的研究成果第68-70页

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