摘要 | 第3-5页 |
ABSTRACT | 第5-6页 |
缩略词表 | 第7-10页 |
前言 | 第10-14页 |
第1章 基因芯片数据来源和差异表达基因的分析 | 第14-20页 |
1.1 材料和方法 | 第14-16页 |
1.1.1 基因芯片表达谱的数据来源 | 第14-15页 |
1.1.2 芯片数据的预处理 | 第15-16页 |
1.1.3 基因芯片数据差异表达基因的筛选 | 第16页 |
1.1.4 差异表达基因的功能富集分析 | 第16页 |
1.2 分析结果 | 第16-19页 |
1.2.1 原始数据的获取和标准化处理 | 第16-17页 |
1.2.2 差异表达基因的筛选 | 第17-18页 |
1.2.3 差异表达基因的GO富集分析和KEGG信号通路分析 | 第18-19页 |
1.3 小结 | 第19-20页 |
第2章 结直肠癌差异表达基因的加权基因共表达网络分析 | 第20-34页 |
2.1 材料和方法 | 第20-23页 |
2.1.1 基因芯片的数据来源与差异表达基因的分析 | 第20页 |
2.1.2 加权基因共表达网络分析 | 第20-22页 |
2.1.3 加权基因共表达网络分析模块保守性验证 | 第22页 |
2.1.4 模块基因的GO富集分析和KEGG信号通路分析 | 第22页 |
2.1.5 模块基因的生存分析 | 第22-23页 |
2.2 分析结果 | 第23-32页 |
2.2.1 差异表达基因的筛选 | 第23页 |
2.2.2 加权基因共表达网络分析 | 第23-25页 |
2.2.3 模块保守性分析 | 第25-26页 |
2.2.4 模块中基因的GO富集分析和KEGG信号通路分析 | 第26-28页 |
2.2.5 模块基因的生存分析 | 第28-32页 |
2.3 小结 | 第32-34页 |
第3章 CACNA1D、RUBCNL和NEDD9蛋白质表达的免疫组织化学法验证 | 第34-46页 |
3.1 实验仪器和材料 | 第34-36页 |
3.1.1 实验所用主要仪器 | 第34-35页 |
3.1.2 实验所用试剂 | 第35-36页 |
3.1.3 实验所需试剂的配制 | 第36页 |
3.1.4 实验材料 | 第36页 |
3.2 实验方法 | 第36-38页 |
3.2.1 免疫组织化学法实验步骤 | 第36-37页 |
3.2.2 多重免疫组织化学法实验步骤 | 第37-38页 |
3.3 结果与分析 | 第38-45页 |
3.3.1 CACNA1D蛋白质在结直肠癌组织芯片上的IHC染色结果分析 | 第38-41页 |
3.3.2 RUBCNL蛋白质在结直肠癌组织芯片上的IHC染色结果分析 | 第41-42页 |
3.3.3 NEDD9蛋白质在结直肠癌组织芯片上的IHC染色结果分析 | 第42-45页 |
3.4 小结 | 第45-46页 |
第4章 讨论 | 第46-50页 |
第5章 结论 | 第50-52页 |
参考文献 | 第52-58页 |
附录 | 第58-67页 |
附录一、基因芯片信息 | 第58-65页 |
附录二、组织芯片信息 | 第65-67页 |
致谢 | 第67-68页 |
攻读硕士学位期间的研究成果 | 第68-70页 |