| 摘要 | 第3-4页 |
| ABSTRACT | 第4页 |
| 第1章 前言 | 第8-14页 |
| 1.1 研究背景 | 第8-10页 |
| 1.2 国内外现状 | 第10-11页 |
| 1.3 本文主要内容 | 第11-14页 |
| 第2章 数据的采集 | 第14-16页 |
| 2.1 蛋白质与多肽结合位点的定义 | 第14页 |
| 2.2 BIOLIP数据库介绍 | 第14-15页 |
| 2.3 数据集概况 | 第15-16页 |
| 第3章 模型的构建 | 第16-24页 |
| 3.1 从头预测算法SVMpep的开发 | 第16-20页 |
| 3.1.1 基于固有无序的特征 | 第17-18页 |
| 3.1.2 基于二级结构的特征 | 第18页 |
| 3.1.3 基于特异性矩阵谱文件的特征 | 第18-19页 |
| 3.1.4 基于隐马尔科夫模型的特征 | 第19-20页 |
| 3.1.5 支持向量机 | 第20页 |
| 3.2 综合预测方法PepBind的开发 | 第20-24页 |
| 3.2.1 基于模板方法S-SIE、TM-SITE的介绍 | 第20-21页 |
| 3.2.2 综合预测算法PepBind的开发 | 第21-24页 |
| 第4章 模型的评估 | 第24-32页 |
| 4.1 评估标准 | 第24-26页 |
| 4.2 从头预测算法SVMpep的结果评估 | 第26-28页 |
| 4.2.1 参数优化 | 第26-27页 |
| 4.2.2 特征贡献 | 第27-28页 |
| 4.2.3 对从头预测算法SVMpep的分析 | 第28页 |
| 4.3 综合预测算法PepBind的结果评估 | 第28-32页 |
| 4.3.1 基于模板方法S-SITE、TM-SITE的预测 | 第29页 |
| 4.3.2 综合预测算法PepBind各部分贡献 | 第29-30页 |
| 4.3.3 对综合预测算法PepBind的分析 | 第30-32页 |
| 第5章 与现有方法的比较 | 第32-36页 |
| 5.1 与基于序列的方法SPRINT-Seq比较 | 第32-33页 |
| 5.2 与基于结构的方法SPRINT-Str比较 | 第33-36页 |
| 第6章 在线服务器的搭建 | 第36-38页 |
| 第7章 结论与展望 | 第38-40页 |
| 参考文献 | 第40-44页 |
| 发表论文和参加科研情况说明 | 第44-46页 |
| 致谢 | 第46页 |