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双峰驼遗传变异图谱及线粒体基因组群体遗传多样性研究

摘要第2-4页
abstract第4-6页
缩略语表第12-13页
第一章 文献综述第13-37页
    1.1 引言第13-14页
    1.2 双峰驼的生物学特性第14-16页
        1.2.1 极强的耐饥能力第14页
        1.2.2 极强的耐渴能力第14-15页
        1.2.3 对荒漠沙地的适应性第15-16页
        1.2.4 极强的耐热耐寒能力第16页
    1.3 双峰驼的品种特性第16-27页
        1.3.1 中国家养双峰驼品种资源第16-21页
        1.3.2 蒙古国家养双峰驼品种资源第21-23页
        1.3.3 哈萨克斯坦双峰驼品种资源第23-24页
        1.3.4 俄罗斯双峰驼品种资源第24-25页
        1.3.5 伊朗双峰驼品种资源第25页
        1.3.6 野生双峰驼品种资源第25-27页
    1.4 双峰驼的进化与驯化过程第27-30页
        1.4.1 双峰驼的进化过程第27-29页
        1.4.2 双峰驼的驯化过程第29-30页
    1.5 双峰驼群体遗传多样性的分子生物学研究第30-34页
        1.5.1 微卫星标记第30-31页
        1.5.2 线粒体基因组序列第31-32页
        1.5.3 Y染色体序列第32-33页
        1.5.4 全基因组SNP位点第33-34页
    1.6 研究意义和科学问题第34-35页
    1.7 研究内容第35-37页
        1.7.1 双峰驼基因组遗传变异图谱第35页
        1.7.2 基因组D-loop区双峰驼遗传多样性与群体结构分析第35-36页
        1.7.3 基于双峰驼线粒体基因组Cytb基因的系统发育分析第36-37页
第二章 双峰驼基因组遗传变异图谱第37-60页
    2.1 前言第37-38页
    2.2 试验材料与方法第38-41页
        2.2.1 样品采集第38-39页
        2.2.2 主要仪器设备第39-40页
        2.2.3 主要试剂药品第40页
        2.2.4 主要制剂的配置第40页
        2.2.5 主要试验步骤第40-41页
    2.3 数据分析第41-45页
        2.3.1 测序数据的质量评估第41-42页
        2.3.2 与参考基因组的比对第42页
        2.3.3 基因组变异位点的检测第42-43页
        2.3.4 SNP和Indel数据的分型第43页
        2.3.5 双峰驼群体结构分析第43-44页
        2.3.6 连锁不平衡的计算第44页
        2.3.7 双峰驼群体遗传多样性分析第44-45页
    2.4 结果与分析第45-56页
        2.4.1 骆驼种质资源基础信息第45-47页
        2.4.2 SNP分型第47-49页
        2.4.3 Indel分型第49-50页
        2.4.4 群体基因组学分析第50-54页
        2.4.5 连锁不平衡的分析第54页
        2.4.6 遗传多样性分析第54-56页
    2.5 结论第56-57页
    2.6 讨论第57-60页
        2.6.1 骆驼基因组遗传变异图谱的构建第57页
        2.6.2 家养双峰驼和野生双峰驼的遗传分化第57-58页
        2.6.3 家养双峰驼和野生双峰驼的遗传多样性第58-59页
        2.6.4 家养双峰驼群体遗传结构第59-60页
第三章 线粒体D-loop区的双峰驼遗传多样性与群体结构分析第60-73页
    3.1 引言第60-61页
    3.2 试验材料与方法第61-65页
        3.2.1 样品选择第61-62页
        3.2.2 主要仪器设备和试剂药品第62-63页
        3.2.3 试验方法第63-65页
        3.2.4 统计分析第65页
    3.3 结果与分析第65-71页
        3.3.1 线粒体D-loop区序列碱基组成及序列变异分析第65-67页
        3.3.2 线粒体DNAD-loop序列单倍型多样性分析第67-68页
        3.3.3 D-loop区序列系统进化及单倍型网络图分析第68-71页
    3.4 结论与讨论第71-73页
        3.4.1 线粒体D-loop区序列双峰驼遗传多样性第71-72页
        3.4.2 家养双峰驼的遗传多样性及地理关系第72页
        3.4.3 家养双峰驼母系起源进化第72-73页
第四章 线粒体基因组Cytb基因的系统发育分析第73-86页
    4.1 引言第73-75页
    4.2 试验材料与方法第75-78页
        4.2.1 样品选择第75-76页
        4.2.2 主要仪器和试剂第76页
        4.2.3 试验方法第76-77页
        4.2.4 数据处理及统计分析第77-78页
    4.3 结果与分析第78-83页
        4.3.1 Cytb基因组的核苷酸组成第78-79页
        4.3.2 线粒体Cytb基因序列单倍型多样性分析第79-81页
        4.3.3 线粒体Cytb基因单倍型网络图及系统进化分析第81-83页
    4.4 结论第83-84页
    4.5 讨论第84-86页
第五章 结论第86-88页
    5.1 双峰驼基因组遗传变异图谱第86页
    5.2 D-loop区序列双峰驼遗传多样性与群体结构分析第86-87页
    5.3 双峰驼线粒体基因组Cytb基因的系统发育分析第87-88页
致谢第88-89页
参考文献第89-100页
作者简介第100-101页

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