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藻胆蛋白裂合酶CpcE/F和PecE/F的结构和催化机制研究

摘要第7-9页
Abstract第9-10页
缩略语表第11-12页
1 序言第12-32页
    1.1 藻胆体和藻胆蛋白第12-22页
        1.1.1 藻胆体第12-15页
        1.1.2 藻胆蛋白第15-19页
        1.1.3 藻胆色素第19-20页
        1.1.4 连接蛋白第20-22页
    1.2 藻胆蛋白裂合酶第22-28页
        1.2.1 S/U型裂合酶第22-23页
        1.2.2 T型裂合酶第23-25页
        1.2.3 E/F型裂合酶第25-26页
        1.2.4 藻胆蛋白的生物合成第26-27页
        1.2.5 藻胆体的降解第27-28页
    1.3 能量传递和光保护第28-29页
    1.4 光敏色素第29-30页
    1.5 本研究目的与意义第30-32页
2 裂合酶CpcE/F和PecE/F的结构和功能第32-92页
    2.1 引言第32-33页
    2.2 实验材料、试剂和仪器第33-36页
        2.2.1 实验材料第33-34页
        2.2.2 实验试剂第34-35页
        2.2.3 实验仪器第35-36页
    2.3 实验方法第36-62页
        2.3.1 pET-cpcE-Ch和pET-cpcF-Ch质粒的构建第36-41页
        2.3.2 pET-cpcE和pET-cpcF质粒的构建第41-42页
        2.3.3 CpcE/F蛋白复合物的表达和纯化第42-44页
        2.3.4 CpcE/F蛋白复合物的结晶第44-45页
        2.3.5 CpcE/F蛋白复合物的结构解析第45-46页
        2.3.6 裂合酶CpcE/F催化CpcA在E.coli体内色素化第46-49页
        2.3.7 CpcE/F蛋白复合物的聚集态和结合色素活性第49-54页
        2.3.8 裂合酶CpcE/F催化PCB-CpcA去色素化第54-56页
        2.3.9 裂合酶CpcE/F催化CpcA在体外色素化第56-57页
        2.3.10 裂合酶PecE/F的结构和功能第57-60页
        2.3.11 NblB蛋白的结构和功能第60-62页
    2.4 结果与分析第62-90页
        2.4.1 pET-cpcE-Ch和pET-cpcF-Ch质粒的酶切检测第62-63页
        2.4.2 pET-cpcE和pET-cpcF质粒的酶切检测第63-64页
        2.4.3 CpcE/F蛋白复合物的纯化结果第64-66页
        2.4.4 CpcE/F蛋白复合物的晶体第66-69页
        2.4.5 CpcE/F蛋白复合物的结构分析第69-73页
        2.4.6 裂合酶CpcE/F催化CpcA在E.coli体内色素化分析第73-77页
        2.4.7 CpcE/F蛋白复合物的聚集态和结合色素活性分析第77-78页
        2.4.8 裂合酶CpcE/F催化PCB-CpcA去色素化分析第78-81页
        2.4.9 裂合酶CpcE/F催化CpcA在体外色素化分析第81-82页
        2.4.10 裂合酶PecE/F的结构和功能分析第82-87页
        2.4.11 NblB蛋白的结构和功能分析第87-90页
    2.5 讨论第90-92页
3 裂合酶CpcE/F和PecE/F的催化机制第92-112页
    3.1 引言第92-93页
    3.2 实验材料和软件第93-94页
        3.2.1 实验材料第93页
        3.2.2 软件和网站第93-94页
    3.3 实验方法第94-95页
        3.3.1 裂合酶和PCB复合物的模型第94页
        3.3.2 裂合酶与藻胆蛋白的docking模型第94-95页
    3.4 结果与分析第95-109页
        3.4.1 裂合酶和PCB复合物的模型分析第95-100页
        3.4.2 裂合酶与藻胆蛋白的docking模型分析第100-109页
    3.5 讨论第109-112页
4 总结与展望第112-114页
参考文献第114-131页
附录 攻读学位期间发表的学术论文第131-132页
    SCI论文第131页
    会议论文和摘要第131-132页
致谢第132-133页

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