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应用ABEEMσπ/MM方法探讨寡肽的稳定构象

摘要第4-5页
Abstract第5-6页
引言第9-11页
1 基本理论方法第11-24页
    1.1 肽的介绍第11-12页
    1.2 脑啡肽的介绍第12-15页
    1.3 构象介绍第15-16页
    1.4 分子力场方法(MM)第16-18页
    1.5 原子-键电负性均衡方法(ABEEMσπ方法)第18-23页
    1.6 ABEEMσπ/MM方法第23-24页
2 采用从头算和力场方法探究三肽的稳定构象第24-67页
    2.1 Gly-Thr三肽第24-46页
        2.1.1 从头算方法的结果第24-31页
            2.1.1.1 排列组合二肽的稳定结构第27-28页
            2.1.1.2 优化Gly-Thr三肽的不同构象第28-31页
        2.1.2 不同力场下的稳定构象第31-46页
            2.1.2.1 三肽的稳定构象第31-40页
            2.1.2.2 几何结构比较第40-42页
            2.1.2.3 能量比较第42-46页
    2.2 Thr-Gly三肽第46-67页
        2.2.1 从头算方法的结果第46-51页
            2.2.1.1 排列组合二肽的稳定结构第46-47页
            2.2.1.2 优化Thr-Gly三肽的不同构象第47-51页
        2.2.2 不同力场下的稳定构象第51-67页
            2.2.2.1 三肽的稳定构象第51-60页
            2.2.2.2 几何结构比较第60-62页
            2.2.2.3 能量比较第62-67页
3 采用从头算和力场方法探究甲硫氨酸-脑啡肽六肽的稳定构象第67-89页
    3.1 初始构象获取第67-68页
    3.2 优化初始构象第68-74页
        3.2.1 优化六肽的不同构象第69-74页
    3.3 不同力场下的稳定构象第74-89页
        3.3.1 六肽的稳定构象第74-81页
        3.3.2 几何结构比较第81-84页
        3.3.3 能量比较第84-89页
4 不同力场下优化获得三肽和六肽稳定构象与从头算的结果对比第89-91页
结论第91-93页
参考文献第93-98页
攻读硕士学位期间发表学术论文情况第98-99页
致谢第99页

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