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家蚕神经轴突导向因子Slit的功能及其进化机制研究

符号说明第5-11页
中文摘要第11-13页
Abstract第13-15页
1 前言第16-36页
    1.1 家蚕神经系统研究进展第16-23页
        1.1.1 家蚕神经系统构造及功能第16-18页
        1.1.2 家蚕神经系统中的信号传递第18-20页
            1.1.2.1 神经递质第18-19页
            1.1.2.2 离子通道第19页
            1.1.2.3 神经肽第19-20页
        1.1.3 家蚕神经发育及调控的研究第20-21页
        1.1.4 家蚕神经的研究方法第21-23页
            1.1.4.1 电生理学方法第22页
            1.1.4.2 免疫细胞化学法第22页
            1.1.4.3 转基因方法第22页
            1.1.4.4 神经相关数据库的建立第22-23页
            1.1.4.5 三维重建第23页
    1.2 神经轴突导向因子Slit的功能及其分子作用机制研究进展第23-33页
        1.2.1 Slit蛋白的结构第24页
        1.2.2 Slit的主要功能第24-28页
            1.2.2.1 对神经轴突生长方向的排斥导向作用第24-26页
            1.2.2.2 控制细胞迁移第26-27页
            1.2.2.3 影响神经细胞的分裂和形态分化第27-28页
            1.2.2.4 对血管和心脏形成的作用第28页
        1.2.3 Slit的分子作用机制第28-32页
            1.2.3.1 Robo受体第28-29页
            1.2.3.2 硫酸肝素蛋白多糖第29-30页
            1.2.3.3 GTP酶激活蛋白第30-31页
            1.2.3.4 酪氨酸激酶第31页
            1.2.3.5 细胞内钙离子第31页
            1.2.3.6 Netrin、Semaphorin、Ephrin信号第31-32页
            1.2.3.7 MicroRNA-218对Slit功能的影响第32页
        1.2.4 slit基因的表达调控研究第32-33页
            1.2.4.1 转录水平调控第32页
            1.2.4.2 转录后水平调控第32-33页
    1.3 蛋白质共进化的研究方法第33-34页
        1.3.1 系统发生谱的相似性第33-34页
        1.3.2 进化树的相似性第34页
        1.3.3 氨基酸水平的共进化第34页
    1.4 本研究的目的与意义第34-36页
2 材料与方法第36-59页
    2.1 材料第36-43页
        2.1.1 实验动物第36页
        2.1.2 质粒和菌株第36页
        2.1.3 生化试剂第36-41页
            2.1.3.1 试剂及试剂盒第36-38页
            2.1.3.2 主要试剂的配制第38-41页
        2.1.4 PCR引物第41页
        2.1.5 主要软件和数据库第41-42页
        2.1.6 主要仪器设备第42-43页
    2.2 方法第43-59页
        2.2.1 Bmslit基因的克隆第43-48页
            2.2.1.1 Bmslit基因的鉴定第43页
            2.2.1.2 家蚕总RNA的提取第43-44页
            2.2.1.3 cDNA第一链的合成第44-45页
            2.2.1.4 PCR和RACE第45-46页
            2.2.1.5 DNA片段的琼脂糖凝胶回收第46页
            2.2.1.6 连接反应第46页
            2.2.1.7 连接产物的转化第46-47页
            2.2.1.8 重组质粒的筛选与测序第47页
            2.2.1.9 质粒提取第47-48页
        2.2.2 小鼠抗BmSlit多克隆抗体的制备第48-54页
            2.2.2.1 抗原片段的选择与PCR扩增第48页
            2.2.2.2 原核表达载体的构建第48-50页
            2.2.2.3 重组质粒的原核表达第50页
            2.2.2.4 SDS-PAGE电泳第50-51页
            2.2.2.5 重组蛋白的纯化第51-53页
            2.2.2.6 动物免疫第53页
            2.2.2.7 ELISA第53页
            2.2.2.8 Western blot第53-54页
        2.2.3 BmSlit体内存在形式检测第54页
        2.2.4 抗体染色第54-55页
        2.2.5 Bmslit的RNAi分析第55-57页
            2.2.5.1 Bmslit dsRNA的制备第55-56页
            2.2.5.2 显微注射第56-57页
        2.2.6 序列收集第57页
        2.2.7 多序列比对第57页
        2.2.8 进化树构建第57页
        2.2.9 Slit-Robo相互作用氨基变化分析第57页
        2.2.10 镜像树法(Mirror Tree)第57页
        2.2.11 选择压力检测第57-59页
3 结果与分析第59-83页
    3.1 Bmslit基因的功能研究第59-73页
        3.1.1 Bmslit基因的序列分析第59-65页
        3.1.2 小鼠抗BmSlit多克隆抗体能与抗原发生特异性免疫反应第65-67页
            3.1.2.1 重组质粒的鉴定第65-66页
            3.1.2.2 重组蛋白的原核表达及纯化第66页
            3.1.2.3 小鼠抗BmSlit多克隆抗体效价的检测第66-67页
        3.1.3 BmSlit在体内存在水解片段第67-68页
        3.1.4 BmSlit的组织定位第68-69页
        3.1.5 BmSlit和BmRobo1在轴突、肌肉和丝腺共定位第69-70页
        3.1.6 Bmslit基因的RNAi表型第70-73页
    3.2 Slit的进化机制研究第73-83页
        3.2.1 Slit的系统发生分析第73-74页
        3.2.2 Slit配体与Robo受体共进化的依据第74-83页
            3.2.2.1 Slit配体与Robo受体的相互作用氨基酸之间存在协调变化第74-75页
            3.2.2.2 Slit配体与Robo受体之间存在较高的进化距离相关系数第75-76页
            3.2.2.3 Slit配体与Robo受体在相同物种鉴定到正选择第76-83页
4 讨论第83-87页
    4.1 BmSlit的功能第83-84页
        4.1.1 BmSlit在神经中的功能第83页
        4.1.2 BmSlit在肌肉中的功能第83-84页
        4.1.3 BmSlit在丝腺中的功能第84页
    4.2 slit基因的进化第84-87页
        4.2.1 slit基因的起源与进化第84页
        4.2.2 Slit配体与Robo受体的共进化第84-87页
            4.2.2.1 相互作用位点的变化与共进化第84-85页
            4.2.2.2 相关分析与共进化第85页
            4.2.2.3 正选择与共进化第85-87页
5 结论第87-88页
参考文献第88-102页
附录第102-116页
致谢第116-117页
攻读学位期间发表论文情况第117页

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