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恰塔努加链霉菌纳他霉素生物合成的途径特异性调控机制研究

摘要第7-8页
Abstract第8-9页
缩略词和术语表第10-11页
目录第11-14页
第一章 绪论第14-24页
    1.1 纳他霉素概述第14-15页
        1.1.1 纳他霉素的特性第14页
        1.1.2 纳他霉素的应用第14-15页
    1.2 纳他霉素生物合成研究进展第15-16页
    1.3 链霉菌次级代谢调控研究进展第16-21页
        1.3.1 全局性调控第16-17页
        1.3.2 多效性调控第17-18页
        1.3.3 途径特异性调控第18-21页
    1.4 微生物胆固醇氧化酶的研究进展第21-22页
        1.4.1 胆固醇氧化酶的催化机理第21-22页
        1.4.2 微生物中胆固醇氧化酶的生物学作用第22页
    1.5 本实验研究内容第22-24页
第二章 途径特异性调控因子ScnRII的调控机制研究第24-37页
    2.1 引言第24页
    2.2 实验材料第24-27页
        2.2.1 菌株或者质粒第24-25页
        2.2.2 引物列表第25页
        2.2.3 主要仪器与设备第25-26页
        2.2.4 培养基及培养条件第26-27页
        2.2.5 常用试剂第27页
    2.3 实验方法第27-31页
        2.3.1 PCR第27-28页
        2.3.2 大肠杆菌质粒抽提第28-29页
        2.3.3 核酸片段割胶回收第29页
        2.3.4 大肠杆菌感受态细胞的制备第29页
        2.3.5 大肠杆菌感受态细胞的转化第29页
        2.3.6 大肠杆菌重组蛋白表达第29页
        2.3.7 大肠杆菌重组蛋白纯化第29-30页
        2.3.8 凝胶阻滞电泳(EMSA)第30-31页
    2.4 结果第31-35页
        2.4.1 表达载体pGEX-2T-scnRII的构建第31页
        2.4.2 ScnRII蛋白的表达纯化第31-32页
        2.4.3 ScnRII与纳他霉素生物合成基因簇上特定基因的启动子区域结合第32-34页
        2.4.4 ScnRII中PAS结构域对ScnRII结合启动子能力的影响第34-35页
    2.5 本章小结及讨论第35-37页
第三章 途径特异性调控因子ScnRI的调控机制研究第37-62页
    3.1 引言第37页
    3.2 实验材料第37-41页
        3.2.1 菌株或者质粒第37-38页
        3.2.2 引物列表第38-39页
        3.2.3 主要仪器与设备第39-40页
        3.2.4 培养基及培养条件第40页
        3.2.5 常用试剂第40-41页
    3.3 实验方法第41-48页
        3.3.1 PCR第41页
        3.3.2 大肠杆菌质粒抽提第41页
        3.3.3 核酸片段割胶回收第41页
        3.3.4 大肠杆菌感受态细胞的制备第41页
        3.3.5 大肠杆菌感受态细胞的转化第41页
        3.3.6 大肠杆菌重组蛋白表达第41页
        3.3.7 大肠杆菌重组蛋白纯化第41-42页
        3.3.8 凝胶阻滞电泳(EMSA)第42页
        3.3.9 RNA提取第42-43页
        3.3.10 反转录第43页
        3.3.11 Real-time PCR第43-44页
        3.3.12 链霉菌基因组抽提第44页
        3.3.13 恰塔努加链霉菌孢子悬液的制备第44页
        3.3.14 发酵液中纳他霉素含量测定第44-45页
        3.3.15 定点突变第45-46页
        3.3.16 ATP酶活测定第46-48页
    3.4 结果第48-60页
        3.4.1 ScnRI的结构域分析第48页
        3.4.2 scnRI回补菌株的构建第48-50页
        3.4.3 scnRI缺失株中纳他霉素基因簇转录水平分析第50-52页
        3.4.4 表达载体pGEX-2T-scnRI与pGEX-2T-scnRI~(DBD)的构建第52-54页
        3.4.5 蛋白的表达纯化第54-55页
        3.4.6 ScnRI不能直接与纳他霉素合成基因的启动子区域结合第55-56页
        3.4.7 ScnRI与scnRI-scnRII基因间隔区的结合第56-57页
        3.4.8 ScnRI对途径特异性调控基因scnRII的正调控第57-58页
        3.4.9 ScnRI蛋白体外ATP酶活测定第58页
        3.4.10 ScnRI定点突变以及体内回补第58-60页
    3.5 本章小结及讨论第60-62页
第四章 ScnE与ScnRI、ScnRII的协同调控机制初探第62-76页
    4.1 引言第62页
    4.2 实验材料第62-65页
        4.2.1 菌株或者质粒第62-63页
        4.2.2 引物列表第63页
        4.2.3 主要仪器与设备第63-64页
        4.2.4 培养基及培养条件第64页
        4.2.5 常用试剂第64-65页
    4.3 实验方法第65-69页
        4.3.1 PCR第65页
        4.3.2 大肠杆菌质粒抽提第65页
        4.3.3 核酸片段割胶回收第65页
        4.3.4 大肠杆菌感受态细胞的制备第65页
        4.3.5 PCR Targeting敲除技术第65-68页
        4.3.6 Southern blot第68-69页
    4.4 结果第69-75页
        4.4.1 scnE缺失株的构建第69页
        4.4.2 scnE缺失株的验证第69-70页
        4.4.3 scnE信号肽预测第70-71页
        4.4.4 scnE信号肽切除的回补菌株构建第71-72页
        4.4.5 scnE缺失株纳他霉素的测定第72-73页
        4.4.6 途径特异性调控基因scnRI与scnRII对scnE的调控第73-75页
    4.5 本章小结及讨论第75-76页
第五章 结论与展望第76-78页
    5.1 本文结论第76页
    5.2 展望第76-78页
参考文献第78-81页
攻读硕士学位期间的主要研究成果第81-82页
致谢第82页

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