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PRRSV Shaanxi-1株分离鉴定、全基因测序及遗传进化分析

摘要第1-7页
ABSTRACT第7-13页
文献综述第13-24页
 第一章 PRRSV 的基本特征与感染性克隆的研究进展第13-24页
   ·PRRSV 的基本特征第13-18页
     ·PRRSV 的形态特征第13-14页
     ·PRRSV 的繁殖与复制第14页
     ·PRRSV 的理化特性第14-15页
     ·PRRSV 的培养特性第15-16页
     ·PRRSV 基因组结构特征第16页
     ·PRRSV 基因组编码产物及功能第16-18页
       ·病毒基因组编码的非结构蛋白和功能第16-17页
       ·病毒基因组编码的次要结构蛋白和功能第17-18页
       ·病毒基因组编码的主要结构蛋白和功能第18页
   ·PRRSV 感染性克隆的研究第18-23页
     ·病毒反向遗传操作原理第18-19页
     ·构建病毒基因组全长cDNA 克隆第19-20页
     ·感染性转录物的产生第20-21页
       ·体内转录第20页
       ·体外转录第20-21页
     ·感染性克隆的产生与鉴定第21-22页
     ·病毒的拯救第22页
     ·PRRSV 感染性克隆的历史和发展第22-23页
   ·结语第23-24页
试验研究第24-65页
 第二章 PRRSV SHAANXI-1 株的分离与鉴定第24-34页
   ·实验材料第24-26页
     ·主要试验仪器第24页
     ·主要试剂第24-25页
     ·试验病料第25页
     ·试验细胞、高免血清及单抗第25页
     ·主要试剂的配制第25-26页
       ·细胞培养相关试剂的配制第25页
       ·琼脂凝胶电泳相关试剂的配制第25-26页
   ·试验方法第26-28页
     ·引物设计第26页
     ·病料的采集及处理第26页
     ·细胞培养第26-27页
     ·病毒的增殖第27页
     ·RT-PCR 检测第27-28页
       ·病毒总RNA 的提取第27页
       ·RT-PCR 反应第27-28页
     ·病毒中和试验第28页
     ·TCID_(50) 测定第28页
     ·间接免疫荧光检测第28页
   ·结果第28-31页
     ·病料RT-PCR 检测结果第28-29页
     ·病毒分离结果第29-30页
     ·血清中和试验结果第30页
     ·RT-PCR 鉴定病毒增殖结果第30页
     ·TCID_(50) 测定结果第30-31页
     ·间接免疫荧光检测结果第31页
   ·讨论第31-33页
     ·PRRSV 的流行情况第31-32页
     ·病料组织的选择第32页
     ·病毒的分离培养与鉴定第32-33页
   ·小结第33-34页
 第三章 PRRSV SHAANXI-1 株全基因组序列扩增与测定第34-45页
   ·实验材料第34-36页
     ·毒株、菌株、载体与细胞第34-35页
     ·主要仪器第35页
     ·试剂和耗材第35页
     ·试验相关试剂的配制第35-36页
       ·细胞培养相关试剂的配制第35页
       ·RT-PCR 相关试剂的配制第35页
       ·细菌培养基的配制第35-36页
     ·分子生物学分析软件第36页
   ·试验方法第36-41页
     ·PRRSV 病毒的增殖第36页
     ·引物设计第36-37页
     ·PRRSV 感染的Marc-145 细胞中病毒总RNA 的提取第37页
     ·全基因RT-PCR 扩增第37-38页
     ·PCR 产物的纯化及cDNA 片段的回收第38页
     ·纯化产物与pMD-18T Vector 连接第38页
     ·感受态细胞的制备(CaC1_2 法)第38-39页
     ·连接产物的转化第39页
     ·重组质粒的提取第39-40页
     ·重组质粒的PCR 鉴定第40页
     ·重组质粒的酶切鉴定第40页
     ·重组质粒的测序分析第40-41页
   ·结果与分析第41-43页
     ·PRRSV Shaanxi-1 株全基因RT-PCR 扩增第41-42页
     ·全基因序列拼接结果第42-43页
   ·讨论第43-44页
   ·小结第44-45页
 第四章 PRRSV SHAANXI-1 基因组分子遗传特征分析第45-65页
   ·材料第45-47页
     ·PRRSV 基因组全长序列来源第45-47页
     ·分子生物学分析软件第47页
   ·方法第47页
     ·PRRSV Shaanxi-1 株基因组序列比对分析第47页
     ·PRRSV Shaanxi-1 基因组进化树分析第47页
     ·RRSV Shaanxi-1 株毒力相关氨基酸的推测与变异分析第47页
   ·结果第47-60页
     ·PRRSV Shaanxi-1 株基因组序列比对分析结果第47-59页
       ·5’UTR 和3’UTR 序列分析第47页
       ·非结构蛋白的结果与分析第47-49页
       ·Nsp2 的结果与分析第49-51页
       ·结构蛋白的序列分析第51-52页
       ·GP2第52-53页
       ·GP3第53-55页
       ·GP4第55-56页
       ·GP5第56-57页
       ·M第57-59页
       ·N第59页
     ·PRRSV Shaanxi-1 株毒力相关氨基酸的变异分析结果第59-60页
     ·全基因的系统进化分析第60页
   ·讨论第60-64页
     ·Shaanxi-1 株 5’UTR 及 3’UTR 的遗传变异第60-61页
     ·Shaanxi-1 株非结构蛋白的遗传变异第61-62页
     ·Shaanxi-1 株结构蛋白编码区的遗传变异第62-63页
     ·PRRSV Shaanxi-1 和 Shaanxi-2 毒株致病性分析第63-64页
   ·小结第64-65页
结论第65-66页
参考文献第66-73页
英文缩略词及中英文对照第73-74页
致谢第74-75页
作者简介第75页

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