| 附录一、本文中英文简写对照表 | 第6-8页 |
| 附录二、本文所用程序代码 | 第8-12页 |
| 中文摘要 | 第12-14页 |
| 英文摘要 | 第14-15页 |
| 第一章 前言 | 第16-29页 |
| 1 课题的研究背景及意义 | 第16-29页 |
| 1.1 肿瘤个体化治疗与基因检测 | 第17-18页 |
| 1.2 肿瘤细胞在筛选耐药机制实验中的应用、局限及改进 | 第18-20页 |
| 1.3 差异基因的筛选方法及存在问题 | 第20-24页 |
| 1.4 常用数据库介绍 | 第24-27页 |
| 1.5 本论文主要研究内容及意义 | 第27-29页 |
| 第二章 人结肠癌耐药细胞的培养与药物处理 | 第29-40页 |
| 1 引言 | 第29-30页 |
| 2 细胞培养及药物处理 | 第30-35页 |
| 2.1 试剂与仪器 | 第30-31页 |
| 2.2 细胞复苏与细胞 5-氟尿嘧啶IC50的测定 | 第31-32页 |
| 2.3 药物处理方案 | 第32-33页 |
| 2.4 核酸提取与质量检验 | 第33-35页 |
| 3 结果 | 第35-38页 |
| 3.1 MTT法测定亲本、耐药细胞 5-氟尿嘧啶的IC50： | 第35-36页 |
| 3.2 核酸质量检验 | 第36-38页 |
| 4 讨论 | 第38-39页 |
| 5 本章小结 | 第39-40页 |
| 第三章 亲本及耐药细胞的转录组、表观遗传组的检测 | 第40-50页 |
| 1 引言 | 第40-41页 |
| 2 高通量基因芯片实验 | 第41-47页 |
| 2.1 基因芯片实验所需关键试剂及仪器 | 第41-45页 |
| 2.2 Affymetrix Prime View芯片实验 | 第45-46页 |
| 2.3 HumanMethylaton450 BeadChip芯片实验 | 第46-47页 |
| 3 结果 | 第47-49页 |
| 3.1 表达谱芯片数据 | 第47-48页 |
| 3.2 甲基化谱芯片数据 | 第48-49页 |
| 4 讨论 | 第49页 |
| 5 本章小结 | 第49-50页 |
| 第四章 耐药基因的筛选及相关表观遗传学机制 | 第50-78页 |
| 1 引言 | 第50-52页 |
| 2 耐药相关差异表达、差异DNA甲基化基因及相关耐药机理 | 第52-57页 |
| 2.1 基因表达谱芯片数据与分析方法 | 第52-55页 |
| 2.2 DNA甲基化谱芯片数据与分析方法 | 第55页 |
| 2.3 差异表达、DNA甲基化基因的一致性评价方法 | 第55-56页 |
| 2.4 蛋白质-蛋白质互相作用分析 | 第56页 |
| 2.5 耐药相关基因功能富集分析方法 | 第56-57页 |
| 3 结果与分析 | 第57-75页 |
| 3.1 基因表达谱芯片数据分析结果 | 第57-70页 |
| 3.2 引起获得性耐药的表观遗传学机制 | 第70-73页 |
| 3.3 候选耐药相关基因的蛋白质-蛋白质互相作用网络分析结果 | 第73-74页 |
| 3.4 功能富集分析结果 | 第74-75页 |
| 4 讨论 | 第75-76页 |
| 5 本章小结 | 第76-78页 |
| 第五章 总结与展望 | 第78-80页 |
| 文献综述 | 第80-85页 |
| 1. 药物基因组学的主要研究内容 | 第80-82页 |
| 2. 生物信息学基本方法 | 第82页 |
| 3. 差异基因筛选相关实验 | 第82-83页 |
| 4. 药物基因组学与新药研发 | 第83页 |
| 5. 药物基因组学与合理用药 | 第83-85页 |
| 参考文献 | 第85-98页 |
| 攻读博士学位期间所发表的论文 | 第98-99页 |
| 致谢 | 第99页 |
