| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-21页 |
| 1.1 研究蛋白质结构的意义 | 第10-11页 |
| 1.2 研究淀粉样纤维的形成机制 | 第11-13页 |
| 1.2.1 借助实验手段研究Aβ 肽的自组装 | 第11-12页 |
| 1.2.2 采用分子动力学模拟研究淀粉样纤维的形成机制 | 第12-13页 |
| 1.3 Aβ 肽自组装行为的研究进展 | 第13-18页 |
| 1.3.1 研究多肽链序列对Aβ 肽自组装行为的影响 | 第14页 |
| 1.3.2 研究温度对Aβ 肽自组装行为的影响 | 第14-15页 |
| 1.3.3 研究溶剂环境对Aβ 肽自组装行为的影响 | 第15页 |
| 1.3.4 研究界面对Aβ 肽自组装行为的影响 | 第15-18页 |
| 1.4 选题意义和主要内容 | 第18-21页 |
| 第二章 分子动力学模拟 | 第21-38页 |
| 2.1 基本原理 | 第21-32页 |
| 2.1.1 分子动力学模拟简介 | 第21-22页 |
| 2.1.2 周期性边界条件 | 第22-23页 |
| 2.1.3 热力学系综 | 第23-25页 |
| 2.1.4 温度耦合 | 第25-26页 |
| 2.1.5 压力耦合 | 第26页 |
| 2.1.6 分子力场 | 第26-29页 |
| 2.1.7 求解牛顿运动方程的算法 | 第29-32页 |
| 2.2 分子动力学模拟软件 | 第32-34页 |
| 2.3 分子动力学模拟流程 | 第34-38页 |
| 2.3.1 模拟体系的搭建 | 第34-36页 |
| 2.3.2 分子动力学模拟的运行 | 第36页 |
| 2.3.3 结果分析 | 第36-38页 |
| 第三章 Aβ(16-22)多肽链在不同电量的负电表面上自组装的分子动力学研究 | 第38-49页 |
| 3.1 引言 | 第38-39页 |
| 3.2 模型与方法 | 第39-40页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第40-47页 |
| 3.4 本章小结 | 第47-49页 |
| 第四章 Aβ(16-22)多肽链在负电表面上自组装的分子动力学研究 | 第49-60页 |
| 4.1 引言 | 第49-50页 |
| 4.2 模型与方法 | 第50-51页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第51-58页 |
| 4.4 本章小结 | 第58-60页 |
| 结论与展望 | 第60-62页 |
| 参考文献 | 第62-70页 |
| 攻读硕士学位期间取得的研究成果 | 第70-71页 |
| 致谢 | 第71-72页 |
| 附件 | 第72页 |
