肝癌基因的生物信息学研究
| 中文摘要 | 第3-5页 |
| ABSTRACT | 第5-6页 |
| 第一章 引言 | 第11-19页 |
| 1.1 研究动机和研究意义 | 第11页 |
| 1.2 国内外研究现状和存在的问题 | 第11-15页 |
| 1.2.1 国内外研究现状 | 第11-14页 |
| 1.2.2 当前研究存在的问题 | 第14-15页 |
| 1.3 论文的主要工作与创新 | 第15-17页 |
| 1.3.1 论文的主要工作 | 第16页 |
| 1.3.2 论文的主要创新 | 第16-17页 |
| 1.4 论文的结构 | 第17-19页 |
| 第二章 肝癌基因模块 | 第19-36页 |
| 2.1 问题的提出及研究现状 | 第19-20页 |
| 2.2 基因社区网络 | 第20-21页 |
| 2.3 PAM 凝聚算法 | 第21-22页 |
| 2.4 PCC 模块度评估 | 第22-24页 |
| 2.5 实验结果和讨论 | 第24-34页 |
| 2.5.1 HCC 基因表达模块的获取 | 第24-29页 |
| 2.5.2 肝癌基因模块的生物学解释 | 第29-34页 |
| 2.6 本章小结 | 第34-36页 |
| 第三章 肝癌核心基因 | 第36-51页 |
| 3.1 问题的提出及研究现状 | 第36页 |
| 3.2 基因影响力的定义 | 第36-39页 |
| 3.3 核心基因筛选算法 | 第39-40页 |
| 3.4 实验结果 | 第40-46页 |
| 3.4.1 HCC 特征基因 | 第40-42页 |
| 3.4.2 HCC 候选靶基因 | 第42-43页 |
| 3.4.3 HCC 靶基因 | 第43-44页 |
| 3.4.4 HCC 核心基因 | 第44-46页 |
| 3.5 实验结果的生物学分析 | 第46-49页 |
| 3.5.1 HCC 核心基因的生物学解释 | 第46-48页 |
| 3.5.2 补锌对肝癌的防治作用 | 第48-49页 |
| 3.6 本章小结 | 第49-51页 |
| 第四章 肝癌特征免疫基因 | 第51-61页 |
| 4.1 问题的提出及研究现状 | 第51页 |
| 4.2 数据来源和基本概念 | 第51-53页 |
| 4.2.1 数据来源 | 第51-52页 |
| 4.2.2 基本概念 | 第52-53页 |
| 4.3 三层过滤模型 | 第53-55页 |
| 4.3.1 特征免疫基因需要满足的条件 | 第53页 |
| 4.3.2 特征免疫基因筛选模型 | 第53-54页 |
| 4.3.3 三层过滤算法 | 第54-55页 |
| 4.4 实验结果和讨论 | 第55-59页 |
| 4.4.1 特征免疫基因 | 第55页 |
| 4.4.2 重要的特征免疫基因及其生物功能 | 第55-57页 |
| 4.4.3 特征免疫基因的不同重要性地位 | 第57-59页 |
| 4.5 临床建议 | 第59-60页 |
| 4.6 本章小结 | 第60-61页 |
| 第五章 肝癌个性靶基因 | 第61-76页 |
| 5.1 问题的提出及研究现状 | 第61页 |
| 5.2 基因协同过滤算法 | 第61-65页 |
| 5.2.1 算法原理 | 第61-63页 |
| 5.2.2 算法步骤 | 第63-65页 |
| 5.3 评价指标 | 第65-66页 |
| 5.3.1 训练集和测试集 | 第65页 |
| 5.3.2 准确率和惩罚准确率 | 第65-66页 |
| 5.4 结果和讨论 | 第66-75页 |
| 5.4.1 数据来源和数据筛选 | 第66页 |
| 5.4.2 HCC 准确率和惩罚准确率 | 第66-71页 |
| 5.4.3 HCC 覆盖率和惩罚覆盖率 | 第71-75页 |
| 5.5 本章小结 | 第75-76页 |
| 第六章 肝癌标签基因 | 第76-91页 |
| 6.1 问题的提出及研究现状 | 第76-77页 |
| 6.2 标签基因的选择 | 第77-80页 |
| 6.2.1 数据来源和使用说明 | 第77页 |
| 6.2.2 标签基因的选择 | 第77-78页 |
| 6.2.3 基于标签基因的两种治疗方案 | 第78-80页 |
| 6.3 治疗方案分类和评分等级 | 第80-85页 |
| 6.3.1 从肝癌标签基因角度看治疗方案的分类 | 第80-83页 |
| 6.3.2 每个患者对应治疗方案的评分等级 | 第83-85页 |
| 6.4 结果和讨论 | 第85-90页 |
| 6.4.1 HCC 患者治疗方案分类及其治疗评分 | 第85-87页 |
| 6.4.2 每种 HCC 治疗方案的患者比重 | 第87-88页 |
| 6.4.3 每个患者对应的评分等级问题 | 第88-90页 |
| 6.5 小结 | 第90-91页 |
| 第七章 总结和展望 | 第91-95页 |
| 7.1 全文总结 | 第91-93页 |
| 7.2 下一步研究工作 | 第93-95页 |
| 参考文献 | 第95-104页 |
| 发表论文和科研情况说明 | 第104-105页 |
| 附录 1 本文创新的概念、算法和公式 | 第105-107页 |
| 附录 1.1 概念 | 第105页 |
| 附录 1.2 算法 | 第105页 |
| 附录 1.3 定义 | 第105-107页 |
| 附录 2 图表目录 | 第107-110页 |
| 附录 2.1 表格目录 | 第107-108页 |
| 附录 2.2 插图目录 | 第108-110页 |
| 致谢 | 第110页 |
