| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 第一章 绪论 | 第13-24页 |
| 1.1 研究目的及意义 | 第13-14页 |
| 1.2 红豆杉属植物分子标记挖掘及其应用研究 | 第14-17页 |
| 1.2.1 红豆杉属植物遗传标记的挖掘 | 第15页 |
| 1.2.2 遗传标记在红豆杉属植物群落遗传多样性方面的应用 | 第15-16页 |
| 1.2.3 分子标记的其他应用 | 第16-17页 |
| 1.3 SSR分子标记技术研究 | 第17-20页 |
| 1.3.1 基于基因组文库构建的SSR标记技术的开发 | 第17-18页 |
| 1.3.2 基于DNA数据库信息的SSR标记技术的开发 | 第18-19页 |
| 1.3.3 SSR引物的通用性分析 | 第19-20页 |
| 1.3.4 SSR标记技术的应用研究 | 第20页 |
| 1.4 植物单倍体培育技术研究 | 第20-21页 |
| 1.4.1 单倍体培养研究简史 | 第20-21页 |
| 1.4.2 单倍体培养的影响因素 | 第21页 |
| 1.5 存在的主要问题 | 第21-22页 |
| 1.6 研究内容和技术路线 | 第22-24页 |
| 1.6.1 研究内容 | 第22页 |
| 1.6.2 技术路线 | 第22-24页 |
| 第二章 红豆杉单倍体材料的培养与相关遗传学鉴定 | 第24-33页 |
| 2.1 材料与方法 | 第25-27页 |
| 2.1.1 试验材料 | 第25页 |
| 2.1.2 试验方法 | 第25-27页 |
| 2.2 结果与分析 | 第27-32页 |
| 2.2.1 愈伤组织的诱导与培养 | 第27-29页 |
| 2.2.2 倍性分析与基因组大小分析 | 第29-32页 |
| 2.3 小结 | 第32-33页 |
| 第三章 南方红豆杉细胞系群体构建及紫杉烷类代谢质物含量差异的比较 | 第33-53页 |
| 3.1 材料与方法 | 第34-38页 |
| 3.1.1 材料 | 第34页 |
| 3.1.2 单倍体愈伤组织细胞系群体构建 | 第34-35页 |
| 3.1.3 半同胞二倍体细胞系群体构建 | 第35页 |
| 3.1.4 LC-MS样品前处理 | 第35页 |
| 3.1.5 方法验证与标准曲线的绘制 | 第35-38页 |
| 3.1.6 红豆杉细胞系中4种紫杉烷类物质代谢差异分析 | 第38页 |
| 3.1.7 试验数据统计与分析 | 第38页 |
| 3.2 结果与分析 | 第38-47页 |
| 3.2.1 单倍体细胞系构建 | 第38-39页 |
| 3.2.2 半同胞二倍体细胞系构建 | 第39-45页 |
| 3.2.3 定量方法可靠性分析与标准曲线 | 第45-47页 |
| 3.2.4 南方红豆杉细胞系中4种紫杉烷类物质代谢差异分析 | 第47页 |
| 3.3 小结 | 第47-53页 |
| 第四章 红豆杉EST、fosmid及转录组UNIGENE数据库的构建与SSR分布特征及标记开发 | 第53-89页 |
| 4.1 材料与方法 | 第56-59页 |
| 4.1.1 序列来源及下载 | 第56-57页 |
| 4.1.2 EST、fosmid及转录组数据预处理 | 第57页 |
| 4.1.3 EST、fosmid及转录组数据的拼接与组装 | 第57-58页 |
| 4.1.4 Unigene数据库的构建 | 第58页 |
| 4.1.5 SSRs的搜索及引物设计 | 第58页 |
| 4.1.6 植物材料与DNA提取 | 第58页 |
| 4.1.7 PCR扩增体系的优化 | 第58-59页 |
| 4.1.8 SSRs引物的筛选 | 第59页 |
| 4.1.9 数据统计与分析 | 第59页 |
| 4.2 结果与分析 | 第59-74页 |
| 4.2.1 表达序列标签(ESTs)数据、fosmids数据和转录组数据 | 第59-62页 |
| 4.2.2 EST、fosmid及转录组数据的聚类拼接 | 第62页 |
| 4.2.3 Unigene数据库构建 | 第62-63页 |
| 4.2.4 红豆杉EST、fosmid和转录组Unigene序列的SSR分布特点 | 第63-69页 |
| 4.2.5 欧洲红豆杉、日本红豆杉、东北红豆杉和南方红豆杉转录组SSR位点的比较分析 | 第69-72页 |
| 4.2.6 红豆杉EST、fosmid和转录组SSR-PCR体系优化及引物验证 | 第72-74页 |
| 4.3 小结 | 第74-89页 |
| 第五章 基于SSR分子标记半同胞红豆杉群体遗传多样性及遗传分化研究 | 第89-102页 |
| 5.1 材料与方法 | 第90-91页 |
| 5.1.1 材料 | 第90页 |
| 5.1.2 DNA提取 | 第90页 |
| 5.1.3 SSR引物来源 | 第90页 |
| 5.1.4 PCR孔增和产物检测 | 第90页 |
| 5.1.5 数据处理 | 第90-91页 |
| 5.2 结果与分析 | 第91-101页 |
| 5.2.1 引物扩增多态性 | 第91页 |
| 5.2.2 半同胞群体遗传多样性分析 | 第91-100页 |
| 5.2.3 半同胞群体遗传亲缘关系评价 | 第100-101页 |
| 5.3 小结 | 第101-102页 |
| 第六章 基于SSR遗传标记构建红豆杉连锁图谱研究 | 第102-114页 |
| 6.1 材料与方法 | 第102-103页 |
| 6.1.1 作图群体的建立 | 第102-103页 |
| 6.1.2 基因组DNA提取 | 第103页 |
| 6.1.3 DNA检测与保存 | 第103页 |
| 6.1.4 SSR引物来源 | 第103页 |
| 6.1.5 聚丙烯酰胺凝胶电泳检测 | 第103页 |
| 6.1.6 遗传连锁分析和框架图谱的构建 | 第103页 |
| 6.2 结果与分析 | 第103-113页 |
| 6.2.1 DNA检测 | 第103-104页 |
| 6.2.2 引物筛选结果、多态性和偏分离分析 | 第104-113页 |
| 6.2.3 红豆杉SSR框架连锁图谱的构建 | 第113页 |
| 6.3 小结 | 第113-114页 |
| 第七章 讨论 | 第114-127页 |
| 7.1 通过红豆杉胚乳培养可以获得单倍体体愈伤组织 | 第114-116页 |
| 7.2 红豆杉细胞系高效诱导体系的建立与紫杉烷类化合物代谢突变体的快速筛选 | 第116-118页 |
| 7.3 红豆杉gSSR和EST-SSR分布特性与SSR-PCR体系的建立 | 第118-124页 |
| 7.4 红豆杉半同胞群体个体间具有较低的遗传多样性 | 第124-125页 |
| 7.5 通过红豆杉单倍体群体基于EST-SSR可以构建连锁图谱 | 第125-127页 |
| 参考文献 | 第127-155页 |
| 主要创新点 | 第155-156页 |
| 致谢 | 第156-159页 |
| 作者简历 | 第159-161页 |
| 附件 | 第161-179页 |
