| 摘要 | 第2-5页 |
| Abstract | 第5-8页 |
| 缩略语表 | 第9-15页 |
| 1 前言 | 第15-23页 |
| 1.1 异喹啉生物碱的药理作用 | 第15页 |
| 1.2 异喹啉生物碱的生物合成 | 第15-17页 |
| 1.3 参与调控异喹啉生物碱合成的转录因子 | 第17-18页 |
| 1.4 转录组测序技术和比较转录组学在生物合成上的应用 | 第18-19页 |
| 1.5 黄连是研究异喹啉生物碱合成的重要材料 | 第19-20页 |
| 1.6 利用转录组测序技术开发SSR | 第20-22页 |
| 1.7 本研究的目的意义 | 第22-23页 |
| 2 材料与方法 | 第23-28页 |
| 2.1 试验材料 | 第23页 |
| 2.2 试验方法 | 第23-28页 |
| 2.2.1 高效液相色谱法测定生物碱含量 | 第23-24页 |
| 2.2.2 转录组测序相关方法 | 第24-26页 |
| 2.2.3 从转录组数据中筛选SSR的方法 | 第26-28页 |
| 3 结果与分析 | 第28-54页 |
| 3.1 两种黄连异喹啉生物碱含量 | 第28-29页 |
| 3.2 转录组测序及组装 | 第29-32页 |
| 3.2.1 ILLUMINA双末端测序以及DE NOVO组装 | 第29-31页 |
| 3.2.2 CDS预测 | 第31-32页 |
| 3.3 转录组注释和分析 | 第32-49页 |
| 3.3.1 公共数据库注释 | 第32-34页 |
| 3.3.2 保守结构域的注释和COG分类 | 第34-36页 |
| 3.3.3 GENE ONTOLOGY和KEGG功能分类 | 第36-41页 |
| 3.3.4 异喹啉生物碱生物合成关键酶基因的基因的挖掘 | 第41-45页 |
| 3.3.5 异喹啉生物碱生物合成关键酶基因的差异表达谱 | 第45-46页 |
| 3.3.6 两种黄连中调控异喹啉生物碱生物合成的转录因子的研究 | 第46-49页 |
| 3.4 利用转录组开发SSR | 第49-54页 |
| 3.4.1 两种黄连转录组中SSR位点的数量与分布 | 第49-50页 |
| 3.4.2 转录组中SSR重复类型 | 第50-51页 |
| 3.4.3 SSR的引物筛选与验证 | 第51-54页 |
| 4 讨论 | 第54-58页 |
| 4.1 两种黄连异喹啉生物碱含量 | 第54页 |
| 4.2 两种黄连异喹啉生物碱合成相关基因的发现 | 第54-56页 |
| 4.3 两种黄连中参与调控异喹啉生物碱合成的转录因子 | 第56页 |
| 4.4 基于转录组的黄连SSR标记开发 | 第56-58页 |
| 5 结论 | 第58-60页 |
| 参考文献 | 第60-67页 |
| 个人简介 | 第67-68页 |
| 致谢 | 第68-69页 |
| 附件 | 第69-71页 |
