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利用无细胞体系和iTRAQ鉴定参与亮氨酸调节自噬通路的关键候选蛋白质

摘要第7-9页
ABSTRACT第9-10页
缩略语表(Abbreviation)第11-13页
第一章 文献综述第13-29页
    1.1 细胞自噬概述第13-24页
        1.1.1 细胞自噬的分类第13-15页
        1.1.2 细胞自噬的作用机理第15-20页
        1.1.3 氨基酸对细胞自噬的调节第20-23页
        1.1.4 细胞自噬的生物学意义第23-24页
    1.2 细胞内氨基酸的感受器及其机制第24-26页
        1.2.1 GCN2 对氨基酸的感应机制第24-25页
        1.2.2 T1R1/T1R3 对氨基酸的感应机制第25页
        1.2.3 LeuRS对氨基酸的感应机制第25页
        1.2.4 SLC38A9 对氨基酸的感应机制第25-26页
    1.3 Cell-free System用于研究自噬信号通路的可行性分析第26-27页
        1.3.1 Cell-free system的概述第26页
        1.3.2 Cell-free system用于mTOR以及自噬信号通路的研究第26-27页
    1.4 iTRAQ技术作为比较蛋白组学研究方法的优缺点分析与应用第27-28页
    1.5 本研究的目的与意义第28-29页
第二章 材料与方法第29-42页
    2.1 试验材料第29-31页
        2.1.1 细胞系、菌种、载体第29页
        2.1.2 主要药品及试剂第29-30页
        2.1.3 主要培养基及其配制第30页
        2.1.4 试验用缓冲液及其配制第30-31页
    2.2 试验方法第31-42页
        2.2.1 pcDNA4-Atg14-3×Flag表达质粒的构建第31-33页
        2.2.2 细胞培养主要步骤第33-34页
        2.2.3 Atg14-Flag蛋白的纯化第34-35页
        2.2.4 自噬体的粗提取第35-36页
        2.2.5 S100 的制备第36页
        2.2.6 Western blot第36-37页
        2.2.7 利用Cell-free system筛选氨基酸第37页
        2.2.8 亮氨酸调节自噬信号通路的差异蛋白质鉴定第37-42页
第三章 结果与分析第42-67页
    3.1 自噬体的粗提取第42-43页
    3.2 Atg14-Flag融合蛋白的表达纯化第43-44页
        3.2.1 pcDNA4-Atg14-3×Flag表达质粒的构建第43-44页
        3.2.2 重组质粒转染HEK293T表达Atg14-Flag融合蛋白第44页
        3.2.3 Atg14-Flag融合蛋白的纯化第44页
    3.3 Cell-free system的构建第44-45页
    3.4 利用Cell-free system研究亮氨酸、蛋氨酸、苏氨酸对自噬的调节作用 33 3.5 参与亮氨酸调节自噬信号通路的关键差异候选蛋白质的鉴定第45-46页
    3.5 参与亮氨酸调节自噬信号通路的关键差异候选蛋白质的鉴定第46-67页
        3.5.1 Cell-free system下上清和沉淀的蛋白质提取及定量第46-48页
        3.5.2 蛋白质鉴定第48-50页
        3.5.3 差异蛋白质筛选第50-51页
        3.5.4 差异蛋白质的GO分析第51-53页
        3.5.5 差异蛋白质的COG注释第53页
        3.5.6 差异蛋白的代谢通路注释和富集分析第53-63页
        3.5.7 参与亮氨酸调节自噬信号通路的关键差异候选蛋白分析第63-67页
第四章 讨论与小结第67-70页
参考文献第70-78页
致谢第78-79页
附录 在读期间发表论文第79页

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