附件 | 第3-5页 |
摘要 | 第5-6页 |
Abstract | 第6-7页 |
第一章 绪论 | 第12-21页 |
1.1 南方水稻黑条矮缩病的研究进展 | 第12-15页 |
1.1.1 SRBSDV的致病特征及发生危害 | 第12-13页 |
1.1.2 病原分类特征 | 第13-14页 |
1.1.3 介体昆虫及其传毒特性 | 第14-15页 |
1.2 半翅目昆虫唾液腺的作用 | 第15-17页 |
1.2.1 介体昆虫的唾液腺在植物病毒传播中的作用 | 第16-17页 |
1.3 实时荧光定量及内参基因的选择 | 第17-18页 |
1.3.1 定量方法的选择 | 第17-18页 |
1.3.2 内参基因的选择 | 第18页 |
1.4 高通量测序技术 | 第18-19页 |
1.4.1 罗氏454测序技术 | 第18-19页 |
1.4.2 Illumina/Solexa测序技术 | 第19页 |
1.4.3 SOLiD测序技术 | 第19页 |
1.4.4 Ion Proton测序技术 | 第19页 |
1.5 本研究的目的意义 | 第19-21页 |
第二章 带SRBSDV和不带SRBSDV白背飞虱唾液腺转录组分析 | 第21-40页 |
2.1 实验材料 | 第21-23页 |
2.1.1 供试水稻 | 第21页 |
2.1.2 接毒方法 | 第21-22页 |
2.1.3 昆虫饲养 | 第22页 |
2.1.4 SRBSDV检测方法 | 第22-23页 |
2.1.5 主要试剂 | 第23页 |
2.1.6 主要仪器 | 第23页 |
2.2 试验方法 | 第23-29页 |
2.2.1 白背飞虱唾液腺的解剖收集 | 第23-24页 |
2.2.2 总RNA提取 | 第24页 |
2.2.3 转录组测序 | 第24-25页 |
2.2.4 序列组装 | 第25页 |
2.2.5 功能注释和差异表达分析 | 第25页 |
2.2.6 分泌蛋白的预测 | 第25页 |
2.2.7 转录组差异表达基因的分析 | 第25-26页 |
2.2.8 荧光定量PCR检验筛选的差异基因 | 第26-28页 |
2.2.9 SRBSDV病毒检测方法 | 第28-29页 |
2.3 结果与讨论 | 第29-39页 |
2.3.1 RNA提取质量 | 第29-30页 |
2.3.2 Ion Proton II,PGM platform测序与组装结果 | 第30-31页 |
2.3.3 功能注释 | 第31页 |
2.3.4 GO分类和KEGG分类 | 第31-33页 |
2.3.5 Unigenes唾液腺蛋白种类、功能的推测 | 第33页 |
2.3.6 预测唾液腺分泌蛋白 | 第33-35页 |
2.3.7 差异表达基因的分析 | 第35-36页 |
2.3.8 不同组织中Vg和OBP的相对表达量 | 第36-39页 |
2.4 结论 | 第39-40页 |
第三章 白背飞虱内参基因的选择 | 第40-48页 |
3.1 实验材料 | 第40-41页 |
3.1.1 实验所用主要试剂 | 第40页 |
3.1.2 实验所用主要仪器及软件 | 第40-41页 |
3.1.3 供试虫源以及带毒稻株 | 第41页 |
3.2 实验方法 | 第41-43页 |
3.2.1 实验处理组 | 第41页 |
3.2.2 RNA的提取及cDNA合成 | 第41-42页 |
3.2.3 基因序列的获得及引物设计 | 第42页 |
3.2.4 实时荧光定量分析 | 第42-43页 |
3.2.5 数据分析 | 第43页 |
3.3 结果与讨论 | 第43-48页 |
3.3.1 qPCR引物扩增效率 | 第43-44页 |
3.3.2 候选内参基因的表达谱 | 第44页 |
3.3.3 内参基因表达稳定性分析 | 第44-48页 |
第四章 白背飞虱体内SRBSDV含量的变化 | 第48-56页 |
4.1 实验所用的仪器以及试剂 | 第48页 |
4.1.1 实验所用主要试剂 | 第48页 |
4.1.2 实验所用主要软件及仪器 | 第48页 |
4.1.3 供试虫源以及带毒稻株 | 第48页 |
4.2 实验方法 | 第48-50页 |
4.2.1 实验设计 | 第48-49页 |
4.2.2 RNA的提取 | 第49页 |
4.2.3 引物和探针的设计 | 第49页 |
4.2.4 质粒标准品的准备 | 第49-50页 |
4.2.5 实时荧光定量及优化 | 第50页 |
4.3 结果 | 第50-54页 |
4.3.1 建立标准曲线 | 第50-51页 |
4.3.2 不同处理组之间S10基因的绝对定量 | 第51-53页 |
4.3.3 不同处理组中同一龄期白背飞虱体内SRBSDV S10拷贝数的纵向比较 | 第53-54页 |
4.4 讨论 | 第54-56页 |
第五章 全文结论 | 第56-58页 |
参考文献 | 第58-65页 |
致谢 | 第65-66页 |
作者简历 | 第66页 |