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南方水稻黑条矮缩病毒对白背飞虱唾液腺转录组影响的研究

附件第3-5页
摘要第5-6页
Abstract第6-7页
第一章 绪论第12-21页
    1.1 南方水稻黑条矮缩病的研究进展第12-15页
        1.1.1 SRBSDV的致病特征及发生危害第12-13页
        1.1.2 病原分类特征第13-14页
        1.1.3 介体昆虫及其传毒特性第14-15页
    1.2 半翅目昆虫唾液腺的作用第15-17页
        1.2.1 介体昆虫的唾液腺在植物病毒传播中的作用第16-17页
    1.3 实时荧光定量及内参基因的选择第17-18页
        1.3.1 定量方法的选择第17-18页
        1.3.2 内参基因的选择第18页
    1.4 高通量测序技术第18-19页
        1.4.1 罗氏454测序技术第18-19页
        1.4.2 Illumina/Solexa测序技术第19页
        1.4.3 SOLiD测序技术第19页
        1.4.4 Ion Proton测序技术第19页
    1.5 本研究的目的意义第19-21页
第二章 带SRBSDV和不带SRBSDV白背飞虱唾液腺转录组分析第21-40页
    2.1 实验材料第21-23页
        2.1.1 供试水稻第21页
        2.1.2 接毒方法第21-22页
        2.1.3 昆虫饲养第22页
        2.1.4 SRBSDV检测方法第22-23页
        2.1.5 主要试剂第23页
        2.1.6 主要仪器第23页
    2.2 试验方法第23-29页
        2.2.1 白背飞虱唾液腺的解剖收集第23-24页
        2.2.2 总RNA提取第24页
        2.2.3 转录组测序第24-25页
        2.2.4 序列组装第25页
        2.2.5 功能注释和差异表达分析第25页
        2.2.6 分泌蛋白的预测第25页
        2.2.7 转录组差异表达基因的分析第25-26页
        2.2.8 荧光定量PCR检验筛选的差异基因第26-28页
        2.2.9 SRBSDV病毒检测方法第28-29页
    2.3 结果与讨论第29-39页
        2.3.1 RNA提取质量第29-30页
        2.3.2 Ion Proton II,PGM platform测序与组装结果第30-31页
        2.3.3 功能注释第31页
        2.3.4 GO分类和KEGG分类第31-33页
        2.3.5 Unigenes唾液腺蛋白种类、功能的推测第33页
        2.3.6 预测唾液腺分泌蛋白第33-35页
        2.3.7 差异表达基因的分析第35-36页
        2.3.8 不同组织中Vg和OBP的相对表达量第36-39页
    2.4 结论第39-40页
第三章 白背飞虱内参基因的选择第40-48页
    3.1 实验材料第40-41页
        3.1.1 实验所用主要试剂第40页
        3.1.2 实验所用主要仪器及软件第40-41页
        3.1.3 供试虫源以及带毒稻株第41页
    3.2 实验方法第41-43页
        3.2.1 实验处理组第41页
        3.2.2 RNA的提取及cDNA合成第41-42页
        3.2.3 基因序列的获得及引物设计第42页
        3.2.4 实时荧光定量分析第42-43页
        3.2.5 数据分析第43页
    3.3 结果与讨论第43-48页
        3.3.1 qPCR引物扩增效率第43-44页
        3.3.2 候选内参基因的表达谱第44页
        3.3.3 内参基因表达稳定性分析第44-48页
第四章 白背飞虱体内SRBSDV含量的变化第48-56页
    4.1 实验所用的仪器以及试剂第48页
        4.1.1 实验所用主要试剂第48页
        4.1.2 实验所用主要软件及仪器第48页
        4.1.3 供试虫源以及带毒稻株第48页
    4.2 实验方法第48-50页
        4.2.1 实验设计第48-49页
        4.2.2 RNA的提取第49页
        4.2.3 引物和探针的设计第49页
        4.2.4 质粒标准品的准备第49-50页
        4.2.5 实时荧光定量及优化第50页
    4.3 结果第50-54页
        4.3.1 建立标准曲线第50-51页
        4.3.2 不同处理组之间S10基因的绝对定量第51-53页
        4.3.3 不同处理组中同一龄期白背飞虱体内SRBSDV S10拷贝数的纵向比较第53-54页
    4.4 讨论第54-56页
第五章 全文结论第56-58页
参考文献第58-65页
致谢第65-66页
作者简历第66页

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