慢性牙周炎患者和牙周健康人唾液微生物多样性
| 中文摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 附录 中英文缩写词 | 第7-10页 |
| 第一章 前言 | 第10-15页 |
| 1.1 牙周病简介 | 第10页 |
| 1.2 口腔微生物多样性简介 | 第10-11页 |
| 1.3 16S rRNA基因介绍 | 第11-12页 |
| 1.4 454 焦磷酸测序技术的简介 | 第12页 |
| 1.5 牙周炎微生物简介 | 第12-15页 |
| 第二章 实验材料和方法 | 第15-20页 |
| 2.1 实验材料 | 第15-16页 |
| 2.1.1 主要试剂 | 第15页 |
| 2.1.2 主要材料和仪器 | 第15-16页 |
| 2.2 实验方法 | 第16-20页 |
| 2.2.1 研究对象 | 第16页 |
| 2.2.2 样本的收集 | 第16-17页 |
| 2.2.3 总DNA的提取和含量测定 | 第17页 |
| 2.2.4 总DNA的检测 | 第17-18页 |
| 2.2.5 PCR扩增 | 第18-19页 |
| 2.2.6 生物信息学分析 | 第19-20页 |
| 第三章 实验结果与分析 | 第20-44页 |
| 3.1 样本采集情况 | 第20-21页 |
| 3.2 唾液样本总DNA提取 | 第21-22页 |
| 3.3 获取优质序列 | 第22页 |
| 3.4 OTU分类 | 第22-23页 |
| 3.5 样本群落菌门与属的列表 | 第23-26页 |
| 3.6 物种丰度分析 | 第26-28页 |
| 3.6.1 稀释曲线评估 | 第26-27页 |
| 3.6.2 唾液样本Alpha多样性 | 第27-28页 |
| 3.7 群落结构分析 | 第28-41页 |
| 3.7.1 唾液微生物群落主成分分析（PCA） | 第28-29页 |
| 3.7.2 主坐标分析 | 第29-30页 |
| 3.7.4 含进化关系的物种丰度分布 | 第30页 |
| 3.7.5 聚类分析 | 第30-31页 |
| 3.7.6 菌门水平上物种丰度 | 第31-33页 |
| 3.7.7 菌属水平上物种丰度 | 第33-41页 |
| 3.8 菌属相关性分析 | 第41-44页 |
| 3.8.1 高丰度菌属的相关性分析 | 第41-42页 |
| 3.8.2 冗余分析 | 第42-44页 |
| 第四章 讨论 | 第44-49页 |
| 第五章 结论 | 第49-50页 |
| 5.1 主要结论 | 第49页 |
| 5.2 研究展望 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-55页 |
| 在学期间的研究成果 | 第55-56页 |
| 致谢 | 第56页 |
