| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 第一章 引言 | 第10-46页 |
| 第一节 HIV/SIV简介 | 第10-14页 |
| 1.1.1 HIV的结构以及生活周期 | 第11-13页 |
| 1.1.2 HIV/SIV的附属蛋白Vpx | 第13-14页 |
| 第二节 抑制HIV-1的宿主限制因子 | 第14-22页 |
| 1.2.1 APOBEC3(Apolipoprotein B-editing catalytic polypeptide 3 proteins)家族 | 第15-16页 |
| 1.2.2 TRIM5(Tripartite motif containing 5) | 第16-18页 |
| 1.2.3 Tetherin | 第18-19页 |
| 1.2.4 MxB(Myxovirus resistance protein B) | 第19-20页 |
| 1.2.5 IFITM(Interferon-induced transmembrane protein) | 第20-22页 |
| 第三节 SAMHD1研究进展 | 第22-45页 |
| 1.3.1 SAMHD1抗病毒功能的发现 | 第22-23页 |
| 1.3.2 SAMHD1抑制HIV-1 | 第23-24页 |
| 1.3.3 SAMHD1的结构 | 第24-26页 |
| 1.3.4 SAMHD1的亚细胞定位 | 第26-27页 |
| 1.3.5 SAMHD1的表达以及调控 | 第27-29页 |
| 1.3.6 体内条件下SAMHD1和HIV感染以及AIDS进程的关系 | 第29-30页 |
| 1.3.7 SAMHD1抑制病毒的机制 | 第30-31页 |
| 1.3.8 SAMHD1酶活性的调控 | 第31-35页 |
| 1.3.9 IFN介导的非SAMHD1的机制 | 第35页 |
| 1.3.10 Vpx介导SAMHD1的降解 | 第35-37页 |
| 1.3.11 SAMHD1与Vpx的进化 | 第37-41页 |
| 1.3.12 SAMHD1抑制其他逆转录病毒的复制 | 第41页 |
| 1.3.13 SAMHD1抑制DNA病毒的复制 | 第41-42页 |
| 1.3.14 SAMHD1抑制逆转座子LINE-1的活性 | 第42-43页 |
| 1.3.15 SAMHD1与Aicardi-Goutieres syndrome(AGS) | 第43页 |
| 1.3.16 SAMHD1与DNA损伤 | 第43-45页 |
| 第四节 本研究的目的和意义 | 第45-46页 |
| 第二章 材料与方法 | 第46-62页 |
| 第一节 实验材料 | 第46-48页 |
| 2.1.1 菌株 | 第46页 |
| 2.1.2 质粒及cDNA | 第46页 |
| 2.1.3 工具酶、抗体及试剂 | 第46-47页 |
| 2.1.4 分析软件 | 第47页 |
| 2.1.5 溶液配制 | 第47-48页 |
| 第二节 实验方法 | 第48-62页 |
| 2.2.1 常规质粒构建 | 第48-52页 |
| 2.2.2 定点突变质粒的构建 | 第52-54页 |
| 2.2.3 人/鼠/Red-capped mangabey SAMHD1的嵌合蛋白的真核表达质粒的构建 | 第54页 |
| 2.2.4 细胞培养 | 第54-56页 |
| 2.2.5 细胞裂解 | 第56页 |
| 2.2.6 BCA法蛋白浓度定量 | 第56-57页 |
| 2.2.7 蛋白印迹(Western blotting) | 第57-59页 |
| 2.2.8 免疫共沉淀(co-immunoprecipitation) | 第59页 |
| 2.2.9 生物统计分析 | 第59-60页 |
| 2.2.10 分子模型的构建 | 第60页 |
| 2.2.11 激光共聚焦成像(laser confocal imaging) | 第60-62页 |
| 第三章 结果与分析 | 第62-83页 |
| 第一节 SIVrcm Vpx降解SAMHD1的机制探索 | 第62-78页 |
| 3.1.1 Vpx介导SAMHD1的降解具有种属特异性 | 第62-64页 |
| 3.1.2 SIVrcm Vpx利用与SIVmac/HIV-2完全不同的模式与SAMHD1相互作用 | 第64-67页 |
| 3.1.3 SIVrcm Vpx介导RCM SAMHD1降解的必须氨基酸的确定 | 第67-70页 |
| 3.1.4 RCM SAMHD1的N末端是SIVrcm Vpx的识别位点 | 第70-71页 |
| 3.1.5 RCM SAMHD1 1-113位氨基酸对于响应SIVrcm Vpx介导的降解是充分的 | 第71-73页 |
| 3.1.6 RCM SAMHD1的F15、L36和F52对于SIVrcm Vpx的识别是必须的 | 第73-76页 |
| 3.1.7 rcmSAMHD1-NtD/Vpxrcm/DCAF1-CtD三元复合物的模型构建 | 第76页 |
| 3.1.8 RCM SAMHD1的R55和R56对于SIVrcm Vpx的识别至关重要 | 第76-78页 |
| 第二节 SAMHD1截短体的研究 | 第78-83页 |
| 3.2.1 SAMHD1截短体的鉴定 | 第78-79页 |
| 3.2.2 SAMHD1的截短体缺失了核定位信号 | 第79-81页 |
| 3.2.3 人SAMHD1酶切位点的预测 | 第81-83页 |
| 第四章 讨论 | 第83-89页 |
| 第一节 病毒蛋白和宿主限制因子之间的“军备竞赛” | 第83-88页 |
| 4.1.1 SIVrcm Vpx与SIVsm Vpx识别SAMHD1位点的迁移 | 第83页 |
| 4.1.2 SIVrcm Vpx与SIVmnd-2 Vpx识别SAMHD1位点的迁移 | 第83-87页 |
| 4.1.3 Vpx对SAMHD1的拮抗促进了其进化 | 第87-88页 |
| 第二节 SAMHD1对抗病毒降解的另一种策略 | 第88-89页 |
| 第五章 结论与展望 | 第89-91页 |
| 参考文献 | 第91-106页 |
| 附录 | 第106-114页 |
| 致谢 | 第114-115页 |
| 个人简历 | 第115-116页 |
| 在学期间发表论文 | 第116页 |
