| 摘要 | 第2-4页 |
| Summary | 第4-5页 |
| 第一章 文献综述 | 第9-19页 |
| 1 马铃薯炭疽病 | 第9-11页 |
| 2 绿色荧光蛋白在植物病原真菌中的应用 | 第11-12页 |
| 2.1 绿色荧光蛋白（GFP） | 第11页 |
| 2.2 绿色荧光蛋白的广泛应用 | 第11-12页 |
| 3 丝状真菌的转化 | 第12-14页 |
| 3.1 遗传转化在丝状真菌研究中的应用 | 第12页 |
| 3.2 丝状真菌的转化方法 | 第12-14页 |
| 4 真菌侵染过程的研究进展 | 第14-15页 |
| 5 核酸测序技术的发展 | 第15-17页 |
| 5.1 第一代测序技术 | 第15页 |
| 5.2 第二代测序技术 | 第15-16页 |
| 5.3 第三代测序技术 | 第16-17页 |
| 5.4 数字表达谱测序技术 | 第17页 |
| 6 本研究的目的与意义 | 第17-19页 |
| 第二章 马铃薯炭疽病菌的绿色荧光标记 | 第19-28页 |
| 1 材料与方法 | 第19-22页 |
| 1.1 材料 | 第19-21页 |
| 1.1.1 供试菌株和质粒 | 第19页 |
| 1.1.2 供试培养基 | 第19页 |
| 1.1.3 供试试剂 | 第19-20页 |
| 1.1.4 供试仪器 | 第20-21页 |
| 1.2 方法 | 第21-22页 |
| 1.2.1 球炭疽菌对Hygromycin B的敏感性测定 | 第21页 |
| 1.2.2 球炭疽菌基因组DNA的提取 | 第21页 |
| 1.2.3 绿色荧光表达载体构建 | 第21-22页 |
| 1.2.4 原生质体制备及转化 | 第22页 |
| 1.2.5 GFP标记菌株的荧光检测及其PCR验证 | 第22页 |
| 2 结果与分析 | 第22-26页 |
| 2.1 球炭疽菌对Hm B的敏感性测定 | 第22-23页 |
| 2.2 定点突变及质粒pITG重组 | 第23-24页 |
| 2.3 重组质粒pITGH构建及PCR鉴定 | 第24页 |
| 2.4 GFP标记菌株的筛选及荧光稳定性检测 | 第24-25页 |
| 2.5 GFP标记菌株的PCR鉴定 | 第25-26页 |
| 3 结论与讨论 | 第26-28页 |
| 第三章 转化子的生物学特性及侵染过程 | 第28-37页 |
| 1 材料与方法 | 第28-29页 |
| 1.1 材料 | 第28页 |
| 1.1.1 菌株和品种 | 第28页 |
| 1.1.2 仪器设备 | 第28页 |
| 1.2 方法 | 第28-29页 |
| 1.2.1 转化子的菌落形态和生长速度 | 第28页 |
| 1.2.2 pH对转化子生长的影响 | 第28-29页 |
| 1.2.3 转化子的致病性测定 | 第29页 |
| 1.2.4 转化子在马铃薯茎秆和块茎上扩展速度的观察 | 第29页 |
| 1.2.5 荧光样品的制备 | 第29页 |
| 2 结果与分析 | 第29-35页 |
| 2.1 转化子生物学特性 | 第29-31页 |
| 2.1.1 转化子的菌落形态 | 第29-30页 |
| 2.1.2 转化子的致病性 | 第30页 |
| 2.1.3 转化子的生长速度 | 第30-31页 |
| 2.1.4 pH对转化子的影响 | 第31页 |
| 2.2 侵染过程观察 | 第31-35页 |
| 2.2.1 在马铃薯茎秆和薯块上的侵染速度测定 | 第31-32页 |
| 2.2.2 侵染过程观察 | 第32-35页 |
| 3 结论与讨论 | 第35-37页 |
| 第四章 马铃薯在球炭疽菌胁迫下的基因表达谱分析 | 第37-62页 |
| 1 材料与方法 | 第37-40页 |
| 1.1 材料 | 第37页 |
| 1.1.1 菌株与品种 | 第37页 |
| 1.1.2 供试试剂 | 第37页 |
| 1.1.3 供试仪器 | 第37页 |
| 1.2 方法 | 第37-40页 |
| 1.2.1 马铃薯植株栽培 | 第37-38页 |
| 1.2.2 测序样品的采集及RNA的提取 | 第38页 |
| 1.2.3 测序数据分析 | 第38-40页 |
| 1.2.3.1 测序数据过滤及评估 | 第38-39页 |
| 1.2.3.2 样品间相关性分析 | 第39页 |
| 1.2.3.3 差异基因筛选NOISEQ方法 | 第39页 |
| 1.2.3.4 表达谱序列注释 | 第39-40页 |
| 2 结果与分析 | 第40-58页 |
| 2.1 样品RNA质量信息 | 第40页 |
| 2.2 测序数据过滤 | 第40-42页 |
| 2.3 测序数据质量的评估 | 第42-46页 |
| 2.4 样品间的相关性 | 第46-47页 |
| 2.5 样品间的共有和特有基因 | 第47-48页 |
| 2.6 基因差异表达分析 | 第48-51页 |
| 2.7 差异表达基因的GO功能显著性富集分析 | 第51-55页 |
| 2.8 差异基因的Pathway富集分析 | 第55-56页 |
| 2.9 显著性富集通路的共表达基因 | 第56-57页 |
| 2.10 植物与病原互作途径 | 第57-58页 |
| 3 讨论与结论 | 第58-60页 |
| 4 本研究的后续工作 | 第60-62页 |
| 第五章 结论与创新点 | 第62-63页 |
| 参考文献 | 第63-74页 |
| 项目来源 | 第74-75页 |
| 致谢 | 第75-76页 |
| 作者简介 | 第76-77页 |
| 导师简介 | 第77-78页 |
