致谢 | 第4-8页 |
摘要 | 第8-10页 |
英文缩略表 | 第10-11页 |
1 文献综述 | 第11-22页 |
1.1 神经系统 | 第11-14页 |
1.1.1 神经连接的形成 | 第11-12页 |
1.1.2 视网膜的结构 | 第12-13页 |
1.1.3 视神经 | 第13-14页 |
1.2 神经的损伤与再生 | 第14-15页 |
1.2.1 神经损伤的实质 | 第14页 |
1.2.2 影响中枢神经再生的因素 | 第14页 |
1.2.3 促进中枢神经再生的因素 | 第14-15页 |
1.2.4 神经再生研究方法 | 第15页 |
1.2.5 视神经损伤的研究 | 第15页 |
1.3 miRNA概述 | 第15-19页 |
1.3.1 miRNA的起源与加工 | 第16页 |
1.3.2 miRNA的调控机理 | 第16页 |
1.3.3 miRNA的功能探索 | 第16-17页 |
1.3.4 miRNA的生物信息学分析 | 第17页 |
1.3.5 miRNA的分子生物学研究方法 | 第17-19页 |
1.3.5.1 miRNA表达分析方法 | 第18页 |
1.3.5.2 miRNA体外或体内水平的过表达研究 | 第18-19页 |
1.3.5.3 miRNA表达抑制研究 | 第19页 |
1.3.5.4 体外验证miRNA作用的靶基因 | 第19页 |
1.4 神经损伤与miRNA的关系 | 第19-20页 |
1.5 鱼类视神经损伤和再生的研究 | 第20页 |
1.6 斑马鱼视网膜中miRNA的表达 | 第20-22页 |
2 引言 | 第22页 |
3 材料与方法 | 第22-27页 |
3.1 材料 | 第22-23页 |
3.1.1 试验动物 | 第22-23页 |
3.1.2 试验仪器和试剂 | 第23页 |
3.2 方法 | 第23-27页 |
3.2.1 视神经的损伤 | 第23-24页 |
3.2.2 取材 | 第24页 |
3.2.3 总RNA的提取 | 第24-25页 |
3.2.4 荧光定量PCR | 第25页 |
3.2.5 小RNA文库的建立和高通量测序 | 第25页 |
3.2.6 序列分析和miRNAs的鉴定 | 第25页 |
3.2.7 miRNAs的验证 | 第25-26页 |
3.2.8 miRNA靶基因预测、GO富集分析和KEGG通路分析 | 第26-27页 |
4 结果与分析 | 第27-44页 |
4.1 文库构建与测序分析 | 第27-31页 |
4.1.1 原始数据库的分析 | 第27页 |
4.1.2 测序长度分布情况 | 第27-28页 |
4.1.3 文库中sRNA分布情况 | 第28-29页 |
4.1.4 Repeat区域注释 | 第29-30页 |
4.1.5 外显子/内含子注释 | 第30-31页 |
4.2 视神经损伤再生相关miRNA的鉴定 | 第31-35页 |
4.2.1 保守miRNAs的鉴定 | 第31页 |
4.2.2 新miRNAs的鉴定 | 第31-34页 |
4.2.3 视神经损伤再生相关miRNAs的验证 | 第34-35页 |
4.3 视神经损伤再生相关miRNA的表达分析 | 第35-37页 |
4.3.1 miRNAs的高通量表达 | 第35-36页 |
4.3.2 实时定量PCR验证 | 第36-37页 |
4.4 样品间miRNA表达差异分析 | 第37-41页 |
4.4.1 公共及特有序列分析 | 第37页 |
4.4.2 两个文库间差异表达分析 | 第37-41页 |
4.5 视神经损伤再生相关miRNAs的潜在功能分析 | 第41-44页 |
5 讨论 | 第44-47页 |
5.1 神经再生研究与miRNA的关系 | 第44页 |
5.2 斑马鱼中miRNAs的功能 | 第44页 |
5.3 miRNA与神经发育的关系 | 第44-45页 |
5.4 总结 | 第45页 |
5.5 展望 | 第45-47页 |
参考文献 | 第47-54页 |
附录 | 第54-61页 |
ABSTRACT | 第61-63页 |