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斑马鱼视神经损伤后视网膜中再生相关miRNAs的鉴定与分析

致谢第4-8页
摘要第8-10页
英文缩略表第10-11页
1 文献综述第11-22页
    1.1 神经系统第11-14页
        1.1.1 神经连接的形成第11-12页
        1.1.2 视网膜的结构第12-13页
        1.1.3 视神经第13-14页
    1.2 神经的损伤与再生第14-15页
        1.2.1 神经损伤的实质第14页
        1.2.2 影响中枢神经再生的因素第14页
        1.2.3 促进中枢神经再生的因素第14-15页
        1.2.4 神经再生研究方法第15页
        1.2.5 视神经损伤的研究第15页
    1.3 miRNA概述第15-19页
        1.3.1 miRNA的起源与加工第16页
        1.3.2 miRNA的调控机理第16页
        1.3.3 miRNA的功能探索第16-17页
        1.3.4 miRNA的生物信息学分析第17页
        1.3.5 miRNA的分子生物学研究方法第17-19页
            1.3.5.1 miRNA表达分析方法第18页
            1.3.5.2 miRNA体外或体内水平的过表达研究第18-19页
            1.3.5.3 miRNA表达抑制研究第19页
            1.3.5.4 体外验证miRNA作用的靶基因第19页
    1.4 神经损伤与miRNA的关系第19-20页
    1.5 鱼类视神经损伤和再生的研究第20页
    1.6 斑马鱼视网膜中miRNA的表达第20-22页
2 引言第22页
3 材料与方法第22-27页
    3.1 材料第22-23页
        3.1.1 试验动物第22-23页
        3.1.2 试验仪器和试剂第23页
    3.2 方法第23-27页
        3.2.1 视神经的损伤第23-24页
        3.2.2 取材第24页
        3.2.3 总RNA的提取第24-25页
        3.2.4 荧光定量PCR第25页
        3.2.5 小RNA文库的建立和高通量测序第25页
        3.2.6 序列分析和miRNAs的鉴定第25页
        3.2.7 miRNAs的验证第25-26页
        3.2.8 miRNA靶基因预测、GO富集分析和KEGG通路分析第26-27页
4 结果与分析第27-44页
    4.1 文库构建与测序分析第27-31页
        4.1.1 原始数据库的分析第27页
        4.1.2 测序长度分布情况第27-28页
        4.1.3 文库中sRNA分布情况第28-29页
        4.1.4 Repeat区域注释第29-30页
        4.1.5 外显子/内含子注释第30-31页
    4.2 视神经损伤再生相关miRNA的鉴定第31-35页
        4.2.1 保守miRNAs的鉴定第31页
        4.2.2 新miRNAs的鉴定第31-34页
        4.2.3 视神经损伤再生相关miRNAs的验证第34-35页
    4.3 视神经损伤再生相关miRNA的表达分析第35-37页
        4.3.1 miRNAs的高通量表达第35-36页
        4.3.2 实时定量PCR验证第36-37页
    4.4 样品间miRNA表达差异分析第37-41页
        4.4.1 公共及特有序列分析第37页
        4.4.2 两个文库间差异表达分析第37-41页
    4.5 视神经损伤再生相关miRNAs的潜在功能分析第41-44页
5 讨论第44-47页
    5.1 神经再生研究与miRNA的关系第44页
    5.2 斑马鱼中miRNAs的功能第44页
    5.3 miRNA与神经发育的关系第44-45页
    5.4 总结第45页
    5.5 展望第45-47页
参考文献第47-54页
附录第54-61页
ABSTRACT第61-63页

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