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泸型酒窖池丁酸菌群落结构初步解析

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
第一章 绪论第9-18页
    1.1 泸型酒及其生产工艺概述第9-10页
    1.2 泸型酒风味组成第10-11页
    1.3 泸型酒窖内微生物群落研究现状第11-12页
    1.4 丁酸菌研究现状第12-13页
    1.5 常用分子生态学研究方法第13-16页
    1.6 常用生物信息学软件及多元统计分析第16-17页
    1.7 立题意义第17页
    1.8 本课题研究内容第17-18页
第二章 材料与方法第18-28页
    2.1 实验材料第18-20页
        2.1.1 酒醅、窖泥样品第18页
        2.1.2 实验试剂第18-19页
        2.1.3 实验仪器第19页
        2.1.4 培养基第19-20页
    2.2 实验方法第20-28页
        2.2.1 环境样品宏基因组提取第20页
        2.2.2 丁酸合成途径关键基因克隆文库构建第20-22页
            2.2.2.1 引物设计第20页
            2.2.2.2 丁酸合成途径关键基因扩增第20-21页
            2.2.2.3 大肠杆菌JM109感受态制备(氯化钙法)第21页
            2.2.2.4 连接与转化第21页
            2.2.2.5 测序数据处理第21-22页
        2.2.3 依据 16S rRNA基因测序结果预测丁酸菌组成第22-23页
            2.2.3.1 16S rRNA基因V1~V3区片段扩增第22页
            2.2.3.2 高通量测序数据基本处理第22页
            2.2.3.3 各分类学单元的PICRUSt功能预测第22页
            2.2.3.4 依据功能预测结果分析丁酸菌组成第22-23页
            2.2.3.5 丁酸菌组成与环境因子变化相关性分析第23页
        2.2.4 DGGE分析窖泥中梭菌(Clostridia)变化规律第23-25页
            2.2.4.1 梭菌 16S rRNA基因V4~V5区片段扩增第23页
            2.2.4.2 溶液配制第23-24页
            2.2.4.3 变性胶灌制及电泳第24页
            2.2.4.4 DGGE条带分析第24-25页
        2.2.5 高通量测序分析酒醅中梭菌群落变化规律及功能组成第25页
        2.2.6 实时荧光定量PCR表征梭菌生物量变化第25-26页
            2.2.6.1 标准样品制备第25-26页
            2.2.6.2 实时荧光定量PCR第26页
            2.2.6.3 数据处理第26页
        2.2.7 部分产丁酸梭菌分离及代谢特性研究第26-28页
            2.2.7.1 菌株分离及鉴定第26-27页
            2.2.7.2 发酵产物检测第27页
            2.2.7.3 实时荧光定量PCR检测C. kluyveri生物量变化第27-28页
第三章 结果与讨论第28-51页
    3.1 酒醅中丁酸菌分布第28-41页
        3.1.1 克隆文库分析酒醅中的丁酸菌分布第28-30页
        3.1.2 PICRUSt预测丁酸代谢途径相关基因分布第30-33页
        3.1.3 酒醅中梭菌群落结构及动态变化第33-39页
        3.1.4 酒醅中梭菌功能预测第39-41页
    3.2 窖泥中丁酸菌分布第41-46页
        3.2.1 克隆文库分析窖泥中的丁酸菌分布第41-44页
        3.2.2 窖泥中梭菌群落结构及动态变化第44-46页
    3.3 窖池中丁酸、己酸产生菌的纯培养第46-51页
        3.3.1 窖泥丁酸、己酸产生菌的分离及发酵产物检测第46-49页
        3.3.2 窖池中的C. kluyveri生物量变化第49-51页
主要结论与展望第51-53页
    主要结论第51-52页
    问题与展望第52-53页
致谢第53-55页
参考文献第55-60页
附录: 作者在攻读硕士学位期间发表的论文第60页

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