| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-36页 |
| 1 miRNA的研究进展 | 第13-21页 |
| ·miRNA的生物起源与生物合成 | 第13-15页 |
| ·miRNA的命名 | 第15页 |
| ·miRNA的作用机制 | 第15-16页 |
| ·miRNA,siRNA与piRNA的异同 | 第16-17页 |
| ·miRNA的调控功能 | 第17-21页 |
| ·miRNA与发育 | 第18-19页 |
| ·miRNA与变态 | 第19页 |
| ·miRNA与神经分化 | 第19页 |
| ·miRNA与衰老 | 第19页 |
| ·miRNA与免疫和压力应答 | 第19-20页 |
| ·miRNA与凋亡 | 第20页 |
| ·miRNA与生殖 | 第20-21页 |
| 2 miRNA的研究方法 | 第21-26页 |
| ·miRNA的鉴定与表达分析 | 第21-24页 |
| ·miRNA的功能研究 | 第24-25页 |
| ·靶基因的验证及miRNA的功能分析 | 第25-26页 |
| 3 Wolbachia的研究进展 | 第26-32页 |
| ·形态和分布 | 第26-27页 |
| ·生殖调控作用与CI研究进展 | 第27-30页 |
| ·生殖操控作用 | 第27-28页 |
| ·CI因子 | 第28页 |
| ·CI的机理 | 第28-30页 |
| ·Wolbachia对寄主的其他作用 | 第30-32页 |
| ·Wolbachia与适合度 | 第30页 |
| ·Wolbachia与宿主代谢 | 第30-31页 |
| ·Wolbachia与寄主免疫 | 第31页 |
| ·对寄主其他影响 | 第31-32页 |
| ·Wolbachia基因组研究 | 第32页 |
| 4 共生菌——寄主互作中miRNA的作用 | 第32-33页 |
| 5 研究目的和意义 | 第33-36页 |
| 第二章 Small RNA文库构建与测序 | 第36-50页 |
| 1 材料 | 第37-38页 |
| ·供试叶螨 | 第37页 |
| ·样品收集 | 第37-38页 |
| 2 实验方法 | 第38-41页 |
| ·总RNA的提取和质量控制 | 第38-39页 |
| ·Small RNA文库构建和Illumina测序 | 第39页 |
| ·Illumina测序结果分析流程 | 第39-41页 |
| 3 结果 | 第41-47页 |
| ·RNA提取及检测结果 | 第41-42页 |
| ·测序数据过滤情况 | 第42-43页 |
| ·四个文库中sRNA的概况 | 第43-46页 |
| ·sRNA注释 | 第46-47页 |
| 4 讨论 | 第47-50页 |
| 第三章 四个文库中miRNA的分析 | 第50-64页 |
| 1 miRNA的发现 | 第51-52页 |
| 2 miRNA的表达丰度分析 | 第52-54页 |
| 3 miRNA碱基偏好性分析 | 第54-57页 |
| 4 miRNA家族分析 | 第57-58页 |
| 5 miRNA的表达差异分析 | 第58-61页 |
| 6 miRNA靶基因预测 | 第61-62页 |
| 7 讨论 | 第62-64页 |
| 第四章 结合miRNA-mRNA测序结果深入分析 | 第64-84页 |
| 1 miRNA-mRNA联合分析方法 | 第65-66页 |
| 2 联合分析得到的miRNA靶标基因 | 第66-77页 |
| 3 靶基因GO分类 | 第77-78页 |
| 4 KEGG分析 | 第78-80页 |
| 5 讨论 | 第80-84页 |
| 第五章 miRNA的验证及差异表达分析 | 第84-94页 |
| 1 样品准备 | 第85页 |
| 2 实验方法 | 第85-89页 |
| ·总RNA的提取和质量控制 | 第85-86页 |
| ·miRNA的定量实验 | 第86-87页 |
| ·mRNA的定量实验 | 第87-89页 |
| 3 实验结果与分析 | 第89-93页 |
| ·RNA提取结果 | 第89-90页 |
| ·miRNA定量结果 | 第90-92页 |
| ·mRNA定量结果 | 第92-93页 |
| 4 讨论 | 第93-94页 |
| 全文总结 | 第94-96页 |
| 参考文献 | 第96-114页 |
| 附录 | 第114-118页 |
| 学术论文发表情况 | 第118-120页 |
| 致谢 | 第120页 |