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毕赤酵母AOX1启动子转录调控机制研究

摘要第1-7页
Abstract第7-12页
第1章 文献综述第12-26页
   ·毕赤酵母表达系统第12-16页
     ·毕赤酵母表达系统的特点第12页
     ·商业化的毕赤酵母表达菌株和载体第12-14页
     ·毕赤酵母AOX1启动子第14-16页
   ·毕赤酵母其它启动子的开发第16-18页
     ·DAS和FLD1启动子第16页
     ·GAP、TEF1和GCW14启动子第16-18页
     ·PGK1、PEX8和YPT1启动子第18页
     ·PG1和PG6启动子第18页
   ·甲醇营养型酵母及其甲醇利用途径第18-20页
     ·甲醇营养型酵母以及醇氧化酶基因第18-19页
     ·甲醇利用途径第19-20页
   ·甲醇利用途径中的转录调控因子第20-24页
     ·激活因子Mxr1第20-21页
     ·抑制因子C4qzn3第21-22页
     ·抑制因子Rop第22页
     ·激活因子Trm2第22-23页
     ·激活因子Mpp1第23页
     ·激活因子Trm1第23-24页
     ·激活因子Mit1和Prm1第24页
   ·基于AOX1启动子的毕赤酵母表达系统的主要问题第24-25页
   ·本课题的研究目的及意义第25-26页
第2章 AOX1启动子转录激活因子Mit1和Prm1的鉴定第26-48页
   ·前言第26页
   ·实验材料第26-31页
     ·菌株和质粒第26页
     ·培养基和培养条件第26-28页
     ·生物化学或分子生物学试剂第28-31页
   ·实验方法第31-37页
     ·毕赤酵母基因组的提取第31-32页
     ·缺失株△mxr1和回补菌株的构建第32-33页
     ·BFP-SKL表达菌株的构建以及过氧化物酶体的观察第33-34页
     ·WTG、△mit1G、△prm1G、△mit1A、△prm1A菌株的构建第34页
     ·GFP的酶标仪测定第34页
     ·Aox显色反应第34-35页
     ·染色质免疫共沉淀菌株的构建第35页
     ·毕赤酵母蛋白的提取和Western blot分析第35页
     ·染色质免疫共沉淀(ChIP)第35-37页
     ·其他方法第37页
   ·结果与讨论第37-46页
     ·Mit1和Prm1的锌指结构分析第37-38页
     ·Mit1和Prm1为毕赤酵母甲醇代谢途径的特异性调控因子第38-39页
     ·Mit1和Prm1对甲醇代谢相关基因和过氧化物酶体的调控第39-40页
     ·Mit1和Prm1对PAOX1的调控第40-42页
     ·Mit1和Prm1与甲醇利用途径基因启动子的结合第42-46页
   ·本章小结第46-48页
第3章 Mit1和Prm1的功能结构域第48-64页
   ·前言第48页
   ·实验材料第48-52页
   ·实验方法第52-54页
     ·△mit1-Mpp1和△mit1A-Mpp1菌株的构建第52-53页
     ·Mit1和Prm1突变蛋白功能分析菌株的构建第53页
     ·Mit1和Prm1结构域缺失定位分析菌株的构建第53页
     ·Mit1冗余结构域缺失株的构建第53-54页
     ·其他实验方法第54页
   ·结果与讨论第54-63页
     ·多形汉逊酵母Mpp1回补至毕赤酵母△mit1菌株第54-55页
     ·Mit1和Prm1蛋白结构域的划分第55-58页
     ·Mit1和Prm1结构域缺失蛋白的亚细胞定位第58-59页
     ·Mit1和Prm1结构域缺失对菌株生长和PAOX1的影响第59-62页
     ·Mit1的冗余结构域与甘油对PAOX1的阻遏第62-63页
   ·本章小结第63-64页
第4章 甲醇的信号转导和AOX1启动子的调控模型第64-94页
   ·前言第64页
   ·实验材料第64-73页
   ·实验方法第73-78页
     ·蛋白质相互作用第73-76页
     ·Nrg1缺失和定位菌株的构建第76页
     ·Mit1和Prm1自调控研究菌株的构建第76-77页
     ·甲醇诱导信号转导分析菌株的构建第77页
     ·其他实验方法第77-78页
   ·结果与讨论第78-93页
     ·抑制因子Nrg1对PAOX1的调控作用第78-80页
     ·PAOX1转录调控因子蛋白水平的相互作用第80-85页
     ·碳源对MIT1和PRM1表达的调控第85-86页
     ·转录抑制因子对MIT1、PRM1、MXR1表达的调控作用第86-87页
     ·Mit1和Prm1的自激活调控第87-88页
     ·甲醇信号在转录激活因子间的转导途径第88-90页
     ·PAOX1的调控模型第90-93页
   ·本章小结第93-94页
第5章 新型非甲醇诱导毕赤酵母表达系统的构建第94-103页
   ·前言第94页
   ·实验材料第94页
   ·实验方法第94-97页
     ·Mit1和Prm1过表达菌株的构建第94-96页
     ·GFP表达菌株的构建第96页
     ·△mig1△mig2△nrg1-AMit1菌株的构建第96-97页
     ·其他方法第97页
   ·结果与讨论第97-102页
     ·抑制因子的缺失第97页
     ·激活因子的过表达第97-99页
     ·新型毕赤酵母表达系统的构建第99-101页
     ·新型毕赤酵母表达系统的改进第101-102页
   ·本章小结第102-103页
第6章 结论、创新点与展望第103-106页
   ·主要结论第103-104页
   ·创新点第104-105页
   ·展望第105-106页
参考文献第106-114页
致谢第114-115页
攻读博士学位期间撰写的论文第115页

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