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干扰素诱导基因LY6E在HIV-1慢性感染中调节单核细胞对LPS刺激应答的研究

摘要第1-7页
Abstract第7-14页
英文缩写第14-18页
第一章 引言第18-58页
 第一节 HIV研究概况第18-22页
     ·HIV的发现与起源第18-19页
     ·HIV的流行病学第19页
     ·HIV的发病机制第19-22页
       ·急性感染和CD4~+T细胞耗竭第20-21页
       ·病毒潜伏库的形成第21-22页
 第二节 HIV引起的固有免疫应答第22-42页
     ·细胞中的模式识别受体第22-28页
       ·TLR家族第23-24页
       ·NLR家族第24-26页
       ·RLR家族第26-27页
       ·CLR家族第27-28页
     ·模式识别受体识别HIV病毒第28-32页
       ·Toll样受体第28-31页
       ·细胞质中的RNA识别元件第31页
       ·细胞质中的DNA识别元件第31-32页
     ·IFN应答第32-42页
       ·HIV感染中IFN-I的细胞来源第32-35页
       ·IFN-I在靶细胞中产生的效应第35-42页
 第三节 HIV感染中的微生物移位第42-55页
     ·微生物移位简介第43-44页
     ·TLR通路参与微生物移位中的信号转导第44-48页
       ·MyD88依赖的TLR信号通路第44-47页
       ·TRIF依赖的TLR信号通路第47-48页
     ·微生物移位的检测第48-50页
     ·引起微生物移位的原因第50-51页
     ·微生物移位的后果第51-54页
       ·免疫活化第51-53页
       ·CD4~+T细胞耗竭以及病毒RNA水平升高第53-54页
     ·ART治疗对微生物移位的影响第54-55页
 第四节 本研究的目的和意义第55-58页
第二章 材料与方法第58-75页
 第一节 实验材料第58-65页
     ·研究对象第58-61页
     ·细胞第61页
     ·菌株第61-62页
     ·质粒第62页
     ·主要试剂第62-64页
       ·酶类第62-63页
       ·抗体第63页
       ·试剂盒第63-64页
       ·其他试剂第64页
     ·主要仪器和设备第64-65页
 第二节 实验方法第65-75页
     ·普通聚合酶链式反应第65-66页
       ·引物设计及合成第65页
       ·扩增反应第65-66页
     ·荧光定量PCR(Real-time PCR)第66-67页
     ·人外周血CD4~+T细胞绝对计数第67页
     ·外周血单个核细胞(PBMC)分离第67-68页
     ·单核细胞分离第68-69页
     ·细胞培养第69页
       ·细胞系培养第69页
       ·原代细胞培养第69页
     ·细胞转染第69-70页
       ·THP-1细胞转染第69页
       ·原代单核细胞转染第69-70页
     ·流式细胞分析第70页
       ·细胞表面抗体染色第70页
       ·细胞内抗体染色第70页
       ·结果分析第70页
     ·荧光素酶活性测定第70页
     ·细胞因子检测第70-72页
       ·微量样本多指标流式蛋白定量检测(Cytometric Bead Array,CBA)第70-71页
       ·酶联免疫吸附试验(Enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)第71-72页
     ·反转录PCR(Reverse transcription PCR,RT-PCR)第72页
     ·免疫印迹(Western blotting)第72-73页
     ·LY6E稳定敲除的THP-1细胞系构建第73页
       ·shRNA质粒转染第73页
       ·稳定整合细胞筛选第73页
     ·慢病毒转导第73-74页
       ·慢病毒包装第73-74页
       ·慢病毒转导第74页
     ·芯片数据分析第74页
     ·统计学分析第74-75页
第三章 结果与分析第75-112页
 第一节 LY6E是与HIV-1疾病相关的干扰素诱导基因第75-88页
     ·与HIV-1疾病相关的ISGs分析第75-79页
     ·LY6E能被IFN-α诱导表达上调第79-82页
     ·LY6E与疾病进展的相关性第82-88页
 第二节 LY6E调节CD14的表达第88-94页
     ·沉默LY6E的THP-1细胞系的构建第88-89页
     ·转录组芯片分析第89-92页
     ·流式细胞术分析THP-1-shLY6E和THP-1-shCtrl细胞表面分子的表达第92-94页
 第三节 LY6E下调单核细胞中LPS诱导的免疫应答第94-107页
     ·单核细胞中LY6E抑制LPS诱导的免疫应答第94-102页
     ·LY6E抑制LPS诱导的免疫应答功能是通过改变CD14的表达实现第102-104页
     ·参与LY6E调控免疫应答的信号通路第104-107页
 第四节 HIV-1慢性感染中LY6E限制单核细胞对LPS的过度反应第107-112页
     ·HIV-1感染者的单核细胞中CD14表达与LY6E具有负相关性第107-109页
     ·LY6E减弱HIV-1感染者的单核细胞对LPS刺激的免疫应答第109-112页
第四章 讨论第112-117页
 第一节 LY6E的相关研究第112-113页
 第二节 微生物移位导致系统免疫活化第113-114页
 第三节 LY6E在固有免疫系统中的作用第114-115页
 第四节 IFN-I在病毒感染中的双重效应第115-117页
第五章 结论与展望第117-119页
 第一节 结论第117-118页
 第二节 展望第118-119页
参考文献第119-143页
致谢第143-145页
个人简历第145-146页
在学期间发表论文第146页

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