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选择性α1A-肾上腺素受体拮抗剂的药物分子计算机辅助设计及细胞模型筛选研究

中文摘要第1-9页
ABSTRACT第9-13页
实验室已有的化合物库第13-21页
论文涉及到的简称及中英文对照第21-23页
绪论第23-37页
文献综述:α1A-受体拮抗剂的计算机辅助药物设计研究进展第37-51页
 1.引言第37-40页
 2.基于配体的药物设计方法第40-47页
   ·药效团模型第40-45页
   ·定量构效关系模型第45-47页
 3.基于结构的药物设计第47-50页
 4.结论第50-51页
第一部分 α1A-AR 拮抗活性的分子生物学筛选第51-69页
 1.实验部分第51-57页
   ·试剂和仪器第51-52页
   ·细胞水平α1A-AR 拮抗剂筛选模型建立第52-54页
   ·筛选条件的选择及优化第54-55页
   ·筛选模型的评估第55-57页
   ·实验室现有化合物的活性筛选第57页
 2.结果与讨论第57-66页
   ·阴性细胞株的建立第57-58页
   ·报告基因响应元件和筛选细胞株的选择第58-60页
   ·Forskolin 的使用第60-62页
   ·荧光素酶表达时间的确定第62-63页
   ·溶剂及其浓度的影响第63页
   ·模型的评估第63-64页
   ·细胞株内源性干扰检测第64页
   ·实验室现有化合物的高通量筛选结果第64-66页
 3.小结第66-69页
第二部分 基于配体的芳基哌嗪类α1A-AR 拮抗剂药效团模型的建立第69-83页
 1.实验部分第69-74页
   ·药效团模型的构建第69-72页
   ·药效团模型预测能力研究第72-74页
   ·药效团模型的数据库验证第74页
 2.结果与讨论第74-81页
   ·α1A- AR 拮抗剂的分类第74-75页
   ·药效团模型筛选第75-80页
   ·药效团模型的预测能力评估第80-81页
   ·药效团模型的数据库验证结果第81页
 3.小结第81-83页
第三部分 基于α1A-AR 拮抗剂药效团模型的 CoMFA 和 CoMSIA 的研究的建立第83-108页
 1.实验部分第83-87页
   ·化合物的选取第83-85页
   ·分子构建第85-86页
   ·分子叠合第86页
   ·CoMFA 模型的建立第86-87页
   ·CoMSIA 模型的建立第87页
   ·模型的预测能力评估第87页
 2.结果和讨论第87-107页
   ·化合物分子的叠合结果第87-89页
   ·CoMFA 模型第89-91页
   ·CoMSIA 模型第91-94页
   ·CoMFA 模型与 CoMSIA 模型比较第94-98页
   ·三维等势图分析第98-102页
   ·实验室现有化合物的活性预测第102-107页
 3.结论第107-108页
第四部分 α1-AR 分子亚型蛋白的同源模建第108-128页
 1.实验部分第108-114页
   ·分子建模系统第108页
   ·结构信息获取第108-109页
   ·模型搭建第109页
   ·配体准备第109-110页
   ·拮抗状态模型建立第110页
   ·模型合理性评价第110-111页
   ·分子对接结果与活性关系研究第111-114页
 2.结果与讨论第114-127页
   ·α1A-AR、α1B-AR、α1D-AR 序列第114页
   ·跨膜区预测第114-115页
   ·序列水平评估第115-117页
   ·初始模型建立第117-120页
   ·模型的评价第120-123页
   ·分子对接结果与活性关系研究结果第123-127页
 3.结论第127-128页
第五部分 高选择性的α1A-AR 拮抗剂的虚拟高通量筛选第128-144页
 1.实验部分第128-131页
   ·材料与仪器第128页
   ·受体分子结构处理第128-129页
   ·虚拟筛选策略第129页
   ·实验室现有的化合物库的虚拟筛选第129-130页
   ·ZINC 数据库的虚拟筛选第130-131页
 2.结果与讨论第131-143页
   ·虚拟筛选策略的制定第131页
   ·候选化合物的选取标准第131-132页
   ·实验室化合物库筛选结果第132-138页
   ·Zinc 数据库筛选结果第138-140页
   ·候选化合物与α1-AR 亚型的作用模式图形学考察第140-143页
 3.结论第143-144页
第六部分 全新亚型选择性α1A-AR 拮抗剂的设计第144-156页
 1.实验部分第144-150页
   ·配体分子的结合方式第144-146页
   ·组建模块的选择第146-148页
   ·模块的组装第148页
   ·对接计算第148-149页
   ·合成设计第149-150页
 2.结果与讨论第150-155页
   ·与α1A-AR 对接结果分析第150-151页
   ·与α1B-AR 对接结果分析第151-153页
   ·与α1D-AR 对接结果分析第153-154页
   ·初步合成设计第154-155页
 3.结论第155-156页
结论与展望第156-158页
参考文献第158-170页
附录:论文部分彩图第170-177页
博士期间发表文章第177-178页
致谢第178-179页

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