中文摘要 | 第1-9页 |
ABSTRACT | 第9-13页 |
实验室已有的化合物库 | 第13-21页 |
论文涉及到的简称及中英文对照 | 第21-23页 |
绪论 | 第23-37页 |
文献综述:α1A-受体拮抗剂的计算机辅助药物设计研究进展 | 第37-51页 |
1.引言 | 第37-40页 |
2.基于配体的药物设计方法 | 第40-47页 |
·药效团模型 | 第40-45页 |
·定量构效关系模型 | 第45-47页 |
3.基于结构的药物设计 | 第47-50页 |
4.结论 | 第50-51页 |
第一部分 α1A-AR 拮抗活性的分子生物学筛选 | 第51-69页 |
1.实验部分 | 第51-57页 |
·试剂和仪器 | 第51-52页 |
·细胞水平α1A-AR 拮抗剂筛选模型建立 | 第52-54页 |
·筛选条件的选择及优化 | 第54-55页 |
·筛选模型的评估 | 第55-57页 |
·实验室现有化合物的活性筛选 | 第57页 |
2.结果与讨论 | 第57-66页 |
·阴性细胞株的建立 | 第57-58页 |
·报告基因响应元件和筛选细胞株的选择 | 第58-60页 |
·Forskolin 的使用 | 第60-62页 |
·荧光素酶表达时间的确定 | 第62-63页 |
·溶剂及其浓度的影响 | 第63页 |
·模型的评估 | 第63-64页 |
·细胞株内源性干扰检测 | 第64页 |
·实验室现有化合物的高通量筛选结果 | 第64-66页 |
3.小结 | 第66-69页 |
第二部分 基于配体的芳基哌嗪类α1A-AR 拮抗剂药效团模型的建立 | 第69-83页 |
1.实验部分 | 第69-74页 |
·药效团模型的构建 | 第69-72页 |
·药效团模型预测能力研究 | 第72-74页 |
·药效团模型的数据库验证 | 第74页 |
2.结果与讨论 | 第74-81页 |
·α1A- AR 拮抗剂的分类 | 第74-75页 |
·药效团模型筛选 | 第75-80页 |
·药效团模型的预测能力评估 | 第80-81页 |
·药效团模型的数据库验证结果 | 第81页 |
3.小结 | 第81-83页 |
第三部分 基于α1A-AR 拮抗剂药效团模型的 CoMFA 和 CoMSIA 的研究的建立 | 第83-108页 |
1.实验部分 | 第83-87页 |
·化合物的选取 | 第83-85页 |
·分子构建 | 第85-86页 |
·分子叠合 | 第86页 |
·CoMFA 模型的建立 | 第86-87页 |
·CoMSIA 模型的建立 | 第87页 |
·模型的预测能力评估 | 第87页 |
2.结果和讨论 | 第87-107页 |
·化合物分子的叠合结果 | 第87-89页 |
·CoMFA 模型 | 第89-91页 |
·CoMSIA 模型 | 第91-94页 |
·CoMFA 模型与 CoMSIA 模型比较 | 第94-98页 |
·三维等势图分析 | 第98-102页 |
·实验室现有化合物的活性预测 | 第102-107页 |
3.结论 | 第107-108页 |
第四部分 α1-AR 分子亚型蛋白的同源模建 | 第108-128页 |
1.实验部分 | 第108-114页 |
·分子建模系统 | 第108页 |
·结构信息获取 | 第108-109页 |
·模型搭建 | 第109页 |
·配体准备 | 第109-110页 |
·拮抗状态模型建立 | 第110页 |
·模型合理性评价 | 第110-111页 |
·分子对接结果与活性关系研究 | 第111-114页 |
2.结果与讨论 | 第114-127页 |
·α1A-AR、α1B-AR、α1D-AR 序列 | 第114页 |
·跨膜区预测 | 第114-115页 |
·序列水平评估 | 第115-117页 |
·初始模型建立 | 第117-120页 |
·模型的评价 | 第120-123页 |
·分子对接结果与活性关系研究结果 | 第123-127页 |
3.结论 | 第127-128页 |
第五部分 高选择性的α1A-AR 拮抗剂的虚拟高通量筛选 | 第128-144页 |
1.实验部分 | 第128-131页 |
·材料与仪器 | 第128页 |
·受体分子结构处理 | 第128-129页 |
·虚拟筛选策略 | 第129页 |
·实验室现有的化合物库的虚拟筛选 | 第129-130页 |
·ZINC 数据库的虚拟筛选 | 第130-131页 |
2.结果与讨论 | 第131-143页 |
·虚拟筛选策略的制定 | 第131页 |
·候选化合物的选取标准 | 第131-132页 |
·实验室化合物库筛选结果 | 第132-138页 |
·Zinc 数据库筛选结果 | 第138-140页 |
·候选化合物与α1-AR 亚型的作用模式图形学考察 | 第140-143页 |
3.结论 | 第143-144页 |
第六部分 全新亚型选择性α1A-AR 拮抗剂的设计 | 第144-156页 |
1.实验部分 | 第144-150页 |
·配体分子的结合方式 | 第144-146页 |
·组建模块的选择 | 第146-148页 |
·模块的组装 | 第148页 |
·对接计算 | 第148-149页 |
·合成设计 | 第149-150页 |
2.结果与讨论 | 第150-155页 |
·与α1A-AR 对接结果分析 | 第150-151页 |
·与α1B-AR 对接结果分析 | 第151-153页 |
·与α1D-AR 对接结果分析 | 第153-154页 |
·初步合成设计 | 第154-155页 |
3.结论 | 第155-156页 |
结论与展望 | 第156-158页 |
参考文献 | 第158-170页 |
附录:论文部分彩图 | 第170-177页 |
博士期间发表文章 | 第177-178页 |
致谢 | 第178-179页 |