| 中文摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-14页 |
| ·microRNA 生物学背景 | 第9-12页 |
| ·核酸分子杂交 | 第12-13页 |
| ·本论文框架 | 第13-14页 |
| 第二章 microRNA 对人类管家基因和非管家基因的调控差异 | 第14-25页 |
| ·前言 | 第14-16页 |
| ·材料 | 第16-17页 |
| ·方法 | 第17-19页 |
| ·整合多种基于序列的预测方法识别 miRNA 靶基因 | 第17页 |
| ·基于序列和表达信息的联合分析预测 miRNA 靶基因 | 第17-18页 |
| ·3’UTR 区域的保守性分析 | 第18-19页 |
| ·结果 | 第19-22页 |
| ·管家基因上 miRNA 的调控密度显著高于非管家基因 | 第19-20页 |
| ·整合基于表达谱的方法证明 miRNA 对两类基因调控的密度差异... | 第20-21页 |
| ·管家基因 3’UTR 上的保守区域显著高于非管家基因 | 第21-22页 |
| ·讨论 | 第22-25页 |
| 第三章 ThermoMatch：基于热力学的全基因组水平预测寡核苷酸结合位点 | 第25-48页 |
| ·前言 | 第25-26页 |
| ·结合位点预测研究现状 | 第26-28页 |
| ·应用序列比对思路分析简介 | 第26-27页 |
| ·现有技术缺陷 | 第27-28页 |
| ·ThermoMatch 的设计 | 第28-36页 |
| ·最近邻法计算热力学稳定性 | 第29-32页 |
| ·预建热力学索引表为基础参考 | 第32-33页 |
| ·获取待搜索序列在热力学上稳定的结合序列列表 | 第33-34页 |
| ·在全基因组上对结合序列进行快速定位 | 第34-36页 |
| ·ThermoMatch 命令行版本的实现 | 第36-43页 |
| ·Ruby 语言简介 | 第36页 |
| ·ThermoMatch 的运行 | 第36-37页 |
| ·ThermoMatch 的结果展示 | 第37-43页 |
| ·同 Primer-BLAST 比较分析 | 第43-45页 |
| ·Primer-BLAST 简介 | 第43-44页 |
| ·ThermoMatch 与 Primer-BLAST 的分析结果 | 第44-45页 |
| ·讨论 | 第45-48页 |
| 全文结论 | 第48-49页 |
| 参考文献 | 第49-55页 |
| 附录 英文缩略词表 | 第55-56页 |
| 文献综述 | 第56-71页 |
| 参考文献 | 第67-71页 |
| 在学期间发表的论著 | 第71-77页 |
| 个人简历 | 第77-78页 |
| 攻读学位期间的研究成果 | 第78-79页 |
| 致谢 | 第79页 |
