| 摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-15页 |
| 第一章 前言 | 第15-26页 |
| ·细菌小RNA研究进展 | 第15-20页 |
| ·细菌小RNA的发现 | 第15页 |
| ·细菌小RNA的生物学功能 | 第15-18页 |
| ·细菌小RNA的作用机制 | 第18-19页 |
| ·细菌小RNA的鉴定方法 | 第19-20页 |
| ·与细菌的酸碱胁迫相关的细菌小RNA的研究概况 | 第20-23页 |
| ·黄单胞菌小RNA的研究概况 | 第23-25页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第25-26页 |
| 第二章 材料方法 | 第26-44页 |
| ·实验材料 | 第26-32页 |
| ·本研究所用的主要菌株和质粒 | 第26页 |
| ·本研究所用引物 | 第26-28页 |
| ·本研究所用的杂交探针 | 第28-29页 |
| ·本研究所用的抗生素 | 第29-30页 |
| ·本研究所使用的主要培养基 | 第30页 |
| ·菌株的培养和保存 | 第30-31页 |
| ·常用的试剂和缓冲液 | 第31-32页 |
| ·常用的试剂盒 | 第32页 |
| ·实验方法 | 第32-44页 |
| ·细菌总DNA的提取 | 第32页 |
| ·细菌总RNA的提取 | 第32-33页 |
| ·总RNA的消化 | 第33-34页 |
| ·小RNA的胶回收 | 第34页 |
| ·小RNA的Northern Blotting验证 | 第34-36页 |
| ·小RNA的RT-PCR验证 | 第36-38页 |
| ·小RNA缺失突变体或者过量表达株构建过程中所用的方法 | 第38-41页 |
| ·缺失突变体和过量表达株的胞外酶和胞外多糖的平板检测 | 第41-43页 |
| ·致病性实验 | 第43页 |
| ·HR实验 | 第43页 |
| ·对pH值耐受性的检测 | 第43页 |
| ·对各种金属离子耐受性的检测 | 第43页 |
| ·对SDS和NaCl的抗性检测 | 第43-44页 |
| 第三章 Xcc 8004中表达受酸碱影响的小RNA的全基因组鉴定 | 第44-59页 |
| ·在全基因组水平上鉴定表达受酸碱影响的小RNA的策略 | 第44页 |
| ·代表酸性和碱性培养条件的PH值、培养基及生长期的确定 | 第44-46页 |
| ·表达受酸碱影响的小RNA的鉴定 | 第46-59页 |
| ·Xcc 8004的培养及总RNA提取 | 第46-47页 |
| ·小分子RNA(50-200 nt和201-500 nt)的分离和纯化 | 第47页 |
| ·50-200 nt和201-500 nt RNA的Solexa测序cDNA库的构建 | 第47页 |
| ·Solexa测序及序列分析 | 第47-50页 |
| ·表达受酸碱影响的候选小RNA的确定 | 第50-53页 |
| ·表达受酸碱影响的候选小RNA的验证 | 第53-59页 |
| 第四章 表达受酸碱影响的小RNA的功能研究 | 第59-88页 |
| ·鉴定小RNA功能的策略 | 第59页 |
| ·小RNA缺失突变体构建 | 第59-66页 |
| ·小RNA缺失突变体构建策略 | 第60-61页 |
| ·小RNA缺失突变体构建过程 | 第61-66页 |
| ·小RNA过量表达株的构建 | 第66-71页 |
| ·小RNA过量表达株的构建策略 | 第66页 |
| ·小RNA缺失突变体构建过程 | 第66-71页 |
| ·小RNA缺失突变体和过量表达菌株的表型分析 | 第71-87页 |
| ·对酸碱的耐受能力检测 | 第71-73页 |
| ·对SDS及NaCl的耐受能力检测 | 第73-76页 |
| ·对重金属的耐受能力检测 | 第76-80页 |
| ·对寄主植物的致病力检测 | 第80-82页 |
| ·胞外酶和胞外多糖的检测 | 第82-85页 |
| ·对非寄主植物的HR反应能力检测 | 第85-87页 |
| ·小结 | 第87-88页 |
| 第五章 总结与讨论 | 第88-92页 |
| ·总结 | 第88-89页 |
| ·讨论 | 第89-91页 |
| ·后续工作 | 第91-92页 |
| 参考文献 | 第92-102页 |
| 附录 | 第102-103页 |
| 致谢 | 第103-104页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文目录 | 第104页 |
