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玉米产量相关性状QTL整合及候选基因挖掘

中文摘要第1-6页
Abstract第6-10页
1. 文献综述第10-25页
   ·玉米产量相关性状OTL研究概述第10-12页
     ·玉米产量相关性状OTL定位第10-11页
     ·基于连锁作图的QTL定位结果在应用方面存在的问题第11-12页
   ·OTL整合及QTL元分析第12-18页
     ·OTL整合第12-14页
     ·OTL元分析第14-17页
     ·Overview第17-18页
   ·基因表达分析及数字化基因表达谱第18-24页
     ·基因表达分析第18-20页
     ·数字化基因表达谱第20-22页
     ·穗发育相关研究进展第22-24页
   ·目的与意义第24-25页
2. 料与方法第25-36页
   ·技术路线第25页
   ·玉米产量相关性状OTL元分析第25-30页
     ·玉米产量相关性状的选择第26-28页
     ·玉米产量相关性状OTL整合第28-30页
   ·穗发育数字化表达谱分析第30-32页
     ·供试材料第30页
     ·试验方法第30-32页
   ·玉米产量及穗发育相关候选基因发掘第32-33页
     ·基于B73基因组序列的一致性QTL区域内候选基因发掘第32页
     ·基于比较定位挖掘候选基因第32-33页
     ·产量、穗部发育相关GEO数据整合及重要候选基因挖掘第33页
     ·结合穗发育DGE分析,筛选穗发育相关的重要候选基因第33页
   ·重要候选基因进行基因功能、蛋白质结构分析第33-36页
     ·基因功能、蛋白质结构分析第33页
     ·GO注释及功能富集分析第33-34页
     ·KEGG分析及Pathway富集分析第34-35页
     ·PPI分析第35-36页
3. 结果分析第36-62页
   ·玉米产量相关性状QTL元分析第36-43页
     ·玉米产量相关性状QTL信息收集第36页
     ·一致性图谱构建及玉米产量相关QTL映射第36-38页
     ·Overview分析和heatmap作图第38-39页
     ·QTL元分析及HotMQTL筛选第39-43页
   ·穗发育DGE分析及候选基因挖掘第43页
   ·玉米产量及穗部发育相关候选基因挖掘第43-44页
   ·候选基因结构与功能分析第44-55页
     ·候选基因亚细胞定位、信号肽预测、跨膜结构预测第44-45页
     ·蛋白质结构域预测第45-48页
     ·差异候选基因集GO注释及功能富集分析第48-50页
     ·差异候选基因集Pathway富集分析第50-54页
     ·差异候选基因集PPI分析第54-55页
   ·讨论第55-62页
     ·产量相关QTL元分析第55-57页
     ·QTL元分析的局限性及改进方法第57-58页
     ·连锁作图与关联分析第58-59页
     ·生物信息数据整合分析第59-61页
     ·今后研究方向第61-62页
4. 结论第62-64页
参考文献第64-70页
致谢第70-71页
附件第71-72页
附表第72-77页
附图第77-79页

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