| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-10页 |
| 第一章 背景简介 | 第10-17页 |
| ·研究背景 | 第10-14页 |
| ·方法概述 | 第14-17页 |
| ·分子动力学模拟方法的基本原理 | 第14-15页 |
| ·分子动力学模拟的基本过程 | 第15页 |
| ·MM/GBSA方法简介 | 第15-17页 |
| 第二章 补体受体CR2与配体C3d识别机制的研究 | 第17-30页 |
| ·引言 | 第17页 |
| ·理论与方法 | 第17-20页 |
| ·实验准备 | 第17-18页 |
| ·分子动力学模拟 | 第18页 |
| ·结合自由能计算及残基能量分解 | 第18页 |
| ·主成分分析 | 第18-19页 |
| ·动态相关矩阵 | 第19页 |
| ·聚类分析 | 第19页 |
| ·结构域之间角度的计算 | 第19-20页 |
| ·结果与讨论 | 第20-29页 |
| ·体系稳定性的监测 | 第20-22页 |
| ·结合自由能计算与热点残基识别 | 第22-25页 |
| ·补体受体CR2与配体C3d的相互作用特征 | 第25-28页 |
| ·补体受体CR2的SCR1与SCR2的相互作用特征 | 第28-29页 |
| ·结论 | 第29-30页 |
| 第三章 离子强度对C3d-CR2(SCR1-2)相互作用的影响 | 第30-42页 |
| ·引言 | 第30页 |
| ·理论与方法 | 第30-31页 |
| ·结果与讨论 | 第31-41页 |
| ·体系稳定性的监测 | 第31-32页 |
| ·离子浓度对结合自由能与热点残基的影响 | 第32-34页 |
| ·补体受体CR2与配体C3d的相互作用特征 | 第34-39页 |
| ·补体受体CR2的SCR1与SCR2的相互作用特征 | 第39-41页 |
| ·结论 | 第41-42页 |
| 第四章 pH对C3d-CR2(SCR1-2)相互作用的影响 | 第42-54页 |
| ·引言 | 第42页 |
| ·理论与方法 | 第42-44页 |
| ·结果与讨论 | 第44-53页 |
| ·体系稳定性的监测 | 第44-45页 |
| ·结合自由能与热点残基识别 | 第45-46页 |
| ·补体受体CR2与配体C3d的相互作用特征 | 第46-52页 |
| ·补体受体CR2的SCR1与SCR2的相互作用特征 | 第52-53页 |
| ·结论 | 第53-54页 |
| 第五章 低聚糖对C3d-CR2(SCR1-2)相互作用的影响 | 第54-63页 |
| ·引言 | 第54页 |
| ·理论与方法 | 第54页 |
| ·结果与讨论 | 第54-61页 |
| ·体系稳定性的监测 | 第54-56页 |
| ·结合自由能与热点残基识别 | 第56-57页 |
| ·糖化模型中C3d与CR2的相互作用特征 | 第57-60页 |
| ·补体受体CR2的SCR1与SCR2的相互作用特征 | 第60-61页 |
| ·结论 | 第61-63页 |
| 参考文献 | 第63-67页 |
| 附录 | 第67-75页 |
| 在学期间的研究成果 | 第75-76页 |
| 致谢 | 第76页 |
