新型杂合抗菌肽的设计、表达及其动力学模拟
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-18页 |
| ·抗菌肽的分类 | 第11-13页 |
| ·根据来源不同 | 第11-12页 |
| ·根据结构不同 | 第12-13页 |
| ·抗菌肽的抑（杀）菌机制 | 第13-15页 |
| ·膜结合型抗菌肽 | 第13-14页 |
| ·非膜结合型抗菌肽 | 第14-15页 |
| ·其它作用机制 | 第15页 |
| ·研究热点 | 第15-16页 |
| ·实验目的及研究内容 | 第16-18页 |
| ·实验目的 | 第16-17页 |
| ·实验研究内容 | 第17-18页 |
| 第二章 设计抗菌肽的结构及活性预测 | 第18-30页 |
| ·实验方法 | 第18-19页 |
| ·获取抗菌肽母本 | 第18页 |
| ·杂合原理 | 第18-19页 |
| ·生物信息学分析 | 第19页 |
| ·结果与分析 | 第19-28页 |
| ·杂合抗菌肽序列 | 第19-20页 |
| ·杂合抗菌肽的理化性质分析 | 第20页 |
| ·二级结构分析 | 第20-22页 |
| ·跨膜预测 | 第22-25页 |
| ·抗菌肽两亲性分析 | 第25-28页 |
| ·净电荷分析 | 第28页 |
| ·结论与讨论 | 第28-30页 |
| 第三章 杂合抗菌肽基因的合成 | 第30-41页 |
| ·实验材料 | 第30-32页 |
| ·菌种 | 第30页 |
| ·质粒 | 第30页 |
| ·仪器及药品 | 第30-31页 |
| ·大肠杆菌培养基 | 第31-32页 |
| ·一般试剂的配置 | 第32页 |
| ·实验方法 | 第32-36页 |
| ·设计引物 | 第32页 |
| ·基因克隆简要步骤 | 第32-33页 |
| ·基因克隆 | 第33页 |
| ·2％琼脂糖凝胶电泳 | 第33-34页 |
| ·CaCl_2法制备感受态细菌 | 第34页 |
| ·转化 | 第34-35页 |
| ·阳性菌的筛选 | 第35页 |
| ·质粒提取 | 第35页 |
| ·双酶切 | 第35-36页 |
| ·引物合成及基因测序 | 第36页 |
| ·结果与分析 | 第36-39页 |
| ·引物设计 | 第36页 |
| ·重叠 PC R 扩增 | 第36-38页 |
| ·阳性菌的筛选及验证 | 第38-39页 |
| ·结论与讨论 | 第39-41页 |
| 第四章 重组菌的构建及抗菌肽的表达 | 第41-52页 |
| ·实验材料 | 第41-43页 |
| ·菌株 | 第41页 |
| ·质粒 | 第41页 |
| ·仪器和药品 | 第41-42页 |
| ·主要试剂的配置方法 | 第42-43页 |
| ·电泳胶配方 | 第43页 |
| ·实验方法 | 第43-45页 |
| ·重组菌的构建 | 第43-44页 |
| ·基因工程菌的诱导表达 | 第44页 |
| ·重组蛋白的鉴定 | 第44页 |
| ·抑菌实验 | 第44-45页 |
| ·结果与分析 | 第45-49页 |
| ·重组菌的筛选与鉴定 | 第45-46页 |
| ·重组蛋白的鉴定 | 第46-48页 |
| ·抗菌肽抑菌实验 | 第48-49页 |
| ·结论与讨论 | 第49-52页 |
| ·重组菌的构建 | 第49页 |
| ·表达载体 pET11a | 第49-50页 |
| ·小分子蛋白电泳 | 第50页 |
| ·重组蛋白的诱导表达 | 第50页 |
| ·杂合抗菌肽的表达策略 | 第50-52页 |
| 第五章 抗菌肽的动力学模拟 | 第52-63页 |
| ·材料 | 第52页 |
| ·方法 | 第52-55页 |
| ·处理 p bd 文件 | 第52-53页 |
| ·规定盒子大小及溶剂 | 第53页 |
| ·添加离子 | 第53-54页 |
| ·能量最小化 | 第54页 |
| ·平衡 | 第54页 |
| ·MD | 第54-55页 |
| ·数据分析 | 第55页 |
| ·结果 | 第55-61页 |
| ·em_potential | 第55-56页 |
| ·md_temperature | 第56页 |
| ·md_pressure | 第56-57页 |
| ·md_density | 第57页 |
| ·md_potential | 第57-58页 |
| ·RMSD | 第58-59页 |
| ·RMSF | 第59页 |
| ·运动模拟及其抑菌机制推测 | 第59-61页 |
| ·结论与讨论 | 第61-63页 |
| 第六章 结论与展望 | 第63-64页 |
| ·结论 | 第63页 |
| ·展望 | 第63-64页 |
| 参考文献 | 第64-72页 |
| 发表论文和参加科研情况说明 | 第72-73页 |
| 致谢 | 第73页 |
